Genomic Feature

zf3263

ID
ZDB-ALT-210916-1
Name
zf3263
Synonyms
  • tmp003 (1)
Affected Genomic Region
Construct
None
Type
Allele with one deletion (1)
Protocol
embryos treated with
Lab of Origin
Current Source
Other Pages
Notes
No data available
Genome Browser
Genome Build: GRCz11Chromosome: 1
Variants
Variant Type
Small Deletion
Variant Location
Chr 1: 41362949 - 41374113 (GRCz11) (1) Details
Nucleotide change
CCGAGGAGCACGTTGAGGAGCCAGGTGTAGAAGTAGTGTGTTCTGCGTGAGTGTTGACACACACTGACAGCCGAGCTGGCCGCTGTTCGTCGAATAGTGGGAGAACTGGACTTCAGATTGGCGACAAAGGCCTTTAGCAGCATCTACATACACATATACAGGGGGAAAATCAGTGGTGGCACATTCAAAATCATCTAAATAAGGTCATTTAAACAGAAAATCTGATTTTAAATATATGAAATCATGATAAAAGTTTAATATATTTTATTATTTATAATGATGTCGCTGCTTTGCATATTTAAATACTTTGGTAAATATAAATGTAGAAATTTGGTAAATACAGTGGGTACTATGATACAATTTCTGGTAAATATAGAAGTTGTTGACATGAAATCCAGATTTTGGTAAAAACCCAAAGAATCCAAAGAATACAAACAAAACAATTTCAGAAAGATTTGTTATGAGTAATAACAATAGAATGAGAAAAGGAGAAAGTATTAAACTATTAAAATGTATCTAATACTTTGCAGATATATATATATATATATATATATATATATATGCTTTGGTGATGACAGCTTCAAGATGCCTCTTGTATGGAGAGTAGAGTCACATTCATTACTGGGGTATATATTTTTTTAACATACTTCAAAAGAGTCTAAAAATCTTGATGGTTCTGTGGGTCTCATCTATAAACTCTCATCTTTACTTATTTTCTATTGGATTGAGGTCAGGTCATTGGCTGGGCCATTCCAGCAGCTATATTTTTTTATTCTGTAACCAACTTGGCTGTGTTTGGGATCATTGTCTCGCTGAAATATCCACCGTGGGTTCACCTTCATCATCCTGGTACTGTAGGTGTGAAAGATTTCATAATTCTGGTAATGTAGGAACCAATAACCACATTTCCATGTGCTTTCCTTTTTACACCTCCATTTCCTCATGTGTTTAATCCTTTTCCCCAGTGTCATTTAATTTTTATTACACATAAATTAATTGCTATTCTAATTAGTTTTGTTTTTTGTGTGTGTTTGGATTTCTTTGCTTGTTACTCGCATCTGGTGAACATTTCAAGTCAGCAGAACCTTTTGCAATATATTTTGATTAAATGGTGACATGTTCAATACTTTTTTTTTTTTGTTTTTTACCAACTGCATTTATAGTTCACTTTTTTTTTTTTTACTTTTGATCAAATAAATGCAGCCTTTTCAACAAAAAACACTTTTTAAAAACAAAATTATAATTAAAAAATCTGTATAATTTTTAAACCGTAATTATAACAAATATAATAAAATAACCTTTGGCCTACATACAAACACACCACATATATTTTATTAAATTATGCCTTTTGCATTCCTAAGGTTTTTCATTTGTGGAATGAGCTCATTCATAACCGTAGCTGGATTTAAAATCATCTAGAATCACAATACTCTAGTCTTAAAAAGTGAATGTGTTCTTGGCAAGAATACAGACTCTTTCCGTCTCTTGATGCGAGGGAGAAGAGGCTCATGGATAATTAAATCCAGCCTGAGTGAGTCATGTTCCATATTGAGGAGATGATGTCACCACTGCGCATTTACGGCTTCAGATCAGACAGTCAAGATAACGGTGAGGGAAATCCCTCACTCAGGTGCCAAATCACAGAATTCAGTAGCAAGGCAATCTTATTTTCATGTCAAATACATAAGGCCATCCAGAATGACTAATGACTTTTGAATCAAGGTACATTTTATTGCAAATCGCCTGATGTGGTCTTCTGAAATGTTTTACTTTGACCAAATTTAAAATAAAGTAAACACATGATAACCTTGGGAAATGCTACTTTTTCAGCTCATACCTTAATCTCTCCATCATTGGCAAAGTGTCCGAGGGCAGCCATGATTTTAGGAATTGAAGAAGAGAGAGTTTCCTGCACAGTCTCTTCTTGACGTTTTGTGATTCGTGTCAAACATGGTAGCAGGTTCACAAGGTACGGCCTGGGAAAGGTGACAATGAGGGTTAGGATTTATTGTGTTTGCTTATCTTTACAATCAAAAGCATGTCACAGCTTAAGATCAGCATGAAACAGAAGTTGCAATGATTTTTTCTTCGCTATAGTGATGTTCTTCAGGAACTGACTTGATCAATGGAAATACAGCAGAATTGAGGCAGATTTGAATATACTCAGTTTACTCTAAAGCGACTTACCTCTGGCACCTTCACATGCTTTATTTTATTATTTATTTTTATTTGAGCCCTATGTTGCTAAAAATTTAAGAGTTCAATTGAAGGAAAATTTATTTAAACCAAACTATTTACCTGCTATGACCAAGATAAAGACAGACAACAAGACCAATGGCACATGAAAGGTAGACATTATAAAGACACATTAATATTTAAAAACATAATCAAGTGCATAGATAAATCATGTAGAATAAACACCACAATATTACATACAAATGGAATTCAACTTTAATCTAAATATGTATTTAAATTCATATACTAGTACAAAATTTGGTTTATTTCCATTTTAATGGAAAAAGTAAAAAATAAATTGCAGCTTTTTTTTTGTGTTAAACAAAATACACATAAAGAGACAGTTCACCCAAAAATGAACATATATTCCCTATCTAATGTTCCTCAAGTGTTCATTGAACACAAAATATAATATTTTATCTAGAAAATATGAAAATAGTAGGGAATAGTTTACTTAGTTTACTTACTGTGGAAGTCAATGGTTACAGGTTTTAGCATTCTTCAAAAAATTTAATTTGTGTTTGTCAGGTGAAAGAAACTCAAACAGGTTTGGAACAAGAAAAAAGTGAGTAAATGATGACAGAATAATCAGTTTTGGGTGACCTATCCCTTTAAGTCTATAAAATCTCTGAACATTTTTTGTTGTAATTACTTTGAATGAATGGGTGCGTTCAACAGAACAATAGTCCAAAACCAAAATACCTCCAAACCAAACCTTTATTTTGACACTCTGAAAATAACAGTTTCTGTTTATATACGTCATGCGTTCTCAAATTAAAATATGAAATACTTATGGAATGAACTCTGTTCTGCAACATCAAATTTAAAAAGTCTTTTCATTGTTTAAATTCAATGCAATTCAATTCAATTCACCTTTGTTTGTATAGCGCTTTCACAATGTAAATTGTGTCAAAGCAGTTTCACATAGAAGATCATAGTAAATTTAAAAGTAACAAGCACTAGTCAAGACTGCAATTTAAGAGTGAAGCCCTACTTTCAATTTATTTATCTTTAATTTGGCAAATTCCACGTTTGCAGTAAACTACATTCCTTTGTTTTGAGCTAGTCCTATGATTGTTCCCACAATGTTCCACAATAATTGGGTCCTGACCAGTCTACTAGAAGTAAGTGACCAAAAGTTGAGCATACCTGCATTTCTGTGGACGCACCAGGTGAGCAAGCTCTGCAAACCTCCACAGGGCTGCCCGCAGACTCCGAGAGGCAGCGTTCTGTTACCACACACACAGTAAAGTGATCCATTAGTGAGCTGTACATTTACTTAAAGAGCACAAGACTCATGTGCCTGTGAAGTTTATAGCATTTCCCCCAAAAAATTTTACTAAAAACAAAAACAATAATCAAACCAATCAAATAATCAAATATTGTTGCAGATAAATCGCAAATTAACAACAAAAGTGCAACAAAAATGTAACTTAAATATAAATCAGCCACACAACGTAATCCTAGAACTCCAGTTCAGTACACTGACATGCATTTACAAAAGAACTCCTAATAAATTAAACATTCATTACAAAAAGTTTATTGAGTCTGATTTACCTTTTTAATCTCTTTATACAGTTCAAGTTGTAGTCTAGGCAAGTTGGAATCCATCAATGCCTGCAAAGATAAACAAAGAAATTATATTACCATTGAACAAAACAAAAAAAAAACACCACTACAATCATCATCCAATTGAATATATGTCAGATATGTAAACTACAAATGAGTTACTTTGATGATTTTGTTGAGGCACTCATCGGCCACCATCCTGACGTCAGACTCTTTGTCATCGCTGCACAGCAAGAACATTTCCATGGCAATTCCAAGAAGTTTCTGGAACTCTGGAGACGTCCTGATAACAAATCAGTGTAATTAAATACATAGCTAACAACACTAGAAGGCTAAAATTATTGGTCACAGCTTCGAAATGAACAGTGAGTCAAAATAAATACATTACAGTATGTTTAGCAATTTAAAATCAGCTATTTTTCTAGGCCCAGAGATCCAGAATATAATTGGAGAAAATAGGGAAAGAATATTCATCTGTTTGTGGTCTTTTCCTCTGTTCATTTTTTTTTTTGCTTGTTTATTTAACAGAGACAATACACTTGACATTGTTTTACAAAGTCAACCGATGTTGTGTACATAGGGAATATAGCATAAAGCTAATTTGCAACCCTCGTCCCTGGTCTAGTACATCTAGTACATCTGTTACAATCACCCCAATTACCCTCAATCAAAAACTGACAGCTACAAGATACAAGCTGCGGCAGAAAAAGGAAATGCTACTTGAAAAACAAGGATGTGGCAGGGCTGCATGGACAGTTATGCCAAAAAGACTAAGACTAATAAAAACAAACCCATCAAGATCACCATAAACTGGATCTATCTTCTCTATGTGTATTCAGGACGTAATCAAGAATTTCAAGAAGAAATAAAACTAAAAGAAATGTTACTGGCTTTTTCATTATTTATCTAGATTTGTTTGTAGTTTATACAGTTGAAGTCAGAATAATTAGCCCCCTTCAAACTGTTTTCTTCTTTTTTAAACATTGTTTTTTTCAAATGATGTTGAACAGAGCAAGGTCATTTTCACAGTATGTCTGATAATATTTTTTCTTCTGGAGAAAGTCTTATTTGTTTTATTTCAGCTAGAATAAAAGCAGTTTTAATTTTTGTAAACACCATTTTAGGGACTAAACTATTAGCCCCTTAAAGCGATATTTTTTCACGATAATCTACAGAACAAACCATCGTTGTACAAT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Variant Notes
The deletion successfully removed the genomic
region spanning exon 1 and intron  ...
