Genomic Feature
nju209
- ID
- ZDB-ALT-210901-3
- Name
- nju209
- Synonyms
- None
- Affected Genomic Region
- Construct
- None
- Type
- Allele with one deletion (1)
- Protocol
- embryos treated with
- Lab of Origin
- Xin Lou Lab
- Current Source
- Other Pages
-
Notes
No data available
Variants
- Variant Type
- Small Deletion
- Variant Location
- Chr 3: 15708803 - 15731292 (GRCz11) (1) Details
- Nucleotide change
- GAGAGGAGCCGTCTGTAATAAGAGTAGACTTCAGACCCAAAGACTGCAGGAGCTTCACCTGGAAGACAAAACGGTACATGTTTAGAGGCCATTTCTATGTGGTTATGTCATTGGCCCTTAAAAATGTCCTGCTTGTTGTCAAACTATTTCAAAACTGTAACAAGAGGCAATTTAATCATAACTTAATGTTTAAACACCTGCCATACGATTATTTATCAATATTTGGACTTTTTTTGGATTCTCGGAAGCTCTGGAAATTAAAAATGTAAAACAGGAAATGTGCATTGTTATTGTTTACATCCCCCAAAATGGTCTATAATTATCTTTACACGGCAAAAGCAGCACAGAAACCAAACCTGAAGTGGTGTAAAATAAATATATAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTGAAATCACAAAAATAAATAAATTAAGAGTTTAGATGCAAAAACCTCTAAAAGCCATTTGTTATTTTCTGTAACTCCTGTGTGTTGGCTCAGTAATTTTACATTTATAGTGACGGATAAGTTCCCTTCATTGCCTTTTAGGTGAAATAACTGAACAAACCGAGGAGGTTAAGAAAAATTCTCATTTTGAGAGACAAAAATGAGACAGCATTTGGAGGTTTTTGCATCTGATGTCTTCAAATACAAATGCATTTACATTTATAGTAAAGCTGTAGGAACTATTCCTCCTAAAATAACAGTTGTAACAAAATCAAATGCTATTTAAAATGATATAACAAATATAAAGAATAAATAAAACATACTGACCAAATTTGTAGCCTAAATAACTTTTTCGTTTCGTAATTAAGGCTATTTCAGAAATAATTTGTACTTTTTTTTTCACATTTGATAAATTCAACAACATCAGAACAAATAATATATAACAATAAATAAATAAAACACAATTCATAATGACTTGTATATTTGTAGCCTACAGTTAGTTAAAAACATAGTTTAATTTTGCATAAAGGCAAACACAATATTAATGCAATCTGCTAAATTACATGTTATGCAGAAGTTTGCAATGCAAGACATATGCATTTCAAACACAAGAGGATGCGTTTTATTTTTAAAAATTGTTTAAAATTCTGCTTAATATGTAATTTAGCGCATTGCATTAATATTCTGGCTTCATCTGCGTGCAAAATTTAGCAAGCTATAGGCTACAAATTTAGTCAGTTTTGGTTGTTTGTTTATTATATATTATTTGTTGTGTTGATGAATTTATCAAATCTGAAAAAAAAAGTCTGTTTTAAAAATAATTTCTGAAGTAGCACTAATTAAGAAACGAAAAACAAATTACTAAGGAGTAAAACATTAAAGTAACAGTTTGCATGATTTAGAGCCTATTTAAATTTATTCTTGAGAGGCTATAGTGCATCTTCATCTGCTTGAATGTTGTACAGCTAATGTTTATCATTTACCAGCTTACGAGTCTTAATATATATAGTCGATTTGTCCTTTATATAGGCCTTGATATAACATTTTAATGCATGTAGCCATGGTGTTTTTGTGTTGAACTGACTGGCGTCCTTTGGGTTGCCATGACAACAATGCTCCTTAGAGTGCCGCTGTTTCGCTTTTTATTTACACTCAATCACAAACCATTGTATCGCCTTAGATACTAGGGACTAAGGGTGAGTGAGACGAGGCACATTTTAGGTCTGCTGAGATCTGCGTTCTGAACTAACACTGAATGTTCTGAGCAGACAGTGATCCGTATGAACACCATTTTTAATCTAATGATGATCATTTAACCCAGTGTTTCTCAACCACATTCCTGGAGGACCACCAGCTCTGCACATTGTCCTTACCCAAACACACCTGATTCAGATCATCCGCTCATTACCAGAGTATGAAAGACCTGTAATGGGTGTGACAAAGCAGACATCTAAAACATGCAGTGTTGGTGGTCCTCATGGATCGTGGTTGAGAAACACAGATTTAACCTATTGAAAGCAGCAGAATCCATTCACACCCATACCAAAATGCTTGTATGTCAACTTCTGTGATGTAAAGGCTCTATAGAAGGATATTCATTTGTGATCGCAGACACTCACCTGTAGTTCAGGCCCGGCTCTGGCCATTTCCTTCAGGGTTTCAGTGCCCAGGTTATCCATCAAATGCTTGAAGCGTTGACTCTCGATGTCTGCCAGCTTCTGCTGCTTCTCCACCTCCAGATGGTCTATCTGCTTCTTGTAGTTCAGCTCTTGTTCGCGTGCCTTACACAGACGCGCCAGCTCTGAGTCCTGACACACACACAGAGAAGAAAAGTCAAAATCTAACAACATAATAATATCAGGGTTCCCACAGGACATGCAGTTTATGGAAAGTCACAGAAGTTTAAGAAATTCATTCCAGACATTAAAGGGAATTGTTTTTGTCTTGCTCATAGAAAATCTGGGATTTTTGCTTGTTGCTTTAAATTGTAGTTTCTATTTATGAAAATGTCAATTATCTATACTGTAATTTTATATCATGCTGTTTTGACGACTATTTTTAGCTCCATTTTGGTTCGTTCATACTCATCAACTCGCAGCCACTTCAGCCATCAGACTATACCTGTAAACTAAGGCTAACATGTTACATTAGATTAGATTCAACTTTATTGTCATTACACATGTGCAAGGCAACGGAATGCAGTTTAGGTCTAACCAGCAGTACAATAGCAGCAAGTGCAGGATACAGGAATAAGTTATAAAGTGCAGTTATAGAATAACTATGGTCATATTTACAGATGGATGTTCTATGAACATTATATAGAGGTGGTATTAACTGTGAACAAAGATTTATAATAGATGAATATATGTACAGGTTGCTATTATTAATCAGAAGTGTGCAGATAGATCAACATAATTACAAATGTATATGTACAGTGGGTATATACAGTTCAAGTGAATGAATCACTGCAATGTAGTGCAATGAATATGTGCAATTTTTAAGTTTAATAAATAACATATCAGATAAATAATATAGATTTTGAAAGCGGTGTCTTCAAATTAACCACTCTTAGAAGACTGGGGGTTAAAGTCTGATGAGAAAAAAATACAGAAAAGCTAAATATAAAGTTTGTAAAACTACTATTGAGTTAAGCTATCCTATATTAGAGATTTATTCATCAATTTCTTTTTAGGTAAATGAGGTGAATGTACCCTTTTCACAAGACTGTTATGTTTAATGGTCATTAGTATCTTCAATCCTTTAAATTTTTAACTATTTAAACAAAAAAAAAAACATATAAACCTATGTGTATTTATATGTATTTATGTATGTATTATATCTTCTTTGCATCAAATTACAAGAAAATGAATTATCGCTTATGCGAGGCGTTTCTAATGCAGCATGTATAGGGAGGACGGTAAATTTGATGTTATTCTCTAGTCTTGCTGCCGTCTTACACAATTTTATTTTTCCTTTTCTGAAAGTTGATAACTCCATTGTGGAGTTTTTGTTTTATTATTTTAACAAATAGGATTGTAAAAAATAATTTGTTTTACTCTCCTCTTCACTGTGTCTAATTTTATCCAACTATGACACCTTCCGCTATACTGAGAAACCCGCAAATGTGAAAAGGGTCCATTTTCAAATTGTTGTTAGTCGCTATTTAACTCATGCAAAATGAAATTCAAACCCCAAAAAAACTGATTCATTAGATTTCAGCTTTTTAGTCAATGAAAGTCATGGAACAGTCAATCTGATATTTAGATTAAAGTGGGAACCCTGTAATGTAAAAATATAAGAAATGACGTACAGCCTCGATTTTCTGAGCCTCTGCTTTGAGTTTGGCCTCTTCGACGGCTGCTTCTCCTTGAATACGAGCTGCTTCGGCTCTAGATTGTGCCTCTGCTTTTGCTGCTCCTGTACTCTCCACCGCAGCACTAGAATGAACACACACATCAATTATTATTGACCGTGGACAAGTTAAACGTTAACATAGCATTGATCTTTGTGGTCAGCTTACCTCTGAGCCTCCAGCTCCAGCAGCTCCTTTCTTGCTTTCTCTGCCTCCGCCTGGTCTGTGATCTTCTGCCTCTCCAGGCGACCCCGAGCCTCCTGCTCCAGACGCTCTGCCTCGTGTCTGAAAGAAAGAAAATTAATGTAAAAACGGACAAAAACATATAACAGAAGCTTGAGTCTTCCTAAAAAAACAGGTTGTATGGGTTTTGGAAGATATCTTATTTGAAGTTTGTAACAAAATCCAAAAAAAAGTGCACGATAAATGACAATATTGTCTCTCAAAAAGAAAAAGTTGTTTCTGAATGACCTTAGGGAGGTAATATATTTTCAAATTCTTTGCCTGCTATTGAGCTACACAAAGTTAACATATTTGGTTTTTTAAGCCAATTGTCCTTAATTTTATGTATATGTACAATGTATGAATGAACATATGAGTGAACTTGTATCTTTCTGTATTTGCTTATGCATACACACATATTAATAATATGGTGTAAAACAGATGCATAGCAATGGTGACAATTTGCTTTATTTTTCAAAACTTTTTGAAATTGTTGTTTAATTAATCAATAAAATAAATAATATATTAATAAATAATTTTTATTAATCAATAAAAAGATGTGAAAACAGTTATATTTGCATGATTCCCCCTGCCCAAACAATTCAAACACTCTGAAATGGGCATTTCGAAATAGGATAGATACATAAAGAGCAATCAAAAGTTGGCCAGCAGACTAATCCGAGCTGAGTTGGCTTATGGAATGGTTTTCAGAAGTGTTAACCTTAATCACTGAGGGGCATAACGACTTACTTTAAGCATAAATATTGTGCATTAATACTACATGTATAGTCTTGTGATGTACCGACATCCAAAACATCAGTGACAGACCATGTTTTCTGAGTCACAAAAAGTCTCTTTTTTAATCTTGGCATTGCATTTTGTCTGAATGCAAACAATTTTTAAAAATGCAAAGGAATTTTTTACCTTT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- Variant Notes
- None
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
- DNA/cDNA Change
- 22490 bp deleted (1)
- Transcript Consequence
- None
- Protein Consequence
- None
- Flanking Sequence
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TGTTCTGATCCAGGACATGGATGTAGTGGTGAGGTGGGATCCTGATGATTGAGGCTCCGAGCAGGTGATCAGCGTCCATG ... - Additional Sequence
- None
Fish
Fish | Genomic Feature Zygosity | Parental Zygosity | Affected Genomic Regions | Phenotype | Gene Expression |
---|---|---|---|---|---|
mvpnju209/nju209 (AB) | Homozygous | ♀+/- ♂+/- | 4 figures ![]() | ||
mvpnju209/nju209; pd41Tg (AB) | Complex | Figure 3 ![]() |
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Supplemental Information
- Genotyping protocol
- None