Transcript

tbr1b-201

ID
ZDB-TSCRIPT-110325-1041
Name
tbr1b-201 Nomenclature History
Previous Names
  • tbr1-001
  • tbr1b-001
Transcript Type
mRNA
Annotation Status
Annotation Method
Ensembl
Associated With Genes
Strain
TU
Non Reference Strain
Genome Resources
RNA Central
None
Note
None
Sequence
ENSDART00000006612 (1) [ Show ] (double-click sequence to select) [Download]
>tpe|ENSDART00000006612.7|gene_biotype:protein_coding|ENSDARG00000004712.9 transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:tbr1b cdna chromosome:GRCz11:9:51427826:51436377:-1
ATGCAGCTCGAGCGTTGCATCTCGCCAGCTCTCGCGCGCT
CCAAGAAATGTATGATTGTGGGCAGTGGCTACCCAAACGC
ACAAGCGTCTGAGCTCGCCTTGCAGGACTACCCTATTATA
TCAATCGGCGACAACCTGGAGAGAAGTTCACCTCTGAAAA
AAAACTCCGCTGGGATGACGAATCAGTCAGAGGCAGACAA
TTTCGCCGACTCGAAGGACTCATCAGGGGACGTCCAGCGA
GGCAAACTCTCTCCTGATCTTGACGGAGTCGCCGACAGTC
GTCACACTTTCGATGGATCTGCAGGAGAAAGGTATCTCCT
GTCTCAGTCCAGTCAAGTTCAGCCGAGTCCTACCACCATG
TTTCCCTACCCGAGTCAGCATGGACCGACGCACCCGGCTT
TCTCCATCGCCAGCCCGAGCCGCTACATGGCGCACCACCC
GGTCATCACGAACGGAGCCTACAACAGCCTATTGAGCAAC
TCTTCTCCGCAAGGTTACGCGACCGCCGGGTACCCGTACG
CGCAACAGTATGGACACGCGTACCAGGGCACGGCTTTCTA
CCAGTTTTCCTCCGCGCAAGCAGGACTCGTGCCCGGCAAA
GCGCAGGTTTACCTCTGCAACAGGGCCCTGTGGCTTAAAT
TCCACAGGCATCAAACGGAGATGATTATTACCAAGCAGGG
ACGACGAATGTTCCCGTTTTTGAGTTTCAATATATCTGGT
CTCGACCCAACGGCGCATTACAATATCTTTGTGGACGTGA
TTCTTGCTGATCCGAATCACTGGCGCTTTCAAGGAGGAAA
ATGGGTCCCGTGCGGCAAAGCGGATACGAATGTAACAGGG
AACAGAGTGTACATGCACCCGGATTCGCCAAACACCGGCG
CGCACTGGATGCGTCAAGAGATTTCCTTTGGAAAACTTAA
GCTAACCAACAATAAAGGAGCAACCAACAACACAGGACAG
ATGGTCGTCCTGCAGTCGCTGCATAAATACCAGCCTCGAC
TGCATGTGGTGCAGGTGAACGAGGACGGAACGGAGGACAC
GAGCCAACCCGGGCGCGTGCAGACCTTCACTTTCCCCGAG
ACGCAGTTCATTGCTGTCACCGCATATCAAAACACTGATA
TCACGCAGCTAAAAATCGACCACAACCCATTCGCGAAAGG
ATTCCGTGACAATTATGACACTGTCTACACAGGCTGCGAC
ATCGATCGGTTGACGCCGTCCCCGGGTGACTCTCCGCGCT
CTCAGATCATGCCTAGCGCAAGATATGCCATGACTGGTTC