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
DNA/cDNA Change
11165 bp deleted (1)
Transcript Consequence
None
Protein Consequence
None
Sequences
Flanking Sequence
TGAGCAGAGAGGACTTCTTTAAAAGCATGTAAAAGTCCTACCAATCCCAAAATTTGGGAGGTGTACAAACTTCACTAAATTATCAAGAAGTAGACCCCACAAAATTCAGTTCTCCATTAAATTAATGCGTCAAAACTCAAAAAGCTGCACGAGCTCTGATACCTGAATGAGCTGTTCAGGTGCAGGCGTGACGTCGGCCTCTTTCCGGACAAGCCCAAAGCTGCCCTTCAGACTGGTGCTAGGAGTCTGCTGCTGGATAAGAGGCATCAAGTAGCGCAGTGTCAGTAATACACCCAGAATCAGGTGACTGGAATGCTCCTCATCCACCGGTACTACCAAACCTGACAAGACAACAGACAAAACAATTAACACACTGTTCTGAAGGGGAGAGTGTGTGCGCGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTTTACAGCATA
CCGAGGAGCACGTTGAGGAGCCAGGTGTAGAAGTAGTGTGTTCTGCGTGAGTGTTGACACACACTGACAGCCGAGCTGGCCGCTGTTCGTCGAATAGTGGGAGAACTGGACTTCAGATTGGCGACAAAGGCCTTTAGCAGCATCTACATACACATATACAGGGGGAAAATCAGTGGTGGCACATTCAAAATCATCTAAATAAGGTCATTTAAACAGAAAATCTGATTTTAAATATATGAAATCATGATAAAAGTTTAATATATTTTATTATTTATAATGATGTCGCTGCTTTGCATATTTAAATACTTTGGTAAATATAAATGTAGAAATTTGGTAAATACAGTGGGTACTATGATACAATTTCTGGTAAATATAGAAGTTGTTGACATGAAATCCAGATTTTGGTAAAAACCCAAAGAATCCAAAGAATACAAACAAAACAATTTCAGAAAGATTTGTTATGAGTAATAACAATAGAATGAGAAAAGGAGAAAGTATTAAACTATTAAAATGTATCTAATACTTTGCAGATATATATATATATATATATATATATATATATGCTTTGGTGATGACAGCTTCAAGATGCCTCTTGTATGGAGAGTAGAGTCACATTCATTACTGGGGTATATATTTTTTTAACATACTTCAAAAGAGTCTAAAAATCTTGATGGTTCTGTGGGTCTCATCTATAAACTCTCATCTTTACTTATTTTCTATTGGATTGAGGTCAGGTCATTGGCTGGGCCATTCCAGCAGCTATATTTTTTTATTCTGTAACCAACTTGGCTGTGTTTGGGATCATTGTCTCGCTGAAATATCCACCGTGGGTTCACCTTCATCATCCTGGTACTGTAGGTGTGAAAGATTTCATAATTCTGGTAATGTAGGAACCAATAACCACATTTCCATGTGCTTTCCTTTTTACACCTCCATTTCCTCATGTGTTTAATCCTTTTCCCCAGTGTCATTTAATTTTTATTACACATAAATTAATTGCTATTCTAATTAGTTTTGTTTTTTGTGTGTGTTTGGATTTCTTTGCTTGTTACTCGCATCTGGTGAACATTTCAAGTCAGCAGAACCTTTTGCAATATATTTTGATTAAATGGTGACATGTTCAATACTTTTTTTTTTTTGTTTTTTACCAACTGCATTTATAGTTCACTTTTTTTTTTTTTACTTTTGATCAAATAAATGCAGCCTTTTCAACAAAAAACACTTTTTAAAAACAAAATTATAATTAAAAAATCTGTATAATTTTTAAACCGTAATTATAACAAATATAATAAAATAACCTTTGGCCTACATACAAACACACCACATATATTTTATTAAATTATGCCTTTTGCATTCCTAAGGTTTTTCATTTGTGGAATGAGCTCATTCATAACCGTAGCTGGATTTAAAATCATCTAGAATCACAATACTCTAGTCTTAAAAAGTGAATGTGTTCTTGGCAAGAATACAGACTCTTTCCGTCTCTTGATGCGAGGGAGAAGAGGCTCATGGATAATTAAATCCAGCCTGAGTGAGTCATGTTCCATATTGAGGAGATGATGTCACCACTGCGCATTTACGGCTTCAGATCAGACAGTCAAGATAACGGTGAGGGAAATCCCTCACTCAGGTGCCAAATCACAGAATTCAGTAGCAAGGCAATCTTATTTTCATGTCAAATACATAAGGCCATCCAGAATGACTAATGACTTTTGAATCAAGGTACATTTTATTGCAAATCGCCTGATGTGGTCTTCTGAAATGTTTTACTTTGACCAAATTTAAAATAAAGTAAACACATGATAACCTTGGGAAATGCTACTTTTTCAGCTCATACCTTAATCTCTCCATCATTGGCAAAGTGTCCGAGGGCAGCCATGATTTTAGGAATTGAAGAAGAGAGAGTTTCCTGCACAGTCTCTTCTTGACGTTTTGTGATTCGTGTCAAACATGGTAGCAGGTTCACAAGGTACGGCCTGGGAAAGGTGACAATGAGGGTTAGGATTTATTGTGTTTGCTTATCTTTACAATCAAAAGCATGTCACAGCTTAAGATCAGCATGAAACAGAAGTTGCAATGATTTTTTCTTCGCTATAGTGATGTTCTTCAGGAACTGACTTGATCAATGGAAATACAGCAGAATTGAGGCAGATTTGAATATACTCAGTTTACTCTAAAGCGACTTACCTCTGGCACCTTCACATGCTTTATTTTATTATTTATTTTTATTTGAGCCCTATGTTGCTAAAAATTTAAGAGTTCAATTGAAGGAAAATTTATTTAAACCAAACTATTTACCTGCTATGACCAAGATAAAGACAGACAACAAGACCAATGGCACATGAAAGGTAGACATTATAAAGACACATTAATATTTAAAAACATAATCAAGTGCATAGATAAATCATGTAGAATAAACACCACAATATTACATACAAATGGAATTCAACTTTAATCTAAATATGTATTTAAATTCATATACTAGTACAAAATTTGGTTTATTTCCATTTTAATGGAAAAAGTAAAAAATAAATTGCAGCTTTTTTTTTGTGTTAAACAAAATACACATAAAGAGACAGTTCACCCAAAAATGAACATATATTCCCTATCTAATGTTCCTCAAGTGTTCATTGAACACAAAATATAATATTTTATCTAGAAAATATGAAAATAGTAGGGAATAGTTTACTTAGTTTACTTACTGTGGAAGTCAATGGTTACAGGTTTTAGCATTCTTCAAAAAATTTAATTTGTGTTTGTCAGGTGAAAGAAACTCAAACAGGTTTGGAACAAGAAAAAAGTGAGTAAATGATGACAGAATAATCAGTTTTGGGTGACCTATCCCTTTAAGTCTATAAAATCTCTGAACATTTTTTGTTGTAATTACTTTGAATGAATGGGTGCGTTCAACAGAACAATAGTCCAAAACCAAAATACCTCCAAACCAAACCTTTATTTTGACACTCTGAAAATAACAGTTTCTGTTTATATACGTCATGCGTTCTCAAATTAAAATATGAAATACTTATGGAATGAACTCTGTTCTGCAACATCAAATTTAAAAAGTCTTTTCATTGTTTAAATTCAATGCAATTCAATTCAATTCACCTTTGTTTGTATAGCGCTTTCACAATGTAAATTGTGTCAAAGCAGTTTCACATAGAAGATCATAGTAAATTTAAAAGTAACAAGCACTAGTCAAGACTGCAATTTAAGAGTGAAGCCCTACTTTCAATTTATTTATCTTTAATTTGGCAAATTCCACGTTTGCAGTAAACTACATTCCTTTGTTTTGAGCTAGTCCTATGATTGTTCCCACAATGTTCCACAATAATTGGGTCCTGACCAGTCTACTAGAAGTAAGTGACCAAAAGTTGAGCATACCTGCATTTCTGTGGACGCACCAGGTGAGCAAGCTCTGCAAACCTCCACAGGGCTGCCCGCAGACTCCGAGAGGCAGCGTTCTGTTACCACACACACAGTAAAGTGATCCATTAGTGAGCTGTACATTTACTTAAAGAGCACAAGACTCATGTGCCTGTGAAGTTTATAGCATTTCCCCCAAAAAATTTTACTAAAAACAAAAACAATAATCAAACCAATCAAATAATCAAATATTGTTGCAGATAAATCGCAAATTAACAACAAAAGTGCAACAAAAATGTAACTTAAATATAAATCAGCCACACAACGTAATCCTAGAACTCCAGTTCAGTACACTGACATGCATTTACAAAAGAACTCCTAATAAATTAAACATTCATTACAAAAAGTTTATTGAGTCTGATTTACCTTTTTAATCTCTTTATACAGTTCAAGTTGTAGTCTAGGCAAGTTGGAATCCATCAATGCCTGCAAAGATAAACAAAGAAATTATATTACCATTGAACAAAACAAAAAAAAAACACCACTACAATCATCATCCAATTGAATATATGTCAGATATGTAAACTACAAATGAGTTACTTTGATGATTTTGTTGAGGCACTCATCGGCCACCATCCTGACGTCAGACTCTTTGTCATCGCTGCACAGCAAGAACATTTCCATGGCAATTCCAAGAAGTTTCTGGAACTCTGGAGACGTCCTGATAACAAATCAGTGTAATTAAATACATAGCTAACAACACTAGAAGGCTAAAATTATTGGTCACAGCTTCGAAATGAACAGTGAGTCAAAATAAATACATTACAGTATGTTTAGCAATTTAAAATCAGCTATTTTTCTAGGCCCAGAGATCCAGAATATAATTGGAGAAAATAGGGAAAGAATATTCATCTGTTTGTGGTCTTTTCCTCTGTTCATTTTTTTTTTTGCTTGTTTATTTAACAGAGACAATACACTTGACATTGTTTTACAAAGTCAACCGATGTTGTGTACATAGGGAATATAGCATAAAGCTAATTTGCAACCCTCGTCCCTGGTCTAGTACATCTAGTACATCTGTTACAATCACCCCAATTACCCTCAATCAAAAACTGACAGCTACAAGATACAAGCTGCGGCAGAAAAAGGAAATGCTACTTGAAAAACAAGGATGTGGCAGGGCTGCATGGACAGTTATGCCAAAAAGACTAAGACTAATAAAAACAAACCCATCAAGATCACCATAAACTGGATCTATCTTCTCTATGTGTATTCAGGACGTAATCAAGAATTTCAAGAAGAAATAAAACTAAAAGAAATGTTACTGGCTTTTTCATTATTTATCTAGATTTGTTTGTAGTTTATACAGTTGAAGTCAGAATAATTAGCCCCCTTCAAACTGTTTTCTTCTTTTTTAAACATTGTTTTTTTCAAATGATGTTGAACAGAGCAAGGTCATTTTCACAGTATGTCTGATAATATTTTTTCTTCTGGAGAAAGTCTTATTTGTTTTATTTCAGCTAGAATAAAAGCAGTTTTAATTTTTGTAAACACCATTTTAGGGACTAAACTATTAGCCCCTTAAAGCGATATTTTTTCACGATAATCTACAGAACAAACCATCGTTGTACAAT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CCATTTTAACAGAAGCTGTGATGAAGATATAATCTGATCGGAGATAGGGTAATATTTACAAACTGAAAACGACAGCCAGT  ...
Additional Sequence
None
Fish
Fish Genomic Feature Zygosity Parental Zygosity Affected Genomic Regions Phenotype Gene Expression
httzf3263/zf3263Homozygous♀+/- ♂+/-3 figures with image from Sidik et al., 2019
httzf3263/+HeterozygousUnknown3 figures with image from Sidik et al., 2019
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Supplemental Information
Genotyping protocol
None
Citations
TSV
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