Genomic Feature

imb5

ID
ZDB-ALT-210827-1
Name
imb5
Synonyms
None
Affected Genomic Region
Construct
None
Type
Allele with one deletion (1)
Protocol
embryos treated with
Lab of Origin
Dunn Lab
Current Source
Other Pages
Notes
No data available
Genome Browser
Variants
Variant Type
Small Deletion
Variant Location
Chr 1: 58296087 - 58314908 (GRCz11) (1) Details
Nucleotide change
ACAAAACCGTAGTTTGATGATGCAATGAGAATGTGGACGAACTGGAAGTTGTCATTATTGGAGTGTCATCTTTGATCTAATTGATGAGGTAATGTATGTAAGATTTATTATCATCATAATATGAAGCAGGGTAAGGCTGAAAGCCATCGAAGCAAAACATATATATAATAGCAACAAATAATAGCAAATCCTTTCATTTATATGGGCGCCTAAATCACTTTACACATAGGGGGGAATCTCTTCATACACCACCAGTGTGCAGCATCCACCTGGATGACGCGATGGCAGCCATTTTGTGCCAGACCACAAACCTCTGATTGGTGGAGAGGAGACAGGATTATGATATGGGGGTGGTCAGGAGGCCATGATGGACAGAGGCCATTGGGCAGATTTGGCCAGGATGCCGGGGTTAAACCCCTACTCTTTTTTGAAAGACATCCTGGGATTTTTAATGACCACAGAGAGTCAGGACCTCGGTTTAACGTCTCATGCGAAAGACGGCGCTCACAGAGCAGTATAGAGTACCCGTCACTATACTGGGGCATTAGGACCCACACAGATCGCAAGTTGGGCACCCCCTGCTGGCCTCACTAGCACTTCCGGCAGCAACCTAGCTTTCCCATGTGGTCTCCCATCCAGGTACTGACCAGGCGCATCCCTGCTTAGCTTCAGTGGGCGACCATGTGAGAGCAAGCTGCCAGCTATGATGAGTGTGACATGCACAGAATAGCAAATCAGGAACTGACATTTGTAATATTTCAGTACTTTTAAAAACCCTTGTTTACTTTTTCTTGCATACTTAATTAAGCATTAATCATTTGTGGTTGATGTTTGTCTTCATAGTTTGGACCACAAAGAGACTTTTAGGATTACACCTGGTATGAGAAAATGTAGGTCTTTTCTATTTTACTAATATTTAAATTTACACACACTCGCCTCTCTGAAAGTGTCCCTTATCTACTGCTTGTTCAGATGCCTGTGATCTCACACTGGATCCAAACACAGCACACACTCAACTCATCCTGTCTGAGGGGAACAGAAAGGTGATCCGAGTGAACGATCATCAGCCGTATCCTGATCATCCAGACAGGTTTGCTGATATTCCTCAGATTCTGTGTAGAGAGACTCTGACTGGACGCTGTTACTGGGAGGCTGAATGGGAAACCTGGACTCGTATAGCAATGGCCTATAGAGGAATCAGCAGAAAAGTAGGAAGTGACTGTTGTTTTGGATACAATGAAAAATCTTGGAGTCTTTTCTGCACTGCTAATGGATTCCATGTCTGGCACAATAATAAGAGCATTGATATATCAGCTCCTTCTTCAGCTAAAAGAGTTGGAGTGTATGTGGATGTGCCAGCTGGCTCTCTGTCCTTCTACAGTGTCTCTGACACACACACACTCACACACTTACACACATTCAACACCACATTCACTGAAGACCTCTATGCTGGATTTATGGTTTTTGACTCCTCAGTGTCTTTGTGTCAGAGAGAACAAATGAAACTCTACAACAGAAAAGATTGATTTTCTGACTTAATGCAATAGTCTGTAGTAAAACTCTGGGCTCTGCGTTTGATGTGATCTTATAAAAGCTCCAGTTGATGTCATCACTAATGTTTACATTTGCATCTACAGTGCTGCTTAAAAATTTGTGAAGCTCTTTCAGGATCGAAAGAAATGCTAACAATTTTCTAAAAATAAGAAAGATCATACACAATGCATATTATTTTTATGTTTAGAATTATTTACAAAAGACGTTTACATATAGTCCACAACACAGAGTTTGTAAACCCTTGGCTTTTGTTAGAGTGTATTTTCCTGGCTGTTTTTTCTTGTTCTGGTGGTTTGTTAGTGCATGCCTTTTTTGCCAATTAAGTGTTATAAACAGAACTGAGCAGCATTGCTGTGTTTCCTTTCTGAATGAATATTTTGAGTGAGTGGATATTCAATTGAATCAATTTATCTTTATTTGTATAGTGCTTTTACAAGAGGGGTTTATTTATGAACTAAGAGTATCACGTGCTTATGATCAACATGGCTGGCACCACATTAGCTCCATAATATGCCCTATTAGATGATTACAGATGCATTATAAATAACCAGAGCTTTTCACTCCAGTTATCTGCGTCTTGAAGTACCCCCCCCCCCCCCCCATTCCACCCCTACTTCCCACTCTTTTTCCAATAGGGCAAAACGGCGGCCCAGTTGCTAGCAATGTTGCCTCACAGCTGGTCCAACCTCCTATCGGGCCAGTTGGCATTTCTGTGTGAAGTTTACATGTTCTCCCTGTGTTCACCATAGCCAATCAACTAAACCCAATTATCCCTGCTGAAAAATCCAGCTTAAATTCAACTGGTTTTAACTGGTCGACCAGGCTGGTTTTAGAGGGGTTTTGGCCATTTCCAGGCTGGTTTCCAGCCATTTCCAGCCTAGTCTTAGCTGGTCAGGCTGGAAGATGACCAGCTAAATCCAGCTAAAACCAGCTTGACCAGCCTGTTTTAAGCTTTACATAGCTGGTTTTAGCTGGGCTCCCAGCTTGGCTAGGCTGGTTAAGCTGGTTTTAGCTGGTCATCTCCCAGCCTGACCAGCAAAGACCAGGCTGGACATGGCTGGAAACCAGCTTGGAAGTGGCCAAAATCCCAGCCAAAAGACCAGCTAAAACCAGCCAACCAGCCTAGGCTGGTTTAACCTAGATTTTTCAGCAGGGATCACCGAAGACAACCTTAGTTTACACTTCTTACACGGCGACAAGCAGGGGAGTTCTCGAGACCTACCAGAGCTCAAACTCTCGCCCTCTCGCCCTTCTAACGGGAGGGAGCCCCGGGCCCGAGGATATTACGAGCTCAAGTCTCTCTCCCAGGACAGCATGCCAATTACGCTTTATTGATTATCAGCTAAGTGTGAACTCTTGAATGTAGATTGTGTCAAAGCACCTTCACATAGAAGATTATAGTGAATTGAAACGGTGTCAGTTTTTTTTTATTTTTATAAAGTGCTGATAAATAAATAATACATGTATTTGTTAATTAATAAAGGTTTAAATGAGCATTTCATACAAACATTTAAGAGAAAATGTCAGACTGGTGGGCCTTCAAAAAGTGGGTCCCAAAGTGGAAAAAGTTGAGAACCCTTGCCCTAAACAAACAAGACTTTGTGTGAATGTGTGGTTTATGTATAGTCCAAGTAATCATTCAGTGATGAACTTCAGCTGTGTATGTGTCAGTGTCCAGATAACTGTCAGCTGTGGCAGGAGTGATCGGAGCAATGAAACCGAAACCGCATGCTTCCATACTATATAGTACGCTCAAATCAGTATGCGAGCCGAGTAGTATGTCCGAATTCATAGAATTTGAAAATCACTATGCGAGAACTACCAGGTTGGCTTACTACTTCCAGCGAGATTCTGGAGTGTGCATCCCATGCATGCTGCGCTATCCCATGATGCCCGGCGAGAGAATTCATGAATGGAAGTGAAGCAATGCAACTGACACAGATAGGTCACATGACCATGACAAAATGGCGAATGTAGTACGTCCGAATTCGATTCATACTTTTCACATTCATACTGTATAGAATGCACTTTTCTAACGGCCGAGTAGTACGCTTAAATTCAAATGCAGTACCTACTGAGTGGTAGGCAGTTTCGGACACAGCCAATGACTTCTAGTCGTATACTGCATCCTAATTTGCATACATATACTACGCCCTAAAAGTATGTAATTTTTTGTAAAGGAATAGTTTACACTTTAAAGAGTGCAACAGAAGAGTATGCAAGCTTTGGGACATACTACTTCCTTAATAGATCGCTGTGTTACTTAGTTATACCCCCTGTCAATCATCCACACGTAATCCACATTTCTGTCGTATTTCATTTCTTCCATTCAGGGGTCTTTTATGCAGAGAAATCTCCTCAAGGCTTTGGGTAATTCTGCATTCAGACATTCAGACGTCCAAACGCGTTTTTATAGAACTTCAGTATTTTTGTTGCAGATGAAATATAACACAGATAATGCGATTTAAATATGGTCCAGTGGGCTAGATATTGACTGACAGTCATTCAAACATCTTTACCGAAGGCTCTCTACTTGACGGTTGGTCTCGCGCGTCCATCATGTTTGTAGTTTGTTTACACTTTGTACACATGTTTGTAGTTCTAATCGAATTCGCGTCCAATGCGCAATGTATTGTGGGCAATATCAGCAGTTATTACGCCTCTACACTTAACATTTTTACCAGAACTAGCAAACCATCCGGGAACCTCTGGCATACTCTTTTCAACATACTATGGTTTGAGACATACTAATTCTATTTTTAAATACTATTTAGGACGCATAGTATGCGGATTGGGACGCAGCACTAGTTTGGTTCATTGGCAGAAAATGCAACTGCCAGACTGCTTGTGATCATAACTGATTCAACGCTACCTACTACTGGATAAACATCAATATTGATCCTGAATCATTATTCCTTTTTGAAAATGTAATCCATACCTAACCCCCAGGGCTGAATTGTTTTTAAAGTACTATTTTTTTTGCTGATAGTATTATTATTATAATTTTTTTTAAATAATATGTATTATCAAATTTTCTACTATTTGTTTAATATTTGCTTGGTATATTTTTTTTCTAATGTATAAAAGAAGGCCTACAACCCTTAATGTTAATGTTACATTAATTTGTTACGATAACGTAACCCAATAATTAAAACCAAATTTAACAAATTCATTTTCATCGATTTATAACAAAATCCTGCATTACAACATCTACTGATGTTTTGATATGGAAAATAACGAACAGAACATGCCACCTATAGGTAACTGTATGAGCAAAGTAATGTGCGCGTCATAACTAAATTGCTTCAAAGGCTCTCAAAAAAGGAATGCACAGAGGACTGCATGAATGCGTTCTCTAAGGAAATACTGCATTACAACAACATCTGATATTTTGTTTTGCTAATATGACCCAACCCCTAACCAAAAACCCAAACCATAGCTGTAAA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Variant Notes
150 bp deletion in exon 2, p.S17Rfs58X.
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
DNA/cDNA Change
None
Transcript Consequence
None
Protein Consequence
None
Sequences
Flanking Sequence
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