TTTCCTGCAGGACCAATTTGTCAGCTCGTATGCCAAGTCC
CGCTTTCACCCTGGCGTCGGAGGCGCTCCTGGCACGGACC
GCAGCGTCCCACTTAGTAACAGCTTGCTCTCCCCGCAACA
AACCGAGGAGACCACGGTGGCCTCCCCGCAGCGATGGTTT
GTCACCCCTGCCAACAACCGACTGGACTTTGCCGCCTCGG
CATACGATGCTGCTGCGGCTGCTGATTTCGCCGGTAACGC
GGCCACCCTTCTGTCGTACGCAGCTGCCGGAGTTAAAGCG
CTGCCCCTGCCCGGTGCGGGATGCTCCAACAGACCTCTGG
GGTATTACGGCGAGCCGCCGGGGTGGGGCACCCGCACACC
ACCGCAATATTGCAGTAAATCCAGCTCTGTTCTGTCTTGC
TGGCCGTCCAACTCCGTAGGGAGCAGAACGACCGCCTCAA
GCTACCTGGTCCCGGGACTAGAGGACGGAGACCCCATTGC
GCCCGAGAGGTCACCGCTAGGCGGGGCGGATGAGTCCAAA
CCTAAAGACCTGTCTGAATCCAGCTGGATAGAAACCCCGT
CCTCAATTAAGTCGATCGATTCGAGCGATTCTGGGATTTT
TGAGCAAGCCAAGCGGAGGAGGATTTCGCCATCTGCCACG
CCGGTTTCCGAGACGTCGTCTCCATTAAAATCTGAAATGT
TGACGCCGAGGGAATGCGAGAAAAACTGCTCCAAGGACAT
CGGCTACTACAGCTTTTACCCCCACAGTTAGAAAACTCGG
ACCGACTAATGCATGGCTTGTGTGTTCAAGGATTCACAAA
AGTGACTTATAATCTATTTATGTCCTGCTATTTATTTATT
TGTTTATTTATTTGCTCTTATATCCGGTCGCGTCGTTCTA
AGGACGCCACGCGTCGAGTTTTAACGGAAAAAAACGGACA
CTTGATCAAATATGTACGCGGTTTTCGTAACCAAATGACA
TTTTAAGGTTTTAACTGTCAAACCTATTGTAAGTATGAAA
GTACTGTACATAATTGTATTTATCTATTCATTTGTGATTC
TTCTCGTTGAATGTTGATGTATAATATAGAAAACCTAATT
AGGTTTATGTTAAATGTACTTAGAAAACGTACTTACGTTC
GTTAGTTCGAATAGCTACATATATTAAATATTTTGATGTC
TGAAAAAATAAGGATACATCTCGTATAGGTTCCAGTTGTG
ATGACAAAAACGATACGACTGAATTGGAAGTAGCTGCTAA
TCCGTTGAAAAGCCCGCCAAAAAGAGTTCCTCTGACAGGA
AAAATGGCGGACGCATGTCTGTCAGAGGTTGATTTTATGT
GAGCTTATATTGATGTTGCTTTTAGAGTCGCGTCGTTTGT
TCGTAAATATCATAGTCCGTAGTTTCATTTTGTGAACCTT
GTTGAAATGTTTTTAACCACACCAGCGTAAAATCATTTAT
CCCATTACCTTTTTTTTGTAGAGATAAAAACATAGACAAC
CATTCCACGTATTAACAACCCAGGCATTTCATTTGTATTT
CATGGGTTGTTTTCTCATGAGGAAAATCGCGAGTTAGGCC
TGCTAATGTGTAAAGCTAATGTAATTTGTGGTGTGCTTAC
TTGCAATAAATGTGACAGAATGTGAAACCCCGGGCAAAGT
ACACAAGCTTCAAGCTAAGCTGATTTCAAAACCAAATATT
TGTACCATTTTCTCTACCTGTTCTTGAGGTATATTGAAAC
GCCAGTCACAATGTGAATTCCGTTTCCTGTTCGATGCATT
TTCATAATAAAATGTAGTCATGCAATGCAACAATTAAGAT
