Genomic Feature
as59
- ID
- ZDB-ALT-210702-10
- Name
- as59
- Synonyms
- None
- Affected Genomic Region
- Construct
- None
- Type
- Allele with one deletion (1)
- Protocol
- embryos treated with
- Lab of Origin
- Chen-Hui Chen Lab
- Current Source
- Other Pages
-
Notes
| Comment | Citation |
|---|---|
| A 3511 bp deletion between exon 1 and exon 4, which causes an early stop codon | Zebrafish Nomenclature Committee |
Variants
- Variant Type
- Small Deletion
- Variant Location
- Chr 21: 38745229 - 38748739 (GRCz11) (1) Details
- Nucleotide change
- CGCAGCATGAGCTCGACGGATCGGCGCAGGCGCAGATCAGCCGCTGCTTTAATAAACTCAGGTCTCTGAGCCCGTCTGACAGCGCCAGTCTGAAAACTGAGCTCAATTTAATGTTCGACGAGCTCATTTCAGAAAACTACAGCAGCAGCAACCATGACAACATCCACCCAGAGGTATGAGCATATTTATACTGCTTTTATTAATGCCTACCAGTTAATTAGACAAAAAAACACATTAAAAATTCTATAGTAGAGTGTTTCCCAACCCTGTTTCTGAAGGCACAGCAACAGTACACATTTTCAACCTCTTCCTAATCAAACACACCTGACTCAGCAGAACATAAGAAGAGAGGAAGACATCCAAAATATGTACTGTTGGTGTGCCTCCGGGAACAGGGTTGGGAAACACTGCTGTAAGTTAGTAAACATTACAGTGTTTTTGAACCGTACTATAATAAAGTCTGTTGTGGTAATTCTGTTGTTGCTGTGGTATTACCACAACTGTAGTAATGTAAATAAATGACTGTACAGTATACATTTTTCTATTTTATCTGTATTTTTTTAAATGCAATTTATTCCAGCTGCCATTAATTCCCAGCTGCCATTACTTTCTGTTTTAATTTGGGTGCTACTATTATTGGTTATTCACACTATTTAAACTAAAGGGATAGTTCAACTCAAAATGAAAATGTTGTGATTAGGGCTATACAATATATCTTTCCAGCATCAATATGTCAATGTGATCATTCGCAATAGTCACATCCATAACATACACAATGTTGAGTCTGGATTCATTCATTCAATATCCTTTGGCTTAGCTCCTTTGATCAGGAATCGCCACAGTGCAATAAACCGCCAACTTATCCAGCATATGTTATACACAGCGGATGGCCTTCCAGCGGCAACCCAGTGCTGAAAAACATCAATACACACTTATTCCCACTCAAACACTACAGCCAATTTAGACTGTGGGGGAAACCAGAGCAGCCGGAGAAAACCCATACCACACAGGGAGAACATGCAAACTCCACACAGAAATGCCAACTGACCCAGCGGGGGCTCAAACCAAGGACCTTCTTTGAGGATAGATTATAATTTATAATTTCGCAAATATTTTTATGAGGCCTGTGTGAGGGTGTAAAAGCATTCAGGCCTATGAAATTGTACTGTTTGACAAATGAATAACTTGAATTGTTGATAAAATTAAGTCTATACAGTATTATTTTACATTGATTATTATTCAACTACTGAATACCTGAATACAATTTAACTCCTAGAAGAAAAAAAAAAGTTTATTTAATCGGTATCTTTTTCTTAATTGAATTTATCTACATTTGTAGATTGTTTCTAATGTTTTATGCAGATGTACTCCCGTACAGGATCATACCAATCAATCTAAAATGATAAATTCTGTCCAAATAGTTATTCAACTCATTTAGTGAGATTGTATTTATAGCGCAATATACAGTCAGAATTATTAGCCCCCGCTTTGAATTCTTTTTTTCTTGTTTAAATATTTGCCAATCGATGTTTAACAGAGCAAAGACATTTTCACAGTAGGTCTGATAATATTTTTTTCTTCTGGAGAAAGTCTTATTTAAAACAAAAATACTATGGAAGTCAATTCCTGTTTTTTTCCAATTTCTTCAGAATATTTTTGTTGTTGTGCCTGGAAGGGCATCAGCTGTGTAAAACATATGGCAGAGTAGTTGGCGATGCATTCCCCTGTGGCGACCCCATGATAAATTAGTGACTAAGCCGAAGGAAAATTACAAAAAAATTCCCTTGTGTTAATCAGAAAAAAGTTGGTTTGAAAAACTCAAAAAAGTTTGAATTAAGTGAAGGATGAGTAAATGATGACAGATTTTATAATGCAGCATATTTTTGCCAGTGTTTTTGTTAATTAATGTGTTTGGGGATACTTTCGTTGGAATCTAACAGTGTTTATATTGAAAATTATTTGTAAAATCCTAAGTTTATTTATTTCCACTTTGACCAATTTAATGCACCACTTGTAAAAAAGAGAATTGACATATCCCAAATTTTACAACCAGTATTGTTATACAGTACATTCATGTGCATGTACATGTTTTTGATAGGTTGTGTGTGAGATTCTGGTGCAAGCAAGTCGTCTGGTTCCTCTAAGTCAAGAACATCTCATCATCAAACTCTGCCAAATGATTCATCAACTTCTAAACCAGCTACAGGTATTTACCATAGGGTTGGGTTAAATGGTCAAAACGCATCATGTTAATAATCTTGTATTTTTTATATCAGTAGATGCAGATAATTCAATTTCTTTTCATTTTGAAGGCAGATATTTTCTCCTGAGTAAAAGCTGTTTAAAAAAAGGACAATTGTTAAATAAAAGTACATTTTATTGTCAGTAAACATGTCAACCAGATGAACCTTTTAGAAATCTAAGATCAAAAGTACTAATAATGCTAAATGTTTATGAATTATTTGTATTTTTTATGAATGGATGTAATTTTAGGTTATTGAGTAAAATGATAACATCTGTAAAAAATTGTAATATTTGGAAATTAAAATGTAAATACCTAAATATTGCCAACCATAATCATATGTAAAACCACACATATAGCACCTCATTACCATAGGGTTTCAATGATAATTGTTTGAAAAATGAAAAACGCTAATATGAATGCACTGAGTATACATACTAATGCTATTGCTTAATAACAGTCACTGAATTGTTATATTACATTTATTCAATCTGCATTAATAATATGATGAAATGAATATTCCCCCACCCAGTCATTTCCCAATATCATGTTACAGTTACAGGTAAATACGTTGATCCTGCTTTCTAACTGGATTAATCATGACACAATATTTCTCTTGTATGTCAGTGCTGAGTTTACATCCTAATATGCAGTGATTTATTTAATTATTATTATTTTTAAGTTTGGAAAAAAAATTAAAATCCCATATGCGAAACAGACTGTTTTAACAACTAAATGCCATTGGCTGCTTTTTTAAAGGGGGAGGGGCTACTTTGTTTTGCACTGTTTTCATTTTACTTCAAGTTACGTGACACATCAAACACAAGGCATATCACATACTAAAAGTGATACTGCACAAATTATTATTAATAAAAATGATTACTTATTATTGTTACTGACACGATTCTAATCAAGGCTTTCCTATTCCTCTGAAAAAAATCTCCTGTTTTACTACTAACAGATAATAGTGGATGAACATACGCTTGATGTTTTGGTATCGTACTGCTCGCGGGCTCTGCGGACATGCAGTTCATGGACTCATTCAGAGGTGCTGCTTGCTCTTTCGTCACTGGTGTATGGCAATGGATCCAAATGCCAAAGGGTAAGAATTGCTGATATGGAAGCTCTCTCTTTTTTTTTTCTGGATGTTTTGTTTTATATTGTAATTAAATTTAAATTTTTAATCCTTCCAGTATCTTCCAGAACTTCTTGGACCAAGTGGGGTTCTGGTTAAGTATGGTGACCCCAAGCAGCCAGACATAGAGTTGC/-
- Variant Notes
- None
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
- DNA/cDNA Change
- 3511 bp deleted (1)
- Transcript Consequence
- None
