Genomic Feature

as58

ID
ZDB-ALT-210702-9
Name
as58
Synonyms
None
Affected Genomic Region
Construct
None
Type
Allele with one delins (1)
Protocol
embryos treated with
Lab of Origin
Chen-Hui Chen Lab
Current Source
Other Pages
Notes
Comment Citation
A 3523 bp deletion between exon 1 and exon 4, which causes an early stop codon Zebrafish Nomenclature Committee
Genome Browser
Variants
Variant Type
Delins
Variant Location
Chr 21: 38745234 - 38748756 (GRCz11) (1) Details
Nucleotide change
CATGAGCTCGACGGATCGGCGCAGGCGCAGATCAGCCGCTGCTTTAATAAACTCAGGTCTCTGAGCCCGTCTGACAGCGCCAGTCTGAAAACTGAGCTCAATTTAATGTTCGACGAGCTCATTTCAGAAAACTACAGCAGCAGCAACCATGACAACATCCACCCAGAGGTATGAGCATATTTATACTGCTTTTATTAATGCCTACCAGTTAATTAGACAAAAAAACACATTAAAAATTCTATAGTAGAGTGTTTCCCAACCCTGTTTCTGAAGGCACAGCAACAGTACACATTTTCAACCTCTTCCTAATCAAACACACCTGACTCAGCAGAACATAAGAAGAGAGGAAGACATCCAAAATATGTACTGTTGGTGTGCCTCCGGGAACAGGGTTGGGAAACACTGCTGTAAGTTAGTAAACATTACAGTGTTTTTGAACCGTACTATAATAAAGTCTGTTGTGGTAATTCTGTTGTTGCTGTGGTATTACCACAACTGTAGTAATGTAAATAAATGACTGTACAGTATACATTTTTCTATTTTATCTGTATTTTTTTAAATGCAATTTATTCCAGCTGCCATTAATTCCCAGCTGCCATTACTTTCTGTTTTAATTTGGGTGCTACTATTATTGGTTATTCACACTATTTAAACTAAAGGGATAGTTCAACTCAAAATGAAAATGTTGTGATTAGGGCTATACAATATATCTTTCCAGCATCAATATGTCAATGTGATCATTCGCAATAGTCACATCCATAACATACACAATGTTGAGTCTGGATTCATTCATTCAATATCCTTTGGCTTAGCTCCTTTGATCAGGAATCGCCACAGTGCAATAAACCGCCAACTTATCCAGCATATGTTATACACAGCGGATGGCCTTCCAGCGGCAACCCAGTGCTGAAAAACATCAATACACACTTATTCCCACTCAAACACTACAGCCAATTTAGACTGTGGGGGAAACCAGAGCAGCCGGAGAAAACCCATACCACACAGGGAGAACATGCAAACTCCACACAGAAATGCCAACTGACCCAGCGGGGGCTCAAACCAAGGACCTTCTTTGAGGATAGATTATAATTTATAATTTCGCAAATATTTTTATGAGGCCTGTGTGAGGGTGTAAAAGCATTCAGGCCTATGAAATTGTACTGTTTGACAAATGAATAACTTGAATTGTTGATAAAATTAAGTCTATACAGTATTATTTTACATTGATTATTATTCAACTACTGAATACCTGAATACAATTTAACTCCTAGAAGAAAAAAAAAAGTTTATTTAATCGGTATCTTTTTCTTAATTGAATTTATCTACATTTGTAGATTGTTTCTAATGTTTTATGCAGATGTACTCCCGTACAGGATCATACCAATCAATCTAAAATGATAAATTCTGTCCAAATAGTTATTCAACTCATTTAGTGAGATTGTATTTATAGCGCAATATACAGTCAGAATTATTAGCCCCCGCTTTGAATTCTTTTTTTCTTGTTTAAATATTTGCCAATCGATGTTTAACAGAGCAAAGACATTTTCACAGTAGGTCTGATAATATTTTTTTCTTCTGGAGAAAGTCTTATTTAAAACAAAAATACTATGGAAGTCAATTCCTGTTTTTTTCCAATTTCTTCAGAATATTTTTGTTGTTGTGCCTGGAAGGGCATCAGCTGTGTAAAACATATGGCAGAGTAGTTGGCGATGCATTCCCCTGTGGCGACCCCATGATAAATTAGTGACTAAGCCGAAGGAAAATTACAAAAAAATTCCCTTGTGTTAATCAGAAAAAAGTTGGTTTGAAAAACTCAAAAAAGTTTGAATTAAGTGAAGGATGAGTAAATGATGACAGATTTTATAATGCAGCATATTTTTGCCAGTGTTTTTGTTAATTAATGTGTTTGGGGATACTTTCGTTGGAATCTAACAGTGTTTATATTGAAAATTATTTGTAAAATCCTAAGTTTATTTATTTCCACTTTGACCAATTTAATGCACCACTTGTAAAAAAGAGAATTGACATATCCCAAATTTTACAACCAGTATTGTTATACAGTACATTCATGTGCATGTACATGTTTTTGATAGGTTGTGTGTGAGATTCTGGTGCAAGCAAGTCGTCTGGTTCCTCTAAGTCAAGAACATCTCATCATCAAACTCTGCCAAATGATTCATCAACTTCTAAACCAGCTACAGGTATTTACCATAGGGTTGGGTTAAATGGTCAAAACGCATCATGTTAATAATCTTGTATTTTTTATATCAGTAGATGCAGATAATTCAATTTCTTTTCATTTTGAAGGCAGATATTTTCTCCTGAGTAAAAGCTGTTTAAAAAAAGGACAATTGTTAAATAAAAGTACATTTTATTGTCAGTAAACATGTCAACCAGATGAACCTTTTAGAAATCTAAGATCAAAAGTACTAATAATGCTAAATGTTTATGAATTATTTGTATTTTTTATGAATGGATGTAATTTTAGGTTATTGAGTAAAATGATAACATCTGTAAAAAATTGTAATATTTGGAAATTAAAATGTAAATACCTAAATATTGCCAACCATAATCATATGTAAAACCACACATATAGCACCTCATTACCATAGGGTTTCAATGATAATTGTTTGAAAAATGAAAAACGCTAATATGAATGCACTGAGTATACATACTAATGCTATTGCTTAATAACAGTCACTGAATTGTTATATTACATTTATTCAATCTGCATTAATAATATGATGAAATGAATATTCCCCCACCCAGTCATTTCCCAATATCATGTTACAGTTACAGGTAAATACGTTGATCCTGCTTTCTAACTGGATTAATCATGACACAATATTTCTCTTGTATGTCAGTGCTGAGTTTACATCCTAATATGCAGTGATTTATTTAATTATTATTATTTTTAAGTTTGGAAAAAAAATTAAAATCCCATATGCGAAACAGACTGTTTTAACAACTAAATGCCATTGGCTGCTTTTTTAAAGGGGGAGGGGCTACTTTGTTTTGCACTGTTTTCATTTTACTTCAAGTTACGTGACACATCAAACACAAGGCATATCACATACTAAAAGTGATACTGCACAAATTATTATTAATAAAAATGATTACTTATTATTGTTACTGACACGATTCTAATCAAGGCTTTCCTATTCCTCTGAAAAAAATCTCCTGTTTTACTACTAACAGATAATAGTGGATGAACATACGCTTGATGTTTTGGTATCGTACTGCTCGCGGGCTCTGCGGACATGCAGTTCATGGACTCATTCAGAGGTGCTGCTTGCTCTTTCGTCACTGGTGTATGGCAATGGATCCAAATGCCAAAGGGTAAGAATTGCTGATATGGAAGCTCTCTCTTTTTTTTTTCTGGATGTTTTGTTTTATATTGTAATTAAATTTAAATTTTTAATCCTTCCAGTATCTTCCAGAACTTCTTGGACCAAGTGGGGTTCTGGTTAAGTATGGTGACCCCAAGCAGCCAGACATAGAGTTGCGGCGTTCAGCTGTGCAT/ACATGAAA
Variant Notes
None
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
DNA/cDNA Change
8 bp inserted / 3523 bp deleted (1)
Transcript Consequence
None
Protein Consequence
None
Sequences
Flanking Sequence