AATCGCCCAGAACAAACTCTTTGGTAGTTCTCTACAATTT
ATAGATGGATTTTTTACTGCAATTTATAGAAGCCCAAAAG
GTAAACAGTAGTGTTAATAACAAAATAACAGACCAGATAC
ATTTAGATAATGAGATTTAAGTGAATATATATGGGCACAT
TTTGGTTGTCAAATATAGGCGGTGTGAGCATTACACCTGT
GATTTTATATGGTCCATTTCAGGGCAAATTTAATTGGATT
TTAAACCCATTCATGACCTGGATTTTAAAAAAACAGACCA
ATGTTTATGTTTTTAAGGCCTTTTGAATTAGGGTTTAGAT
ATTGTAGTGACCTGATTCATTAAAACTCTGCTGTAAACAC
CTTCATAAGCAATTTTGAATGCATCCACAATAAACCCCAC
CACCGCTTGGGTAATATTAATTACAGAAAGTTAAAGGCAG
TTCAGTTAATTTGTTAGTATGGTTGATATTTTAATGTAGT
GCAATTACATTGTTTTAGGTTTGACTTGCATCTAGATATT
ATTATTGCACAATCTAAAACATGACAATATTTTATCAATC
ATGATAAGAGGTCAATATGATAAACATTTCTGTTTTTTTT
TTTTTCAGTTATTTAAGCTCGTTTACATCCACATGCAACC
TTCATATGTATGTAAATGAGCGGTATGCTATTATTAAACA
GGCAGACTGAATCAACTGAGACCATTTACAATTTCTATTT
TTTTCACAGTGTCTGAAGGTTGAATAGATTCATAAAAAAT
CCATTACATCTGTGACTCTTAATCTTGGTCCTGGAGTTTT
GCACATTATCTGAGGCTTCCTTTACTGAATATTAAATATC
ATGCTGTCAGAAAAGCCACACATTTTAGTCTTAGGATTGA
GATCCTTTGTATTTTGATCTTATTAAATATTCTTACAGTA
ACTCCAAGACCTGAACTGTCTGATCATACACACTGAGCAG
TCATTGAGTAAATTGCATCAAGCTACTCTTGCCTTTTTTA
TTTGATCTGGCATGCAGAAATAGTCAGTAGTGCGGCAGTC
TCATTTTCTCATTTCAGATATTTTTATCTTTTTATATATA
TATAGTAGTCAACATTTGTAATGCATCAAAACCTTTCATC
AAAGTTGTCCTAAATCTATTGATCAACACCCATTTTTTTC
GTTGGATGATTTTAAAAATCTTTTGATCCACTTCAAATGT
TGACTGCTGTATATTTATATATTTCTGATGGTTTGCTGCC
TCCCTGTGGTTCATTGATAGGCTCTAAAAGTACAAAAGGC
AGTCTTATAAATGCGATATTTTAGATTTCTTGTATATAAT
TATGAGATTGGCATACCGATATTTATTTTATCTTATTTAT
GTATAATAAAAAAGACGTCAGAGGAAAAAAGTCGGGATGG
TCAATGAATCACATTAGACCTGTAAACGCCTGACACTGCA
TTGCAAGCTTGGGAACACTAGATGGCGACAGCGTCGTAGT
GATGAAATCCAATAGTCTTTTAGCATTCATTTTTGCAAGA
TTTTTGTGTATTTTCACAGCAAAGCAATGGCATATTGAAA
AAAAAGTTGAAATTTTATACCGCAAAATAAATAAAGATAA
ATAAAAATGTCCCTGTAAAATCTTGGAAGGACTGACCATT
ATAATAATTGTACGCTCTTCATTCAATCATTATTTTTTCT
TCTGCATACTCTCTTATTTATTAGGGATCACCACAGGGGA
ATGAACCACCAACTATTCTGGTATATGTTTTACACTGCGA
ATGCCCTCCAACCACAACCCAGTACTGGGAAACTCCCATA