- Protein Consequence
- None
- Flanking Sequence
-
CTGGCTGAAACTTAAAAGTCTGTGTGCGTAAACCCCATTCAAGCGTGGTACTGTGATAGGTTGCCATTCCTGAAATAACATTAATTATTTAACTGTTGGTGATATTAAAACAAAGTGGAAGCAAATGGGAACATCAGAAACTGATTGGTAAGTCACGTAAGATCACAGAGAATTTTTTGTTGAACATTTTGAAAGAAATTTTCACCAATGAGAACATTTTTACAAATAAAATGATATTTTTTTGTGTAACTTATCCCTTTCATAGACAAATGAAGAAAAAAAAGAATGCAACAAAGAACTTTTAATTTACAAACTGTCGATTCCGGTTGACATCGGATGTGGTTCCTGGTTACCATAGTAAAGCCGCTGTTTTGACCCCGTAAAGATGGCCGGTAAGGGAACGTTTTTGGGTTCGAACTCAAGTTTTTCTCCAGATGGAAAGACTCAAGGATTTAAGTCCGCATCAGCAGACACCTCAAGGTTTGTCTCTCTGTCAAAGC
CGCAGCATGAGCTCGACGGATCGGCGCAGGCGCAGATCAGCCGCTGCTTTAATAAACTCAGGTCTCTGAGCCCGTCTGACAGCGCCAGTCTGAAAACTGAGCTCAATTTAATGTTCGACGAGCTCATTTCAGAAAACTACAGCAGCAGCAACCATGACAACATCCACCCAGAGGTATGAGCATATTTATACTGCTTTTATTAATGCCTACCAGTTAATTAGACAAAAAAACACATTAAAAATTCTATAGTAGAGTGTTTCCCAACCCTGTTTCTGAAGGCACAGCAACAGTACACATTTTCAACCTCTTCCTAATCAAACACACCTGACTCAGCAGAACATAAGAAGAGAGGAAGACATCCAAAATATGTACTGTTGGTGTGCCTCCGGGAACAGGGTTGGGAAACACTGCTGTAAGTTAGTAAACATTACAGTGTTTTTGAACCGTACTATAATAAAGTCTGTTGTGGTAATTCTGTTGTTGCTGTGGTATTACCACAACTGTAGTAATGTAAATAAATGACTGTACAGTATACATTTTTCTATTTTATCTGTATTTTTTTAAATGCAATTTATTCCAGCTGCCATTAATTCCCAGCTGCCATTACTTTCTGTTTTAATTTGGGTGCTACTATTATTGGTTATTCACACTATTTAAACTAAAGGGATAGTTCAACTCAAAATGAAAATGTTGTGATTAGGGCTATACAATATATCTTTCCAGCATCAATATGTCAATGTGATCATTCGCAATAGTCACATCCATAACATACACAATGTTGAGTCTGGATTCATTCATTCAATATCCTTTGGCTTAGCTCCTTTGATCAGGAATCGCCACAGTGCAATAAACCGCCAACTTATCCAGCATATGTTATACACAGCGGATGGCCTTCCAGCGGCAACCCAGTGCTGAAAAACATCAATACACACTTATTCCCACTCAAACACTACAGCCAATTTAGACTGTGGGGGAAACCAGAGCAGCCGGAGAAAACCCATACCACACAGGGAGAACATGCAAACTCCACACAGAAATGCCAACTGACCCAGCGGGGGCTCAAACCAAGGACCTTCTTTGAGGATAGATTATAATTTATAATTTCGCAAATATTTTTATGAGGCCTGTGTGAGGGTGTAAAAGCATTCAGGCCTATGAAATTGTACTGTTTGACAAATGAATAACTTGAATTGTTGATAAAATTAAGTCTATACAGTATTATTTTACATTGATTATTATTCAACTACTGAATACCTGAATACAATTTAACTCCTAGAAGAAAAAAAAAAGTTTATTTAATCGGTATCTTTTTCTTAATTGAATTTATCTACATTTGTAGATTGTTTCTAATGTTTTATGCAGATGTACTCCCGTACAGGATCATACCAATCAATCTAAAATGATAAATTCTGTCCAAATAGTTATTCAACTCATTTAGTGAGATTGTATTTATAGCGCAATATACAGTCAGAATTATTAGCCCCCGCTTTGAATTCTTTTTTTCTTGTTTAAATATTTGCCAATCGATGTTTAACAGAGCAAAGACATTTTCACAGTAGGTCTGATAATATTTTTTTCTTCTGGAGAAAGTCTTATTTAAAACAAAAATACTATGGAAGTCAATTCCTGTTTTTTTCCAATTTCTTCAGAATATTTTTGTTGTTGTGCCTGGAAGGGCATCAGCTGTGTAAAACATATGGCAGAGTAGTTGGCGATGCATTCCCCTGTGGCGACCCCATGATAAATTAGTGACTAAGCCGAAGGAAAATTACAAAAAAATTCCCTTGTGTTAATCAGAAAAAAGTTGGTTTGAAAAACTCAAAAAAGTTTGAATTAAGTGAAGGATGAGTAAATGATGACAGATTTTATAATGCAGCATATTTTTGCCAGTGTTTTTGTTAATTAATGTGTTTGGGGATACTTTCGTTGGAATCTAACAGTGTTTATATTGAAAATTATTTGTAAAATCCTAAGTTTATTTATTTCCACTTTGACCAATTTAATGCACCACTTGTAAAAAAGAGAATTGACATATCCCAAATTTTACAACCAGTATTGTTATACAGTACATTCATGTGCATGTACATGTTTTTGATAGGTTGTGTGTGAGATTCTGGTGCAAGCAAGTCGTCTGGTTCCTCTAAGTCAAGAACATCTCATCATCAAACTCTGCCAAATGATTCATCAACTTCTAAACCAGCTACAGGTATTTACCATAGGGTTGGGTTAAATGGTCAAAACGCATCATGTTAATAATCTTGTATTTTTTATATCAGTAGATGCAGATAATTCAATTTCTTTTCATTTTGAAGGCAGATATTTTCTCCTGAGTAAAAGCTGTTTAAAAAAAGGACAATTGTTAAATAAAAGTACATTTTATTGTCAGTAAACATGTCAACCAGATGAACCTTTTAGAAATCTAAGATCAAAAGTACTAATAATGCTAAATGTTTATGAATTATTTGTATTTTTTATGAATGGATGTAATTTTAGGTTATTGAGTAAAATGATAACATCTGTAAAAAATTGTAATATTTGGAAATTAAAATGTAAATACCTAAATATTGCCAACCATAATCATATGTAAAACCACACATATAGCACCTCATTACCATAGGGTTTCAATGATAATTGTTTGAAAAATGAAAAACGCTAATATGAATGCACTGAGTATACATACTAATGCTATTGCTTAATAACAGTCACTGAATTGTTATATTACATTTATTCAATCTGCATTAATAATATGATGAAATGAATATTCCCCCACCCAGTCATTTCCCAATATCATGTTACAGTTACAGGTAAATACGTTGATCCTGCTTTCTAACTGGATTAATCATGACACAATATTTCTCTTGTATGTCAGTGCTGAGTTTACATCCTAATATGCAGTGATTTATTTAATTATTATTATTTTTAAGTTTGGAAAAAAAATTAAAATCCCATATGCGAAACAGACTGTTTTAACAACTAAATGCCATTGGCTGCTTTTTTAAAGGGGGAGGGGCTACTTTGTTTTGCACTGTTTTCATTTTACTTCAAGTTACGTGACACATCAAACACAAGGCATATCACATACTAAAAGTGATACTGCACAAATTATTATTAATAAAAATGATTACTTATTATTGTTACTGACACGATTCTAATCAAGGCTTTCCTATTCCTCTGAAAAAAATCTCCTGTTTTACTACTAACAGATAATAGTGGATGAACATACGCTTGATGTTTTGGTATCGTACTGCTCGCGGGCTCTGCGGACATGCAGTTCATGGACTCATTCAGAGGTGCTGCTTGCTCTTTCGTCACTGGTGTATGGCAATGGATCCAAATGCCAAAGGGTAAGAATTGCTGATATGGAAGCTCTCTCTTTTTTTTTTCTGGATGTTTTGTTTTATATTGTAATTAAATTTAAATTTTTAATCCTTCCAGTATCTTCCAGAACTTCTTGGACCAAGTGGGGTTCTGGTTAAGTATGGTGACCCCAAGCAGCCAGACATAGAGTTGC/- GGCGTTCAGCTGTGCATTGCATTGCTAATCTGTGTCTCAGGTCAGTTTTTGCAAATGGCTGTTATTTCAAAAAATAGATT ... - Additional Sequence
- None
Fish
Supplemental Information
- Genotyping protocol
- None