TGAAACTTAAAAGTCTGTGTGCGTAAACCCCATTCAAGCGTGGTACTGTGATAGGTTGCCATTCCTGAAATAACATTAATTATTTAACTGTTGGTGATATTAAAACAAAGTGGAAGCAAATGGGAACATCAGAAACTGATTGGTAAGTCACGTAAGATCACAGAGAATTTTTTGTTGAACATTTTGAAAGAAATTTTCACCAATGAGAACATTTTTACAAATAAAATGATATTTTTTTGTGTAACTTATCCCTTTCATAGACAAATGAAGAAAAAAAAGAATGCAACAAAGAACTTTTAATTTACAAACTGTCGATTCCGGTTGACATCGGATGTGGTTCCTGGTTACCATAGTAAAGCCGCTGTTTTGACCCCGTAAAGATGGCCGGTAAGGGAACGTTTTTGGGTTCGAACTCAAGTTTTTCTCCAGATGGAAAGACTCAAGGATTTAAGTCCGCATCAGCAGACACCTCAAGGTTTGTCTCTCTGTCAAAGCCGCAG
CATGAGCTCGACGGATCGGCGCAGGCGCAGATCAGCCGCTGCTTTAATAAACTCAGGTCTCTGAGCCCGTCTGACAGCGCCAGTCTGAAAACTGAGCTCAATTTAATGTTCGACGAGCTCATTTCAGAAAACTACAGCAGCAGCAACCATGACAACATCCACCCAGAGGTATGAGCATATTTATACTGCTTTTATTAATGCCTACCAGTTAATTAGACAAAAAAACACATTAAAAATTCTATAGTAGAGTGTTTCCCAACCCTGTTTCTGAAGGCACAGCAACAGTACACATTTTCAACCTCTTCCTAATCAAACACACCTGACTCAGCAGAACATAAGAAGAGAGGAAGACATCCAAAATATGTACTGTTGGTGTGCCTCCGGGAACAGGGTTGGGAAACACTGCTGTAAGTTAGTAAACATTACAGTGTTTTTGAACCGTACTATAATAAAGTCTGTTGTGGTAATTCTGTTGTTGCTGTGGTATTACCACAACTGTAGTAATGTAAATAAATGACTGTACAGTATACATTTTTCTATTTTATCTGTATTTTTTTAAATGCAATTTATTCCAGCTGCCATTAATTCCCAGCTGCCATTACTTTCTGTTTTAATTTGGGTGCTACTATTATTGGTTATTCACACTATTTAAACTAAAGGGATAGTTCAACTCAAAATGAAAATGTTGTGATTAGGGCTATACAATATATCTTTCCAGCATCAATATGTCAATGTGATCATTCGCAATAGTCACATCCATAACATACACAATGTTGAGTCTGGATTCATTCATTCAATATCCTTTGGCTTAGCTCCTTTGATCAGGAATCGCCACAGTGCAATAAACCGCCAACTTATCCAGCATATGTTATACACAGCGGATGGCCTTCCAGCGGCAACCCAGTGCTGAAAAACATCAATACACACTTATTCCCACTCAAACACTACAGCCAATTTAGACTGTGGGGGAAACCAGAGCAGCCGGAGAAAACCCATACCACACAGGGAGAACATGCAAACTCCACACAGAAATGCCAACTGACCCAGCGGGGGCTCAAACCAAGGACCTTCTTTGAGGATAGATTATAATTTATAATTTCGCAAATATTTTTATGAGGCCTGTGTGAGGGTGTAAAAGCATTCAGGCCTATGAAATTGTACTGTTTGACAAATGAATAACTTGAATTGTTGATAAAATTAAGTCTATACAGTATTATTTTACATTGATTATTATTCAACTACTGAATACCTGAATACAATTTAACTCCTAGAAGAAAAAAAAAAGTTTATTTAATCGGTATCTTTTTCTTAATTGAATTTATCTACATTTGTAGATTGTTTCTAATGTTTTATGCAGATGTACTCCCGTACAGGATCATACCAATCAATCTAAAATGATAAATTCTGTCCAAATAGTTATTCAACTCATTTAGTGAGATTGTATTTATAGCGCAATATACAGTCAGAATTATTAGCCCCCGCTTTGAATTCTTTTTTTCTTGTTTAAATATTTGCCAATCGATGTTTAACAGAGCAAAGACATTTTCACAGTAGGTCTGATAATATTTTTTTCTTCTGGAGAAAGTCTTATTTAAAACAAAAATACTATGGAAGTCAATTCCTGTTTTTTTCCAATTTCTTCAGAATATTTTTGTTGTTGTGCCTGGAAGGGCATCAGCTGTGTAAAACATATGGCAGAGTAGTTGGCGATGCATTCCCCTGTGGCGACCCCATGATAAATTAGTGACTAAGCCGAAGGAAAATTACAAAAAAATTCCCTTGTGTTAATCAGAAAAAAGTTGGTTTGAAAAACTCAAAAAAGTTTGAATTAAGTGAAGGATGAGTAAATGATGACAGATTTTATAATGCAGCATATTTTTGCCAGTGTTTTTGTTAATTAATGTGTTTGGGGATACTTTCGTTGGAATCTAACAGTGTTTATATTGAAAATTATTTGTAAAATCCTAAGTTTATTTATTTCCACTTTGACCAATTTAATGCACCACTTGTAAAAAAGAGAATTGACATATCCCAAATTTTACAACCAGTATTGTTATACAGTACATTCATGTGCATGTACATGTTTTTGATAGGTTGTGTGTGAGATTCTGGTGCAAGCAAGTCGTCTGGTTCCTCTAAGTCAAGAACATCTCATCATCAAACTCTGCCAAATGATTCATCAACTTCTAAACCAGCTACAGGTATTTACCATAGGGTTGGGTTAAATGGTCAAAACGCATCATGTTAATAATCTTGTATTTTTTATATCAGTAGATGCAGATAATTCAATTTCTTTTCATTTTGAAGGCAGATATTTTCTCCTGAGTAAAAGCTGTTTAAAAAAAGGACAATTGTTAAATAAAAGTACATTTTATTGTCAGTAAACATGTCAACCAGATGAACCTTTTAGAAATCTAAGATCAAAAGTACTAATAATGCTAAATGTTTATGAATTATTTGTATTTTTTATGAATGGATGTAATTTTAGGTTATTGAGTAAAATGATAACATCTGTAAAAAATTGTAATATTTGGAAATTAAAATGTAAATACCTAAATATTGCCAACCATAATCATATGTAAAACCACACATATAGCACCTCATTACCATAGGGTTTCAATGATAATTGTTTGAAAAATGAAAAACGCTAATATGAATGCACTGAGTATACATACTAATGCTATTGCTTAATAACAGTCACTGAATTGTTATATTACATTTATTCAATCTGCATTAATAATATGATGAAATGAATATTCCCCCACCCAGTCATTTCCCAATATCATGTTACAGTTACAGGTAAATACGTTGATCCTGCTTTCTAACTGGATTAATCATGACACAATATTTCTCTTGTATGTCAGTGCTGAGTTTACATCCTAATATGCAGTGATTTATTTAATTATTATTATTTTTAAGTTTGGAAAAAAAATTAAAATCCCATATGCGAAACAGACTGTTTTAACAACTAAATGCCATTGGCTGCTTTTTTAAAGGGGGAGGGGCTACTTTGTTTTGCACTGTTTTCATTTTACTTCAAGTTACGTGACACATCAAACACAAGGCATATCACATACTAAAAGTGATACTGCACAAATTATTATTAATAAAAATGATTACTTATTATTGTTACTGACACGATTCTAATCAAGGCTTTCCTATTCCTCTGAAAAAAATCTCCTGTTTTACTACTAACAGATAATAGTGGATGAACATACGCTTGATGTTTTGGTATCGTACTGCTCGCGGGCTCTGCGGACATGCAGTTCATGGACTCATTCAGAGGTGCTGCTTGCTCTTTCGTCACTGGTGTATGGCAATGGATCCAAATGCCAAAGGGTAAGAATTGCTGATATGGAAGCTCTCTCTTTTTTTTTTCTGGATGTTTTGTTTTATATTGTAATTAAATTTAAATTTTTAATCCTTCCAGTATCTTCCAGAACTTCTTGGACCAAGTGGGGTTCTGGTTAAGTATGGTGACCCCAAGCAGCCAGACATAGAGTTGCGGCGTTCAGCTGTGCAT/ACATGAAA TGCATTGCTAATCTGTGTCTCAGGTCAGTTTTTGCAAATGGCTGTTATTTCAAAAAATAGATTCAGATAAATGCTGGAAA  ...
Additional Sequence
None
Fish
Supplemental Information
Genotyping protocol
None
Citations
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