CACTCTCACATTCACACATACAGTCATACACTATGACCAT
TTTAGTTAATCCAATGTGCCTATAGCGCATGAAAACACGA
CAGTGGGGGAAACCGGAGCACCCAGAGGAAACCCACGCCA
ACACGGGGAGAACATGCAAACTCCACACATAAATGCCTAC
TTGCCCAGCCGAGACTTGAACCAGTGACCTTCTTACTGTG
AGGTGACAGTGCTAACCACTGAGCCACCGTGCCACCCATG
CGCTATGCATATCGTACATTAATATTTTTCAATATAAGAA
TATTTTAATAGCTGAATCATGTGAAATATATGTCATTATG
CAGTGCCAAATTTACAGCAGACCAAAAAGCATTCGGACAA
TTAGAACTTATTAACAGTTTACAGCATTTGATTAAATAAG
CCAAATAAGTGGCATTAAAAAAGTCAGTAAAGTGGTAAAG
TATTTGAGATTTGTATCTGCTAAGATAATGCAATCCAGAC
TTGTTAAATACTATGCTAGATAAAATATTTTACAAATACA
ATCTGCGTATGTAAATCAGCTACTGCTAATTTCAGAATTG
AATTAAATGTTTGACTTAACTTGTCCGTCTTAAATTACTT
TAAAGATGGGTCAAAAGTTTTTAATTTCAGGTGAACAAAT
AAGTTGACTTGTAGCTCATAATATGGAACCACTGATTGTA
ACACAGTCATTGTAATAAACATAACATTGGGTGAATAAGT
CACATAAATATGCAACATCTTGTGATTTAGATCAGATATA
GGGGAGAGCAGGGGTAACACATTTTGGTTTTGGCCAAATA
ATAAACAAAGTAATGGGGTTAGAGCAGGGGTGTCCAAACT
CGGTCCTGGAGGGCCGGTGTCCTGGAGAGTTTACCTCCAA
CTTGCTTCAACACACCTGCCAGGAAGTTTCTAGTATATCT
AGTGAAAGCTTGATTAGATGGTTTAGCTGTGTTTGATTAG
GGTTGGAGCTAAACTCTCCAGGACACCGGCCCTCCAAGAC
CGAGTTTGGACACCCCTGGGTTAGACAAACCCTATTTTTT
TTACCAACAAAACACAAGGCTCTTCTAAAAATGAGCACTG
AAATTATGATACTTTCTTTGCAGTATTGCCAAAAGTGCCA
GGAGTAAAAATATTTACCCCACCTATAAGGCAAGTTGCAG
ACAGAGGGTTAGTTGTAACACATGCTTTTAAAGTCAGATT
TCACACAATTAATTTAATTTCAGTTTACTTTTAATATTAG
CCATAATCCCACAACATTTAGCTTAATTTATGTTTTATTC
TACACAGCACCG

OTTDART00000047980 (1) [ Show ] (double-click sequence to select) [Download]
>tpe|OTTDART00000047980|OTTDARG00000034010|ZDB-GENE-000323-1 tbr1b|OTTDARP00000037646 tbr1-001 LG_ CU651665.6 Danio rerio protein_coding KNOWN, 3855 bp
GCTGTCTTGCACAAAGTAGCTCGAACCGCAGGAAGGCGTT
AGTTTTCTCTCGCGCTCGCGTTAATTGCTATTTGTCATCG
AGAGATGCAGCTCGAGCGTTGCATCTCGCCAGCTCTCGCG
CGCTCCAAGAAATGTATGATTGTGGGCAGTGGCTACCCAA
ACGCACAAGCGTCTGAGCTCGCCTTGCAGGACTACCCTAT
TATATCAATCGGCGACAACCTGGAGAGAAGTTCACCTCTG
AAAAAAAACTCCGCTGGGATGACGAATCAGTCAGAGGCAG
ACAATTTCGCCGACTCGAAGGACTCATCAGGGGACGTCCA
