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clocka-202

ID
ZDB-TSCRIPT-090929-500
Name
clocka-202 Nomenclature History
Previous Names
  • clock-001
  • clocka-001
Transcript Type
mRNA
Annotation Status
Annotation Method
Ensembl
Associated With Genes
Strain
TU
Non Reference Strain
Genome Resources
RNA Central
None
Note
None
Sequence
OTTDART00000005368 (1) [ Show ] (double-click sequence to select) [Download]
>tpe|OTTDART00000005368|OTTDARG00000004981|ZDB-GENE-990630-14 clocka|OTTDARP00000004829 clock-001 LG_ BX088688.6 Danio rerio protein_coding KNOWN, 6535 bp
ACGTCGTGTGAAGCTTTCCACCACTGGGTGTCACAAGCTC
TCCGTTCTTGGTGTAAACATTACGTGGCAAACAAAGTCCG
CTCAGATTTTATGACAGAAATATGATTATGTTTGCCGACA
TAAGCGCAGACATGAAATAATAGTGGGCTAATAACCCGTC
ACATATCAAGTTGTAGGGTATCATTACTATTTAACAACAA
CAGCCGTCGGCTTAATAACCACGTATCACACGATAGTTAA
TTATTTAACAGGTTAAATAATAATTAGCAGCAGAAACTGT
GTTAATAACACCAATACGCGTCATTTTTCCGCACTATAAA
TGACAGAACTAGGGTAAAATATATTGTTATGATAGGTTTA
AACATGACAGACACGTCTCTGACGCACTTATTTGTATGTC
GCTGAAGCGTTTACATGTTTTTGTAAGGAAATTAGTCTAT
GGACTATGCAAATCACGTAAAGGTTTTTTAAAATAACCTT
AAACGTCGTGTAAGATTACCTGGGTCTCTATAAAAAAATA
AGCTGTAACTATTTTTTTCTTCCAAGCAACTCCATGAAAA
ATATTAATTTGACCTTTTACTACTAACTATTATCTGATAT
GTCACTCTTTGCTCCGCTTTCTGCACTGCTGCAGCATGTC
GCGCACTCGCATCATCTTATTATTGGACAAGACAACTGTC
ACTCAACACGCCACGCCCTAGAATTTTCGCGCGCGCTGAG
CACATTCAAGATGGGTTGAGGTGCGTATTTGACCTAATTG
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AGATTAGGAACGTTTGTATAACATAAAATTCACGCCGAAA
CGCAACCTTTAAAGCACAGGAAGGTTTTCTATGTTTATTG
TTACCGACATTTTTACATCTCTGCGGTCAATAAGCCTTTA
ATTAAATACCAAAATTAAACTATTCATAGTGTCATTAAAT
TATGTCAGAAAATAAATGTATTGGGAAAATGGACAGACTT
TTAATGTGTTTGGTTCATATTTTAGGGCACTTAGTGATGC
TATTTTATTTATAATTATCATTAATTATTATTTGCTTGCT
TGAGACTTTTATTTAATTGTTTCCATAATTTTATAATGAT
AATTTGTATTTATTATTTTAAAAAATCATAATTCATGATT
TCTTTATCTGAAAAACAAAGTAATTTTGAAAACAAAAACT
TTGGGTTAAATACATATAAACCCAACTGTTGGGTAAAAGT
