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Research
General Information
ZIRC
ZFIN ID: ZDB-PUB-980408-10
Characterization of a cDNA encoding a novel band 4.1-like protein in zebrafish
Kelly, G.M. and Reversade, B.
Date: 1997
Source: Biochemistry and cell biology = Biochimie et biologie cellulaire   75: 623-632 (Journal)
Registered Authors: Kelly, Greg, REVERSADE, Bruno
Keywords: Danio; cytoskeletal plasma membrane; interactions; protein 4.1; beta-actin
MeSH Terms:
  • Actins/genetics
  • Amino Acid Sequence
  • Animals
  • Base Sequence
  • Basic Helix-Loop-Helix Leucine Zipper Transcription Factors
  • Basic-Leucine Zipper Transcription Factors
  • Calcium/physiology
  • Calmodulin/metabolism
  • Cloning, Molecular
  • Cytoskeletal Proteins*
  • DNA, Complementary/genetics*
  • DNA-Binding Proteins/genetics
  • Gene Expression Regulation, Developmental
  • Membrane Proteins/chemistry
  • Membrane Proteins/genetics*
  • Membrane Proteins/metabolism
  • Molecular Sequence Data
  • Molecular Weight
  • Neuropeptides*
  • Organ Specificity
  • RNA, Messenger/analysis
  • Sequence Analysis, DNA
  • Sequence Homology, Amino Acid
  • Transcription Factors*
  • Zebrafish/embryology
  • Zebrafish/genetics*
  • Zebrafish Proteins*
PubMed: 9551184 Full text @ Biochem. Cell Biol.
ABSTRACT

Membrane skeleton protein 4.1 and other members of a family of proteins that link the cytoskeleton to the plasma membrane may play an integral role in cell communication during development. The polymerase chain reaction and degenerate oligodeoxynucleotide primers to consensus sequences in the putative membrane-binding domain of the protein 4.1 superfamily were used to isolate cDNAs encoding members of the zebrafish protein 4.1 family. Zebrafish stage- and tissue-specific first strand cDNA was used in the PCR. After the reaction, amplicons of the predicted size were sequenced to confirm their relationship to the protein 4.1 superfamily. One cDNA, with a high degree of similarity to a mouse novel band 4.1-like cDNA, was used to probe a zebrafish adult brain library. A 2.4-kb cDNA was isolated and found to encode a 619 amino acid polypeptide homologous to mouse novel band 4.1-like protein 4. Zebrafish nbl4 mRNA is maternally supplied and is expressed throughout embryogenesis. In adults, nbl4 is found in the ovary, eye, heart, and brain, but not in gut or skeletal muscle. When synthetic nbl4 mRNA is translated in vitro it binds calmodulin in a calcium-dependent manner. These data indicate that zebrafish nbl4 is a maternal transcript owing to its presence before the midblastula transition, and it is present later on in specific adult structures. The ability to bind calmodulin would suggest that the function of nbl4 protein may be potentially regulated via a calcium-calmodulin dependent mechanism.


La protéine de la bande 4.1 du squelette membranaire et d'autres membres d'une famille de protéines reliant le cytosquelette à la membrane plasmique joueraient un rôle dans les communications cellulaires au cours du développement. Des ADNc codant des membres de la famille des protéines de la bande 4.1 de poisson-zèbre ont été isolés à l'aide de l'amplification en chaîne par polymérase et d'amorces oligodésoxynucléotidiques dirigées contre des séquences consensus dans le domaine de liaison à la membrane des protéines de la bande 4.1. Des ADNc spécifiques de tissus ou de stades de développement du poisson-zèbre ont été utilisés pour l'amplification en chaîne par polymérase. Après la réaction, des amplicons de la dimension prédite ont été séquencés afin de confirmer leur parenté avec la famille des protéines de la bande 4.1. Un ADNc ayant une forte similarité à un ADNc de la protéine nbl4 de souris semblable aux protéines de la bande 4.1 a été utilisé comme sonde pour effectuer une recherche dans une banque de cerveau de poisson-zèbre adulte. Un ADNc de 2,4 kb codant une protéine de 619 acides aminés homologue à la protéine nbl4 de souris a été isolé. L'ARNm nbl4 du poisson-zèbre est d'origine maternelle et est exprimé pendant toute l'embryogenèse. Chez les adultes, nbl4 se trouve dans les ovaires, les yeux, le coeur et le cerveau, mais pas dans le tube digestif ou les muscles squelettiques. Lorsqu'un ARNm nbl4 synthétique est traduit in vitro, il lie la calmoduline de façon calcium-dépendante. Ces résultats indiquent que l'ARNm nbl4 du poisson-zèbre est un transcrit maternel, car il est présent avant la transition se produisant au milieu du stade blastula. Plus tard, il est également présent dans des structures adultes spécifiques. La capacité de lier la calmoduline suggère que la fonction de la protéine nbl4 serait réglée par un mécanisme dépendant du calcium.

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