GCGAGGCAAACTCTCTCCTGATCTTGACGGAGTCGCCGAC
AGTCGTCACACTTTCGATGGATCTGCAGGAGAAAGGTATC
TCCTGTCTCAGTCCAGTCAAGTTCAGCCGAGTCCTACCAC
CATGTTTCCCTACCCGAGTCAGCATGGACCGACGCACCCG
GCTTTCTCCATCGCCAGCCCGAGCCGCTACATGGCGCACC
ACCCGGTCATCACGAACGGAGCCTACAACAGCCTATTGAG
CAACTCTTCTCCGCAAGGTTACGCGACCGCCGGGTACCCG
TACGCGCAACAGTATGGACACGCGTACCAGGGCACGGCTT
TCTACCAGTTTTCCTCCGCGCAAGCAGGACTCGTGCCCGG
CAAAGCGCAGGTTTACCTCTGCAACAGGGCCCTGTGGCTT
AAATTCCACAGGCATCAAACGGAGATGATTATTACCAAGC
AGGGACGACGAATGTTCCCGTTTTTGAGTTTCAATATATC
TGGTCTCGACCCAACGGCGCATTACAATATCTTTGTGGAC
GTGATTCTTGCTGATCCGAATCACTGGCGCTTTCAAGGAG
GAAAATGGGTCCCGTGCGGCAAAGCGGATACGAATGTAAC
AGGGAACAGAGTGTACATGCACCCGGATTCGCCAAACACC
GGCGCGCACTGGATGCGTCAAGAGATTTCCTTTGGAAAAC
TTAAGCTAACCAACAATAAAGGAGCAACCAACAACACAGG
ACAGATGGTCGTCCTGCAGTCGCTGCATAAATACCAGCCT
CGACTGCATGTGGTGCAGGTGAACGAGGACGGAACGGAGG
ACACGAGCCAACCCGGGCGCGTGCAGACCTTCACTTTCCC
CGAGACGCAGTTCATTGCTGTCACCGCATATCAAAACACT
GATATCACGCAGCTAAAAATCGACCACAACCCATTCGCGA
AAGGATTCCGTGACAATTATGACACTGTCTACACAGGCTG
CGACATCGATCGGTTGACGCCGTCCCCGGGTGACTCTCCG
CGCTCTCAGATCATGCCTAGCGCAAGATATGCCATGACTG
GTTCTTTCCTGCAGGACCAATTTGTCAGCTCGTATGCCAA
GTCCCGCTTTCACCCTGGCGTCGGAGGCGCTCCTGGCACG
GACCGCAGCGTCCCACTTAGTAACAGCTTGCTCTCCCCGC
AACAAACCGAGGAGACCACGGTGGCCTCCCCGCAGCGATG
GTTTGTCACCCCTGCCAACAACCGACTGGACTTTGCCGCC
TCGGCATACGATGCTGCTGCGGCTGCTGATTTCGCCGGTA
ACGCGGCCACCCTTCTGTCGTACGCAGCTGCCGGAGTTAA
AGCGCTGCCCCTGCCCGGTGCGGGATGCTCCAACAGACCT
CTGGGGTATTACGGCGAGCCGCCGGGGTGGGGCACCCGCA
CACCACCGCAATATTGCAGTAAATCCAGCTCTGTTCTGTC
TTGCTGGCCGTCCAACTCCGTAGGGAGCAGAACGACCGCC
TCAAGCTACCTGGTCCCGGGACTAGAGGACGGAGACCCCA
TTGCGCCCGAGAGGTCACCGCTAGGCGGGGCGGATGAGTC
CAAACCTAAAGACCTGTCTGAATCCAGCTGGATAGAAACC
CCGTCCTCAATTAAGTCGATCGATTCGAGCGATTCTGGGA
TTTTTGAGCAAGCCAAGCGGAGGAGGATTTCGCCATCTGC
CACGCCGGTTTCCGAGACGTCGTCTCCATTAAAATCTGAA
ATGTTGACGCCGAGGGAATGCGAGAAAAACTGCTCCAAGG
ACATCGGCTACTACAGCTTTTACCCCCACAGTTAGAAAAC