TGGCTATAAATTGAATACAAAAACAAACAAACATGTAACC
CCGTGGTTGAGTATGTCTATATTGTACCAAATTTTGTTTT
CAAATAACCCAGCATTTTTGTCTTTGCACATTTCTTGTTA
TCTTTATGGAAATCAGTGATTTGTTCGTTAAATATGGCAT
TTTGGGAACTACCTGCGATCTGCTTGATTTCTTTAAAATG
CACTTAATATTATATTTCATGATGAATAAAAACAATGAGA
TAAATAAAAGCTCTAGTAGATTCTCGCGTGCCAACTAGCA
GCCAAGCTCTTGCTGCGTGTTGCCAGATTGTGTGGGATTC
TTCTCGAGCCGCACCGCGCATGCGCTTGGGAAGCCTGGGG
TAGGCCCTGCTGTTTTTCTAACTCTAGTTCAATCCTACAC
TGCCGTCTCAACCAAAACAAGGCGCAAGAAAATCCCCCTC
CTGGACGGCAAGTAACCAAGGGTTCCCCTCACTATTGGAT
TTGAATTATTTTGGTTTGGAGGACTTAAAACGATCAATGA
CAATCTACAGGAGCCCTTCTGCAACTTTCCCTACTTAAAA
ACAACAATAAAGCAAATTTAACAGCAGATTTACGGTGGTT
CAGGAGAGTTGCTGCTATTACAGAAATAATGACATAAGAG
GTGTGCAGTGCTAACATGTGGTGCCTCCAGTCTCACACCC
GACTGAAAGCTCATACACCCCACCGGGACCCTCAGCGGGC
TTTTCAGCCTTGACCTCAGACTCCCAGAAACACTCATATT
CACTCATATTCACCTTCTGTCTTCTGTCTGTCCTCAGTTG
TCCTCTCCAGAGCTCCTTTCTTCCTTCACTACTGCAGGCA
GGCCTGGAGGTTTATGTACAAATGTCTACCTCACGCTTAA
AGGTCCTCTCTCTACAACTGCGACCCTGAACACACAACAA
AAATGACCTCCAGCATAGACCGGGATGACAGCAGTATCTT
TGATGGGTTGATGGAAGAAGATGAGAAGGACAAAGCAAAA
AGAGTTTCTAGAAATAGGTCGGAGAAGAAGAGGCGAGACC
AGTTCAATGTGCTCATCAAGGAACTGGGCACCATGTTGCC
GGGCAACACCCGCAAGATGGACAAGTCTACCATCCTACAG
AAGAGCATCGACTTCCTGCGCAAGCACAAAGAAATTGCTG
CACAGTCGGAGTCGAGTGAAATCCGTCAGGACTGGAAGCC
ACCCTTCCTTAGCAATGAGGAGTTCACACAGCTGATGCTG
GAGGCACTAGATGGCTTCTTTCTGGCCATTATGACGGATG
GAAACATAATCTACGTCTCAGAAAGTGTCACGTCTTTATT
AGAACATCTACCTTCTGATCTTGTGGATCAGAACCTGTTG
AATTTCCTTCCACTGGGTGAGCATTCGGAGGTGTATAAAG
CTCTGTCAACACACATGTTGGAGGGAGAAACCCTCACCCC
AGACTACCTAAAGACAAAGAACCAGTTGGAGTTTTGTTGC
CACATGCTCCGGGGCACCATCGACCCCAAAGAGCCGCCCG
TTTATGAATATGTCAAGTTCATCGGAAACTTTAAGTCCCT
CAACACTGTGCCTAACTCAACACGAAACGGCTTTGAGGGA
GTGATCCAGCGATCGCTGCGACACGCGTTTGAAGACCGAG
TGTGTTTCATAGCGACGGTCAGGCTAGCCAAACCTCAGTT
TATCAAGGAAATGTGTACTGTGGAGGAGCCCAATGAGGAA
TTCACCTCCAGACACAGTTTAGAGTGGAAATTCCTCTTCT
TGGACCACAGGGCGCCTCCTATCATTGGTTACCTGCCGTT
TGAGGTTCTGGGTACTTCAGGGTACGACTACTATCATGTG
GACGACCTGGAGACTCTGGCCAAATGCCACGAACACTTGA
TGCAGTACGGTAAGGGGAAGTCGTGCTATTACCGTTTTCT
GACTAAAGGTCAGCAGTGGATCTGGCTTCAGACGCACTAC
TACATCACCTACCACCAGTGGAACTCAAGGCCAGAGTTCA
TCGTCTGCACTCACACGGTGGTCAGTTATGCTGAAGTGAG
AGCTGAACAGCGCAGAGAGCTGGGCATTGAAGAATCACCT
CCTGAGATCTCCGCAGACAAGTCTCAGGACTCTGGCTCCG
AGTCTCAGTTGAACACCTCCAGCTTGAAGGAGGCGCTAGA
GCGATTCGATCACAGCCGCACACCCTCAGCCTCGTCACGC
AGCTCCCGCAAGTCCTCCTCACACACCGCTGTCTCTGACC
CCACCTCCACACAGACCAAGCTGCAGACAGATCGCAGCAC
ACCACCTCGCCAATCAGTGTCAGCCATTGAGATGACATCA
CAGCGGAGGTCCTCCATTAGCAGTCAGTCGATGAGTTCTC
AGACCACAGGACAGACGATGGGAACATCTCTTGTGTCTCA
GCCTCAGCAGCCTCAAACACTTCAGGCCACTGTTCAGCCG
GTGCTGCAGTTTTCCACACAGATGGATGCAATGCAGCATC
TGAAGGAGCAGCTGGAGCAGCGCACACGCATGATTGAGGC
AAACATCCAGAGACAGCAGGAGGAGCTACGGCAGATCCAG
GACGAGCTGCAGAGGGTTCAAGGACAGGGTTTACAGATGT
TTCTGCAGCCGAGTGGTGGTGGATTGAACCTCAGCTCAGT
GCAGCTGACACAGAGCTCATCTGTACAGACAGCAGGCACT
CTGTCCATGCAAGGGGCAGTGGTGCCTACGGCGACCCTGC
AGAGCAGTCTGCAGTCCACACACAGCAGCACACAACACAC
GGTCACACAGCATCCTCAGCAGACAGCAGTGCAGCAGCAG
AACCTGCTCCGAGACCAGACCACCAACCTCAACCAGCAGT
CTCAGAGGTCGACCCACACACTGCAGTCTCCTCAGGGTGC
TCTGCCTGCATCTCTATATAATACCATGATGATCTCTCAG
CCGACACAGGCCAATGTGGTCCAGATCTCCACAAGCCTGG
CCCAAAACAGCAGCACCAGCGGAGCCGCCGTCGCAACCTT
CTCACAAGATCGACAGATACGGTTCCCTGCCACCCAACAG
CTCCTCACTAAGCTAGTAACAGGCCCTATGGCATGTGGTG
CAGTTATGGTTCCCACCACCATGTTCATGGGGCAGGTGGT
GACGGCGTTTGCCCCTCAGCAGGGTCAGCCTCAGACTATC
AGCATTGCTCAGCAGCCGTCAGCGCAGACAGCCGATCAGC
AGACCCACACACAGGCACAGACACAGGCCGCAGCAACAGC
CCAGCAGCAGGGACAGAACCAGGCTCAGCTCACACAGCAG
CAGACGCAGTTCCTTCAGGCCCCACGTCTTTTACATAGCA
ACCAGTCTACCCAGCTGATCCTCCAGGCGGCGTTTCCTCT
TCAACAACAAGGCACATTCACAACCGCAACACAACAACAG
CAGCAACTTCACCAACAACAGCAGCAACTTCAGCAGCAGC
AACAACTCCAACAGCAGCAGCAACAACAGCAGCAGCAGCT
TCAACAGCAGCATCAACAACAACAACAACAGCTTCAACAG
CAGCATCAACAACAGCAGCAGCAACTGGCAGCTCATCGCT
CCGACAGCATGACGGAGCGCTCCAACCCTCCGCCTCAGTA
