Genomic Feature

bns399

ID
ZDB-ALT-210518-2
Name
bns399
Synonyms
None
Affected Genomic Region
Construct
None
Type
Allele with one deletion (1)
Protocol
embryos treated with
Lab of Origin
Stainier Lab
Current Source
Other Pages
Notes
No data available
Genome Browser
Genome Build: GRCz11Chromosome: 5
Variants
Variant Type
Small Deletion
Variant Location
Chr 5: 479892 - 496598 (GRCz11) (1) Details
Nucleotide change
TACAGGAGGTCGGGTTCCCCTGCGCTGAGGCTGAATGCTGACTTTCTCCTGCGGCTCTAATGACACAGGAGGGCTCAGATTGTTCAGTCTTCCTCATCCTCAGCACAGAGACAGGAAACAGGAAAAGGAACTGCACTCCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGGGTGGAGGAGCGCAGGCAGAAAGCGAGAGTTGAGTGTGTTTCTGTGATGAACAGAGGATCATCATGTGTCTGCTGGACTCCTGCACTGCTCTGCTGCTGCTCGGCTGCTGGATGTCAGGTACACTGCTCCACCTGTTCCTCTGCTCACCTCAGTACTCTGATCTGTCATGATGATGATGATGATGATGAAAACAGCCCAATCGCCAGTGTGGGTTCACAGTGAGAGTTATTCTGCCGGTGTTTCTCCATCAGTGTGTGTTCTTCACGATAGAGGAACGACTTCACTAACTCTCTGCTCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTATGTGTGTGCGTGTGTGTATTTCTCAGCATGTTTGAGTGAGTATATTTCTGGGTGTGTGTGTGTGTTTCTGTGTGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTTCTCAGCATGTTTGAGTATGTTTCTGGGTGTGTGTGTGTGTTTCTGTGTGTTTGTATGTGTGTGCGTGTGTGTATTTCTCAGCATGTTTGAGTGAGTATGTTTCTGGGTGTGTGTGTGTGTTTCTGTGTGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTTCTCAGCATGTTTGAGTATGTTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTATGTGTGTGCGTGTGTGTATTTCTCAGCATGTTTGAGTGAGTATGTTTCTGGGTGTGTGTGTGTGTTTCTGTGTGTTTGTATGTGTGTGCGTGTGTGTATTTCTCAGCATGTTTGAGTGAGTATGTTTCTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCTGTGTGCGTGTGTTTCTGTGTGCGTGTGTGTATTTCTCAGCATGTTTGAGTGAGTATGTTTCTGGGTGTGTGTGTGTGTTTCTGTGTGCGTGTGTGTATTTCTCAGCATGTTTGAGTGAGTATGTTTCTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTTTCTGGGTGTGTGTGTGTGTGACCACCTACATGTCTTCCTCTGTTTCTTGCAGTATGGCTCTGGTCCAGTTATAATAAACAGTCTTCTGTGTGAGTTTGTGTCGTGATAGAGGACGCTCCTCAGTGTGTGAATGCTCCACTGTTGGAACTTAACATCAGGGATGTTAGATTAACTCAGTAATGCCGTCTCCTCATAATTATTCCCTCAGCAATGATAAGAACACATTGAAGAGTCACGAAACACCAGAACACGTGTGTTGAGCTGTAGACAGTCGTACATGTGTCCCACGCTGCTAAAACACTATGAGGACACGTATATCTCACTAACAGGTGAAAATTGGTTGTTTTTGCGTTATTTCCAGCAAATTCATTCTTCTGGTTTGAAGTAAATGTTAAAGCTGCGTCACAGCGATTAGATCCTTGTGTAAATCCCGCCATTGAGACTGGATGTCTGTACCGGCGAGAGTGTTCAGCTTTAACTCATGAGAAAGATTTGCTTCACCTGAGAGCTTTTCTCATCTGGAAATGGTGAAATCCGGATAAGCCGCTCGTCTCCTTTTAATAAAGAAGCAGCTCCAGTTGGTGTTGATTGTTCTGTCTCTACACATTATGGCCCTCGGCTATAATGATCTCTTATGATGATCTCAGTTATGAGGATCTATGGCCCAAACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGAACAGCATTAGTAAACACACACACGTCAGATTCTCACTGATGATGGCAGATGAAGATGAGCATCTCGGACGATCAGTCTACCAGCAAAGAAACCGTCGATATACAATAAATACAAAATAAATAGGGCTGTCAACATTAGCGCGTGATTAATTTTAAATATTTAACACGTAAAAAATTACGCAAATAAAGCTGTTGCAGATTTTTTTTAATTTGCTGTTGTGGCCGACGTGTGTTCAGGGATGGCGCGTGCATAGAGGCGATCTAGGCGGTCGCCTTGGGCTGCAGAATAGTGAGCGAACCCCCCGGTCTTAACTTTCATATGTGAACCGGTCACTTCCGGGTTGAGGGCGGTGTGATCGCCGTTTGCCTCGAGCGCCAGTTCAGCTTGATTCAGCCCTGCATGTGTTTAACGTGCAAAGAAATTTGGATAAGACCAAGGAAACACTTTTAAAAGGAAAGTTTCAGTATGAAACAATTAATCACGCATCAGACAGAGGGATTGACACGGTACTGGCCCAAGGACCAGCTGGACAAGAGCAACCTGTGGTATTCCTGAGTCGGAAGCTGTTGCCCAGGAAGACTCAATACTCTACTATAGAGGAGTGTCTCCGCTTCTGCCTCCAGCGGCAGGAGTCTGACCATCAGGCACTTACCTGGATTAACTCCATGACAGATACTAACGCCAGAGTGACCCGGTGATGCCTGACACAGCCCTTCTAATTCCAGATAACTGATTGCCCTGGAAGGGAAAATTTAGTAGAGCAGTGGTTCTCAAACTGTGGTACGCAGGCTTCCTTCTAGTGGTATGCGGAGGAATGAAATATGTCAAGTACATGCTACACACATTTCAAAATTTACCAAAAACTATGTATATAATGTGCCATATATGACATATAGCCTATATTTCTGAGGTAATGTGCCACGTTTTTTTTAACAGTGTAGAGTTGTAGCTGCTTTACTGGGCCTACGCTACTGTATTTCAATACTGCTCATTTTGGTGGTACTTGGAGAGACAAATAGTTTCTGAGGTGGTACTTGATGAAAAAAGTTTGAGAACCACTGTAGTAGAGTAACTTCTTGTCGAGGTTCCCTGACACTACGTGGCTAGGAGAGGGAGAGGATAATGTGAAGAAGTGAGCCTTCTTCCCTCCATCTTGATCATGGATCATCATGCCTGCATTGGTACACACACACTTACATAGCCACTTACCTGTACTTTTCCCTTCCGTTCGCTGCAGATGCAGAGTGTACACGTCATCTTACAGCATCCAGTCATTCCCTTCACTTCTCCATCTGTCCTCTGTTTACACTGAGCACACATTCACACACACCTAGTCTTCGTGTCTTTGTTGGACTTCAGAGCTGGGCCGGCCAAACCAAGTTCAGAGCTGGCGCCGGCTAATGACATCACAAGCCGCGCCATGGCAGCACCATGCACTGAAGCTCCAACCGTACCATTGTGTTTGGGTACAGCCACCGCAGCTGATCGTCCTGTATGAGGAGAGAATGTTCATCTAATCAATATTCTGTGTTTGTGTTGTGTTTGAGTCATTAGGTTGAGGTTTATGCCGCAAAGGCAATACTTACCTATTATTGGTATGGCTTAATCAAGCAGACACCAGACTGGAGATCTTGGTCAGAGCATGTTGTGGCAGATCTGTGAGCAGTTCTCTTGTGTTGGATCCTCTATTATATATTGTGAATATAGTGTTTGTTTATTTTTGGAGTTGTATATAAGTCTATGATGATGATGATGATGAAGCTTTATTTGTCTCATACACTTTCATGCAGCCAAATTGAACAGGGAATAGTCAACTGTCTGGGATTAGTTAAGCGTAGGGGCCGTAAGGGGCTGTAACACTCCAAGAGCTCCTCAAATACTAAAGCTCAGCTGTTCAGGGCTTTCAGTGCTGACAGAACCGTTCTGATATGATCATATCTCCACCCAATAGTCCAGCACTGTGGTCATGGAAGGTTCTGTTCGGTGTAAAGATCATCACGCGTCCCTGTAAACCACCTAGTCTGTGTTTCCTCAGTGAATGAAGGTGATCAGTGTGTGCTGTGTTTGCAGGCAGTGCAGTCCGCATCTCAGACGTGACTCTGGTGAACCCTGACCCGGTGGTGTCGCCTCTGACCGCTCCATCTCTCCTGTGTGTCAGCAGTGACTGGAGCTCCGGCGGGTCAGTGCTGGCTCTGGGTCAGGAGTTCCCCCGTCCACAGGGGTCAGTGCTGGCTCTGGGTCAGGAGTTCCCCCATACGGAGCCCCGCCCACACCCCGCCGCCGCTACCGTCACCTGGAGCTCCCGCAGCCACGCATTCGGGGCCTTCTACTGCCAGATCAGAAACTCTACTGGCAGAAAAATCTACACCTACAAGATGCTACAGGAAGGTACCGACCGCCGCTAATAACTGATGATCACAGCTCACCTTAGCAGACACGCTTTCACTGCTTCTGCTTCCTCCAGCTGCGTTCCTGCCCGAGTCTCTGACCATCACCGTGAACCAGGGAGAGAACATCAACATCTCCTACAGCAGGAGGCTGTACTCGCCTGAGGACACGGTCATACATAAAAACGGTGAGGGGCGCGTGTGTGGAGCGAACACTGATGAACACACACACACACACACACACACTTATGCTCTGTTCAGGTGTGAGCGCAGATTCAGATGCTCAGTTCTGCAGCTGCTGCTCTCTGTTGTGTTTTCTTCAGGTCATTTCGAACACTCGTCCCCTAAAGAGGACATCTCAGACATCATCCACTACCCAGTGACCAACGCTAAAGCTGAGAGTCACGCGGGAATATATGCTATACGCTACATCTCTGCAGCGCCGTCCAGCGCCGCTATCACACGGCTGATCGTCAGGAGTGAGTCTGCACACACACACATCATCATCACTGAACACACACACACACACACATCATCATCACTGAACACACACTCATCTGGGTTTTATTAATATGTGGTCTATAAATAAGCAGAACTAACCAT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Variant Notes
None
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
DNA/cDNA Change
16707 bp deleted (1)
Transcript Consequence
None
Protein Consequence
None
Sequences
Flanking Sequence
ACACACATTTGTTTTTGTGAAAAGTGGGGACATTACATAAGTTTCCATTCATTTTATTCTGTCCAAACCGTATATTATATTGCCCTAAACCCAACCATCACAGGAGTCAGTGTGCAGCTTTACTCTGATTAAACTCATCCTGTGGGATTTATTAGCATTTTGAGAAACGAGGACGTCACCAATGTCCCCATACGTCACCTGCTTTTTGCAATACCTGTGTCATACCCATGTCATTATACAGATTTGTGTCCTGATATGTCAGAAACACACACTCGTGTCCAGGTTATAGTTGTCATGAGTGTCCAGAACTGAAGTAGTGTTGATGATCAGTTTATATAGTCATTAATGGCCGGTAAGTACCCCGCTGGAGGCTCTACACACTCGCGCCGCTTCCTCTGAGGACACACTGAAACTGCCTCTGATTATCTGTTGTGTTTCAGACCTGACATCAGAGATCATTCAGGCTGAACACATCTGTAGGTCCACCCTGCAGGCTGGGT
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GATGCGCTGCCGCAATAATGAAGAATATGATGCACACACACACACACACACACACACACACAGTGTTGATTAGTGAGGGA  ...
Additional Sequence
None
Fish
Fish Genomic Feature Zygosity Parental Zygosity Affected Genomic Regions Phenotype Gene Expression
tekbns399/bns399; s843Tg/+ComplexFig. 1 with image from Jiang et al., 2020
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Supplemental Information
Genotyping protocol
None
Citations
TSV
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