TCGGACCGACTAATGCATGGCTTGTGTGTTCAAGGATTCA
CAAAAGTGACTTATAATCTATTTATGTCCTGCTATTTATT
TATTTGTTTATTTATTTGCTCTTATATCCGGTCGCGTCGT
TCTAAGGACGCCACGCGTCGAGTTTTAACGGAAAAAAACG
GACACTTGATCAAATATGTACGCGGTTTTCGTAACCAAAT
GACATTTTAAGGTTTTAACTGTCAAACCTATTGTAAGTAT
GAAAGTACTGTACATAATTGTATTTATCTATTCATTTGTG
ATTCTTCTCGTTGAATGTTGATGTATAATATAGAAAACCT
AATTAGGTTTATGTTAAATGTACTTAGAAAACGTACTTAC
GTTCGTTAGTTCGAATAGCTACATATATTAAATATTTTGA
TGTCTGAAAAAATAAGGATACATCTCGTATAGGTTCCAGT
TGTGATGACAAAAACGATACGACTGAATTGGAAGTAGCTG
CTAATCCGTTGAAAAGCCCGCCAAAAAGAGTTCCTCTGAC
AGGAAAAATGGCGGACGCATGTCTGTCAGAGGTTGATTTT
ATGTGAGCTTATATTGATGTTGCTTTTAGAGTCGCGTCGT
TTGTTCGTAAATATCATAGTCCGTAGTTTCATTTTGTGAA
CCTTGTTGAAATGTTTTTAACCACACCAGCGTAAAATCAT
TTATCCCATTACCTTTTTTTTGTAGAGATAAAAACATAGA
CAACCATTCCACGTATTAACAACCCAGGCATTTCATTTGT
ATTTCATGGGTTGTTTTCTCATGAGGAAAATCGCGAGTTA
GGCCTGCTAATGTGTAAAGCTAATGTAATTTGTGGTGTGC
TTACTTGCAATAAATGTGACAGAATGTGAAACCCCGGGCA
AAGTACACAAGCTTCAAGCTAAGCTGATTTCAAAACCAAA
TATTTGTACCATTTTCTCTACCTGTTCTTGAGGTATATTG
AAACGCCAGTCACAATGTGAATTCCGTTTCCTGTTCGATG
CATTTTCATAATAAAATGTAGTCATGCAATGCAACAATTA
AGATAATCGCCCAGAACAAACTCTTTGGTAGTTCTCTACA
ATTTATAGATGGATTTTTTACTGCAATTTATAGAAGCCCA
AAAGGTAAACAGTAGTGTTAATAACAAAATAACAGACCAG
ATACATTTAGATAATGAGATTTAAGTGAATATATATGGGC
ACATTTTGGTTGTCAAATATAGGCGGTGTGAGCATTACAC
CTGTGATTTTATATGGTCCATTTCAGGGCAAATTTAATTG
GATTTTAAACCCATTCATGACCTGGATTTTAAAAAAACAG
ACCAATGTTTATGTTTTTAAGGCCTTTTGAATTAGGGTTT
AGATATTGTAGTGACCTGATTCATTAAAACTCTGCTGTAA
ACACCTTCATAAGCAATTTTGAATGCATCCACAATAAACC
CCACCACCGCTTGGGTAATATTAATTACAGAAAGTTAAAG
GCAGTTCAGTTAATTTGTTAGTATGGTTGATATTTTAATG
TAGTGCAATTACATTGTTTTAGGTTTGACTTGCATCTAGA
TATTATTATTGCACAATCTAAAACATGACAATATTTTATC
AATCATGATAAGAGGTCAATATGATAAACATTTCTGTTTT
TTTTTTTTTCAGTTATTTAAGCTCGTTTACATCCACATGC
AACCTTCATATGTATGTAAATGAGCGGTATGCTATTATTA
AACAGGCAGACTGAA

Segment Relationships
Protein Products
No data available
Supporting Sequences
Citations