AAGCGCATCGTCAGGGACACCACCAGACCTCCACTGAGCG
GTCCCGCAGGCTGGAGGGCTTCTGAGGGGGGGAGAGAGAA
AGAAAAATAGCAGTATTTGTGCTGTACCCTCTCAGATACC
CTTCCACTGCTTATAGGTGAGGAGCCAGACCTAAACGGGT
GTTCGCTCCCGTTCGCTCTCCCACCTATAGGTTGCTTGCA
CTGAATTCTGGGAGAGGCCGGACCACCAACACTGAGCTCT
GGTTTACCGCCAAACACAATATCCGCATCGTCATTGTCTC
GTCCGCCCGGTGCATGCCGTCATCCTTCATCCGCAGGTTT
AATTTATGCAGGAGGAGCGCTTCAGGACGTCCTGCAGGAC
AAACAGCGCCTCGCTCTTTCTCTCGGCCTCTCTCTCTCTC
TTTCTCCTCCTCTTTCCTTCTCATTTTACGTGTCGAAGTA
ATTATGGGTCAGAAAATATTTTTAAGAATGTGGAGTGGAT
TCAACTTTTATTGTACAGTTCACCTGTAAAATAATGTGTA
AATATATGGACAAAAGGAAAGAGAAACTAATATTTTATAT
GATGCATGAGATGAAAAGCGTAGTCTGTTATTTGTAGCTT
TGAATATACTTTTTTTCTAATATTCAAAGGAAAAAAAGCT
AAACTTACTACACGTAATGGCTGATCTCTTCACAGACTTC
CTTTTTCCAGTGGGATGGGGTGTTGAGTGTGTGTGTGTGT
ATGTGCTTGCGCACATGTGTTTGTATGTATGTGTGTCTGC
CAAGCAGGCGAAGCTGGATCCTCAGATTGCGTCACAGTTT
GTTTAAAGCGCCCTTCGTATTTTAGTAAATCTGTTAAAGG
AACAGGCAATCTTTAGATGTTTTGCACCGCGTTATGCAGT
GCAGTACCATAGTAAATGCAAAAATATAGAGATGACTATT
TCAGAGAGATGTTTTACATTTGTAAATACTTTACAGAGAA
GGCTTCAGATCTAGTCTATCATGTGGTTAGGTTAGGCAAA
CATAGAAATGGCGCTTTGAGCATTCACTGCTGAAAGGCGT
TCGCTGTTGTGTACCGATGATAGTAACGGTACTCTCTTCA
ACTGGAAAGGATGCGGGGTTATGATGACGAGACATCTACT
CACATAGTGTGCATGATCTTAAACGATACAGGTAAATTAG
CTTAAAGCTAAGCCATAGCTTCCTCTAGTTTTCCAGTGGT
TTACATGGTTGTTTACACTGTTATACAGTGTTTTAGGTAT
GACTCGCTAAGGCTTGAGTAAGAAATAAACTGTTTATCAT
CTAGAAATAATCAATTATCACATATTTGCACAGTTTTAAT
GCAGGAATACTTTCACTTGCCTTTCTCGGGTTTCCGCTCA
ATAACTTCTTCCACTCAACTCTGGTAAAGCAGGAATGTAC
AGGTTAACTAGTACCTCTTCAACACTCACTTAGTCACTAG
CAACTTTCTAGCTTTTTTTGCCCAAAGGAAACAACACAAG
CCAAGTGTTGACAATCTCACTTACTTTATCAGCCCCCTGT
TGTTGTACGATTAAAACATGCCAGATTGTAGTAGATTTGT
TTGATAATTAAACGTAACTCTTTAGCTGTGGCTTTAATAT
TCAGCGATTTTTGAGTTCACGCTTGTTTAGCAGTACAGTT
GAAGTCAGAATTATTAGCCCCCTTTAAATGTTTTTTCTCT
TTGAAGTATTTCTCA

Segment Relationships
Protein Products
No data available
Supporting Sequences
Citations