Genomic Feature

nub22

ID
ZDB-ALT-171003-9
Name
nub22
Synonyms
  • del (1)
Affected Genomic Region
Construct
None
Type
Allele with one deletion (1)
Protocol
embryos treated with
Lab of Origin
Hibi Lab
Current Source
Other Pages
Notes
No data available
Genome Browser
Genome Build: GRCz11Chromosome: 14
Variants
Variant Type
Small Deletion
Variant Location
Chr 14: 34492786 - 34497132 (GRCz11) (1) Details
Nucleotide change
TCAGTTCGCATGGGACAGGTGGAACTGCCCGGAAAGCGCACTGCAGTTATCGACGCATAAAGGCCTGCGGAGTGGTAAGTTAAATATTCGTCCTATCAAAAATAGACTTTAAATAAACATTTCTTTTAAGAGAAAGTTCTGGCTAGAATCTCAAAGCGTTTATCAAACTGAAAAAAAGTTTAGACTTTCAGTAGGTATACTGCTACAATTTTTTGAAAAGTTCATTGCGATGGTTAAATGATCCTGAAAAACTGTTTACATGTGTACTCCTAGCGGTCAAAACCAGACTACATAAATATTTTCAATCAAAGCCTAATATAAAATGACTGTATTTTTTTAAACGTAAAACTTTATACATACAATTTATTTAACAATTTACCATGCATGTGAAATAAAAAAAAAAAACAATTAGCCCTAATAAGAATGGGTGTTGTTAAAGTTTTAGAACAGTTTTTTATGTTTTGATACATTTTAAATGTTGACTACTGTATATCTATTCTCCAAATGTGTTTATTAGGTAATGCATTAAATGTATATATTTGAAATATATAGCCTTTAATACGCAAGTCGGTGATTTTTCTCCACCACGCAAGAAGAACCAGGTTGTATAAATTTGACCCATAATATTTTATGATAAACTTTTTTTGTTCGCCTGTTTGTTTCTTTAGCCACCAGAGAGACCGCCTTTGTGCATGCTATAAGTGCTGCTGGAGTTATGTACACTTTGACGAAAAACTGCAGCATGGGGGACTTCGAAAACTGTGGCTGTGACGACTCCAAGATCGGAAAAATGGGTAAGATAAATGTATGATTATTATTATTAATATTATTATTATTAAGTTTTCACACCAATAACGTGAAACTTTTTATATTTCGAAGGTGGTCGTGGTTGGGTTTGGGGAGGTTGCAGTGACAATGTTAACTTTGGAGACAGAATTGCTAAACTATTTGTAGACGCGCTGGAAAATGGTCACGACTCTCGCGCCGCGGTCAACCTGCATAACAACGAAGCTGGTCGACTTGTAAGTACCTATGAGTTTGTTCATTTTCTTTACTTTAACGACATGACTCGTTTTTATAACGCATGTGCATATTTCTGATGTATTTTAGGCTGTTAAAGCAACACTCAAAAGGACCTGTAAGTGTCATGGTTTGTCTGGAAGCTGTAGTATTCAGACATGCTGGATGCAGCTTGCTGATTTCAGAGATATCGGCTCCTACCTAAAAATCAAGCATGATCAAGCACGGAAGTTGGAGATGGATAAAATTCGGATGAGGGCAGGCAATAGCGCGGACAACCGTGGCGCAATAGCGGACACGTTCAGCGCAGTTGCGCGCACAGAACTCATTTTTATGGAAGATTCACCTGATTACTGCGTGAAAAACCTCAGCATGGGACTACATGGAACTGAAGGCAGGGAATGTCTACAAAGCGGGAAGAATCTTTCTCAATGGGAGAGAAGAAGCTGCAGGCGGCTATGCCACGAATGTGGCCTGAAAGTAGAAGAGAGGAGGATTGAGACAGTGAGCAGCTGTAACTGTAAATTTCACTGGTGCTGCACAGTCAAATGCGAAACATGCACTCAAACCGTTACCAGGTATTTTTGCGCAAAAAGGCACAGAAATCGCCGGCCGCACAACCATTCACGCAAAAGACAACACACGCGTCGTGGATGAAGTAATCCTCTTTGCAAATATGTAAAGCTGTATATTTCTAATGTAAATATATTTTATGAGATTTTAAGATATAATTTTCTGTATATTTCTGCAAGCAAAATGTAAATTGACGCTCTATATAAGACACATGGGCTTTCTCGTTCCCACTGTCAATTGAATTCATTGAAGTTCTATTTTGAAGTTCATTATTTGCACTTTTTCGTTCTCGACATAAGATCACAGATTTTGTTGCTCTCAAAAAATGTTTGTATTTTTTCATGCACAGATCACTTGACAGTATGCAGTGTTTCACGATGAGGTTTAAATGTTGTGTTTTATGGAACTTATTTAAGGCAAATATTTTATATTGTTATTTTTTAAACTCACATTGTTTATATGTAAATATTAAATTGACTTATTTTGTAGTGGGAAGCACATTAGATATTTAAAACGAAAAATCACTGTCTCCTAGTTGTCAATTTAATTGCGCGGTTTGGATGCCATTGGTTAAAAAGTTTATTGGTAAATTAAAGGTGTAAAATCACACTCAACCACACTTGAATAATGCATCTGCCCCAGCAACTTTGGGATCATGCCCGCAGAGGGAGAATCATCTGTCGTGTATTGGCATCCTTTGAAGTTCTGGAGGCGTTTCCTTGACTTGGCTGTGAAGTATGGACCAATAGCTTGGTAGGAATTCTGCAACAATAGGTATTCTTCCTTCTGACCCCCTTTGGAGGAATATAAAGTACACGACGGAGCGCGCATCACTTCCTCGAATCAGTACATTGCCTTTGTCTTATCACTTTGGATTTAAAATAATGGCTTACTTCTTCCGTTGGGCCTTTCTATTCCCTATTTGGGACAAAGCTATCCTTGGACACACTTGGTAAGTGGATCATCAACTGCGATAATGTAAACAGTTTTGCTTTTGTTAACGCGTTTTTTTAACCTTTTCTATTCATAGGACAATGAACAATTTGCTGATAACTGGGCCAAAGGTAAATTTTCTGTAACTTAAAAAATACGACCACCTTAAAAATCATGAAACAAAACTTGACCACCTAATCATTTGGCTTGTGGCGAAGCGTGAGTGTCAAAACACCCATATCTTTTCCTATCTTTCCAGGCTTATCTTACCTATGCAAATAGTGTGCGGGTTGGGGCACAGAGTGGGATACATGAGTGCAAACACCAGTTTGCATGGGACAGGTGGAACTGCCCGGACACCGCTCTGCAACTCTCTACTCACAAAGGCTTGAGAAGTGGTAAGATATATGCTGTATAACTTTAAAAATAAAAAACAACGCCTGGAAAATAACTGCATGCCCATATTGCATCTCTAGCAACAAGAGAGTCATCATTTGTCCATGCAATAAGCGCAGCCGGCGTAATGTACACTTTAACCAGAAACTGCAGTCTTGGAGATCTAAACGAATGCGGGTGTGACAGCTCGAGGAACGGCAGACTTGGTAAGAACAGTTTTGGCCAATTCGCATACTAAAACATCCTAATATAGACAGAGCTGTTAAATTTATAAACCACAAAGACGACTAACTAATTTAATCATGGAATTAAAGTTGGCTATTTACTGTATTTACATCAGTCACGATGCATTTTACTTTTAGGGGGTCGTGGCTGGCTATGGGGAGGATGTAGCGACAACGTGGATTTTGGAGAGAGAATTTCTAAACAATTCGTGGATGCGCTTGAGACTGGACAAGACGCCCGAGCTGCAGTTAATCTTCATAATAATGAAGCTGGACGTTTGGTAAGCAAAGGGGGCATAAGTGAAATTTTTTACAAGGTATATCTGAATGTAGATAATTTTTCTAATAATAATTATTTCAATGATAATAATAAGCTATTCGGCTACTAAGCTATTAAGTCAAATAAGAATATAGCCCAATCCGCTAGGGGCGCCAAATTTGCAATATGTACTTTATTTTATTCATCGTTAACAAAATGTAGGCTTGTTTATTCAAATACATCAACTTTTGTATTTTGTTTTTTATTCTTTCATAACCCGTTTTAAAATTTTAATCTGTTTTATCTGTCTTAATCATTTTAAATTCTTTTAATTTTTATTTTCTTGTTTCTTTTATTCTTGTTAATGTAAAGCACTTTGAATTACTATTGTGCATAAAATGAGCTATATAAATAAACTTGCCTTAAACCAGTCTTCTTCTGAATACGATTAGCTTAAAATAGCCTACTGTTATATTCTGACTATAGCTCTGTTCATTTGTGAAGCACCACAGTACACGCGTAACTTCTCAAATCAAACAAAGAAGTAACCCCTGCTACGCTAAGGTTTTTATTAACCAGAGCGTCACTGCATCTTTAAAGCAACGATTCATCTAACCATACCACATTGATAGACCCCAAAAATCTAGATAAAACTTTTTAAAGACATAACAAAACAATAGCAAGTAGGCTATTGTGATTCAATAGTCAATTGTATTTGGTGATGCAAACATCCGTTCTTTACCCTAGAGCCAGACCAATTCTTTTCGTGACTGTTGGACTATTCTTAAAACCATCTTTTATAGTTACTGAAACGTCGTGTGTAAATGTTTTTTCCACGCACAAGATATGTAAAATAAGAATTCTTCTGTTCCTGTTCTAGGCTGTAAAAGCGACAATGAAGAGGATTTGTAGATGTCATGGCATGTCAGAAAGTTGCACAAT/-
Variant Notes
A large deletion across the ORF1 and ORF2 of wnt8a gene was introduced by  ...
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
DNA/cDNA Change
None
Transcript Consequence
None
Protein Consequence
None
Sequences
Flanking Sequence
TGTCGTCTGTCTCTTGTGCGTATCCATCTCAGTGTTTGTGCTTTGCATCTCAAGAAGAAGGGAGGATCGAGCAATCACTGGTCACTCACGCAGCAATGAACCCTTGCCAGATTTTTGCGTCGTTGGTTATGTCTATATGCTGTCACATACTGTCGTCAACAGCATGGTACAGTCATATTTCATATATTTTTATTTATTACTATTATTTTATTTATGACATTTTTAAATTTGACTTAACCCATGTTGACCTCATGCTTCCTTTTATTCTGTTTTTGCTACACGTAGGTCTGTGAATAACTTCCTGATGACAGGACCAAAGGTAATTACATTTTTTACACCTAAATTCTTGCAGAGCAATTTGTTATTTTATCTTTACATAAAAAATGTCTAAAACGTATACATGTCTAATCAAAGCTCATATTTTACATAAATCAGGCTTATCTCGCATACACCAGCAGTGTACAAGCTGGGGCTCAGAGTGGTATAGAAGAGTGCAAGCA
TCAGTTCGCATGGGACAGGTGGAACTGCCCGGAAAGCGCACTGCAGTTATCGACGCATAAAGGCCTGCGGAGTGGTAAGTTAAATATTCGTCCTATCAAAAATAGACTTTAAATAAACATTTCTTTTAAGAGAAAGTTCTGGCTAGAATCTCAAAGCGTTTATCAAACTGAAAAAAAGTTTAGACTTTCAGTAGGTATACTGCTACAATTTTTTGAAAAGTTCATTGCGATGGTTAAATGATCCTGAAAAACTGTTTACATGTGTACTCCTAGCGGTCAAAACCAGACTACATAAATATTTTCAATCAAAGCCTAATATAAAATGACTGTATTTTTTTAAACGTAAAACTTTATACATACAATTTATTTAACAATTTACCATGCATGTGAAATAAAAAAAAAAAACAATTAGCCCTAATAAGAATGGGTGTTGTTAAAGTTTTAGAACAGTTTTTTATGTTTTGATACATTTTAAATGTTGACTACTGTATATCTATTCTCCAAATGTGTTTATTAGGTAATGCATTAAATGTATATATTTGAAATATATAGCCTTTAATACGCAAGTCGGTGATTTTTCTCCACCACGCAAGAAGAACCAGGTTGTATAAATTTGACCCATAATATTTTATGATAAACTTTTTTTGTTCGCCTGTTTGTTTCTTTAGCCACCAGAGAGACCGCCTTTGTGCATGCTATAAGTGCTGCTGGAGTTATGTACACTTTGACGAAAAACTGCAGCATGGGGGACTTCGAAAACTGTGGCTGTGACGACTCCAAGATCGGAAAAATGGGTAAGATAAATGTATGATTATTATTATTAATATTATTATTATTAAGTTTTCACACCAATAACGTGAAACTTTTTATATTTCGAAGGTGGTCGTGGTTGGGTTTGGGGAGGTTGCAGTGACAATGTTAACTTTGGAGACAGAATTGCTAAACTATTTGTAGACGCGCTGGAAAATGGTCACGACTCTCGCGCCGCGGTCAACCTGCATAACAACGAAGCTGGTCGACTTGTAAGTACCTATGAGTTTGTTCATTTTCTTTACTTTAACGACATGACTCGTTTTTATAACGCATGTGCATATTTCTGATGTATTTTAGGCTGTTAAAGCAACACTCAAAAGGACCTGTAAGTGTCATGGTTTGTCTGGAAGCTGTAGTATTCAGACATGCTGGATGCAGCTTGCTGATTTCAGAGATATCGGCTCCTACCTAAAAATCAAGCATGATCAAGCACGGAAGTTGGAGATGGATAAAATTCGGATGAGGGCAGGCAATAGCGCGGACAACCGTGGCGCAATAGCGGACACGTTCAGCGCAGTTGCGCGCACAGAACTCATTTTTATGGAAGATTCACCTGATTACTGCGTGAAAAACCTCAGCATGGGACTACATGGAACTGAAGGCAGGGAATGTCTACAAAGCGGGAAGAATCTTTCTCAATGGGAGAGAAGAAGCTGCAGGCGGCTATGCCACGAATGTGGCCTGAAAGTAGAAGAGAGGAGGATTGAGACAGTGAGCAGCTGTAACTGTAAATTTCACTGGTGCTGCACAGTCAAATGCGAAACATGCACTCAAACCGTTACCAGGTATTTTTGCGCAAAAAGGCACAGAAATCGCCGGCCGCACAACCATTCACGCAAAAGACAACACACGCGTCGTGGATGAAGTAATCCTCTTTGCAAATATGTAAAGCTGTATATTTCTAATGTAAATATATTTTATGAGATTTTAAGATATAATTTTCTGTATATTTCTGCAAGCAAAATGTAAATTGACGCTCTATATAAGACACATGGGCTTTCTCGTTCCCACTGTCAATTGAATTCATTGAAGTTCTATTTTGAAGTTCATTATTTGCACTTTTTCGTTCTCGACATAAGATCACAGATTTTGTTGCTCTCAAAAAATGTTTGTATTTTTTCATGCACAGATCACTTGACAGTATGCAGTGTTTCACGATGAGGTTTAAATGTTGTGTTTTATGGAACTTATTTAAGGCAAATATTTTATATTGTTATTTTTTAAACTCACATTGTTTATATGTAAATATTAAATTGACTTATTTTGTAGTGGGAAGCACATTAGATATTTAAAACGAAAAATCACTGTCTCCTAGTTGTCAATTTAATTGCGCGGTTTGGATGCCATTGGTTAAAAAGTTTATTGGTAAATTAAAGGTGTAAAATCACACTCAACCACACTTGAATAATGCATCTGCCCCAGCAACTTTGGGATCATGCCCGCAGAGGGAGAATCATCTGTCGTGTATTGGCATCCTTTGAAGTTCTGGAGGCGTTTCCTTGACTTGGCTGTGAAGTATGGACCAATAGCTTGGTAGGAATTCTGCAACAATAGGTATTCTTCCTTCTGACCCCCTTTGGAGGAATATAAAGTACACGACGGAGCGCGCATCACTTCCTCGAATCAGTACATTGCCTTTGTCTTATCACTTTGGATTTAAAATAATGGCTTACTTCTTCCGTTGGGCCTTTCTATTCCCTATTTGGGACAAAGCTATCCTTGGACACACTTGGTAAGTGGATCATCAACTGCGATAATGTAAACAGTTTTGCTTTTGTTAACGCGTTTTTTTAACCTTTTCTATTCATAGGACAATGAACAATTTGCTGATAACTGGGCCAAAGGTAAATTTTCTGTAACTTAAAAAATACGACCACCTTAAAAATCATGAAACAAAACTTGACCACCTAATCATTTGGCTTGTGGCGAAGCGTGAGTGTCAAAACACCCATATCTTTTCCTATCTTTCCAGGCTTATCTTACCTATGCAAATAGTGTGCGGGTTGGGGCACAGAGTGGGATACATGAGTGCAAACACCAGTTTGCATGGGACAGGTGGAACTGCCCGGACACCGCTCTGCAACTCTCTACTCACAAAGGCTTGAGAAGTGGTAAGATATATGCTGTATAACTTTAAAAATAAAAAACAACGCCTGGAAAATAACTGCATGCCCATATTGCATCTCTAGCAACAAGAGAGTCATCATTTGTCCATGCAATAAGCGCAGCCGGCGTAATGTACACTTTAACCAGAAACTGCAGTCTTGGAGATCTAAACGAATGCGGGTGTGACAGCTCGAGGAACGGCAGACTTGGTAAGAACAGTTTTGGCCAATTCGCATACTAAAACATCCTAATATAGACAGAGCTGTTAAATTTATAAACCACAAAGACGACTAACTAATTTAATCATGGAATTAAAGTTGGCTATTTACTGTATTTACATCAGTCACGATGCATTTTACTTTTAGGGGGTCGTGGCTGGCTATGGGGAGGATGTAGCGACAACGTGGATTTTGGAGAGAGAATTTCTAAACAATTCGTGGATGCGCTTGAGACTGGACAAGACGCCCGAGCTGCAGTTAATCTTCATAATAATGAAGCTGGACGTTTGGTAAGCAAAGGGGGCATAAGTGAAATTTTTTACAAGGTATATCTGAATGTAGATAATTTTTCTAATAATAATTATTTCAATGATAATAATAAGCTATTCGGCTACTAAGCTATTAAGTCAAATAAGAATATAGCCCAATCCGCTAGGGGCGCCAAATTTGCAATATGTACTTTATTTTATTCATCGTTAACAAAATGTAGGCTTGTTTATTCAAATACATCAACTTTTGTATTTTGTTTTTTATTCTTTCATAACCCGTTTTAAAATTTTAATCTGTTTTATCTGTCTTAATCATTTTAAATTCTTTTAATTTTTATTTTCTTGTTTCTTTTATTCTTGTTAATGTAAAGCACTTTGAATTACTATTGTGCATAAAATGAGCTATATAAATAAACTTGCCTTAAACCAGTCTTCTTCTGAATACGATTAGCTTAAAATAGCCTACTGTTATATTCTGACTATAGCTCTGTTCATTTGTGAAGCACCACAGTACACGCGTAACTTCTCAAATCAAACAAAGAAGTAACCCCTGCTACGCTAAGGTTTTTATTAACCAGAGCGTCACTGCATCTTTAAAGCAACGATTCATCTAACCATACCACATTGATAGACCCCAAAAATCTAGATAAAACTTTTTAAAGACATAACAAAACAATAGCAAGTAGGCTATTGTGATTCAATAGTCAATTGTATTTGGTGATGCAAACATCCGTTCTTTACCCTAGAGCCAGACCAATTCTTTTCGTGACTGTTGGACTATTCTTAAAACCATCTTTTATAGTTACTGAAACGTCGTGTGTAAATGTTTTTTCCACGCACAAGATATGTAAAATAAGAATTCTTCTGTTCCTGTTCTAGGCTGTAAAAGCGACAATGAAGAGGATTTGTAGATGTCATGGCATGTCAGAAAGTTGCACAAT/- GCAAACATGCTGGATGCAACTGGCTGACTTCCGTGAGATTGGCAATTACCTGAAAGTGAAGCACGATCAGGCCCAGAAAC  ...
Additional Sequence
None
Fish
Fish Genomic Feature Zygosity Parental Zygosity Affected Genomic Regions Phenotype Gene Expression
wnt8anub22/nub22 (AB)Homozygous♀+/- ♂+/-3 figures with image from Hino et al., 20172 figures with image from Hino et al., 2017
wnt8anub22/+ (AB)Heterozygous♀+/- ♂+/-Fig. S3 from Hino et al., 2017
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Supplemental Information
Genotyping protocol
None
Citations
TSV
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