Genomic Feature

zf723

ID
ZDB-ALT-170622-8
Name
zf723
Synonyms
None
Affected Genomic Region
Construct
None
Type
Allele with one deletion (1)
Protocol
embryos treated with
Lab of Origin
Current Source
Other Pages
Notes
No data available
Genome Browser
Variants
Variant Type
Small Deletion
Variant Location
Chr 18: 41820298 - 41833702 (GRCz11) (1) Details
Nucleotide change
AACAGGTGGTTGTGGACAGTTCCTCTAACTTTCAGTTGGATATGAATCAGACTACACTTGTTTTGCCTCCTCCGAGAACAGTGTCAGCTTCTCTCGATAGAGGTTTGTTGAATTTCGACGTACCGAGCGCGACACACATGATGTCCAAAGCGGACATCTCCAAATGGATGTCCGCGGCGGACTCTCCGTTCTGGTATCAGTCCGCCAATGAAGAGCACGCTGGATACACACCCGATTGCCTTATCCCGCGCTCACAGACAGCATACACCGCATTCTCCGGGTAAGAATGACCAATTATGAATTCTAAGCAACTTCAGGCGCAATTGCATTCATGTAAAGAGGTCGAATTAAAATGGCGTTTGTAGTTGTTGAGTATTGCGCTTATAATTATATGAGGCACACACATTTAGGGCAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTATCAAAAAATGCATTTTAAAACTCTTTAAAAAAAGGTTTCATTAGTTGATATATTTACTAACATTAACTAATTATGAACAGTACTTGTACAGCATTTATTAGTCACAGTTAAACATTTAATAATGCATTATTAACACCCAAATTAATGCTTGTTAACATTAGTTAATCCATCATGTGTTAACATGAACTAACAATGATACTATGATAAACGTTTTGTTCATTGTTTGTTATTGCTGGTAAATGCATTAACTAACATTAACTTATGCAACCTTATTGTAAGTGTTACCAAATAAAATGAAGGAATATCACCTACAGAAAAATATTTATGTATTAAATCAATAAATGAATTATATGGTGCATAATGGAACAACGTCCCAGGATTTTTTGTTAGACTGTAATGCATAAACATTTGAAAGAAAACGTTAATTGTGATGAACCAGGCAACAATTTTGACACCACATGAGTTGTCGCCCCTTCAGTGAGTTCAACAGTCTGGAGTTAAAAATTAATTAATATATTTTGTTCCTTGTGCAAGCAGATTTTTTAGAATAGCTGATAAGCGTTTAAGCACGGGCTCCTCGTGAGCTCTGAGGTTGTTAATTGCTTGTATGCTTTTGTTTGTTTACTATAAATTCCATTTACCTTTAAAATAATGGTGTTAATTGAGGAATTTGTGCACTGTAAAAATATATATGATCAATAAGTCATGGCAGCATATGTTTTAGTTCATTGTAAGTTACACAAACTGTTTTAAGTCGGTTTAACATAATATGTTTAATTGACTCAAAATGTTTATTTGATTCAGCTTTAAAATGGAAGGCAACTAGGATGTTTTTTTAATTTTTGTATTTTTTTATTTTATTTTTTGTTTACAGTGTGGGGTAAATAAAAAAATATATCTTTTGAGAAACGTGCCAACTGACTTATTTTGTGCTTTCATGGAGCAACACAAATTACATAAAGAAGTAGAAAACCCTAACTGTAATATATATATATATTACATATACAGTTGAAGTCAGAATTGGGTTAAGTCTGTTTATTTTTTCACCTAATTTCTGTTTGACGGATTTTTTTTTTTTTTTTACATAATTCTTAACAGTTTTAATAACTCATTTCTAACTGATTTGTTTTATCTTTGTCGTAAGGACAGTAAATAATATTTTACTAGATATTTTTCAAGACACTTCTATACAGCTTAAAGTGACATTTAAAGGCTTAATTAGGTTATGGGGCAGGTTAGGGTAATTAGGCAAGTTATTCTATGTAGATGGTTTGTTCTGTAGACTATGGAAAAAATATAGCTTAAAGGGGCTAATAATTTAGACCTTAAAATAGAGTTTAAAATTTCAAAAACTGCTTTTATTCTAGCCGAAAAAAAGCAAATAAGACTTTTTCTATAAAAAAAAATATTAATAGACATACTGTGAAAATTCCTTGCTCTGTTAAACATAATTTGGGAAATATTAAAAAAATATTAATAATAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAAATAAATAATTAAATAAATAAATAAAAGTAAATAAATCTGACTTCAACTGTTTATACTATACAAATATTTTATAGTTTAGACTGCTTTGATAATAGTTCTGTATTCAACAACTTGTTGTTTTCAGGCTTTCGAAAAAGTGAACAGCCAAGATTTTCTGTTTTCAGTTTAGTAAACGCCCATCAACATGTAGCTGAGCAATGAATTATAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACAACATATATTCCAACGTGTATTGGAATGTTATTAGAGGCTATTTTACAAGACAACTCTATTTCAGTCACATTTAATTACTTTGCAGTTACTTAAACATTTCTTTGTTGTTTACTGGCAATTTGTTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCTTATTTATTTATGTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTCATTCATTTTTATTTATTAATTTATTTTTGTTAATTAATTAATTAATTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTGTTTGTTTATTTATTCATTCATTCATTCATTTTTATTTATTTATTTATTCATTTTTATTTTACATAAACATCCTGCTTTCAAAGTAAAACCTACAATACCACATTCTCATAACTACTTAAGTTGAATAGCTAAACATTCAAAATCATTGGAGGTAAAGACCAAAAGATCAAAACACACCGTGCAGTGGCCTGCAGTATCTGCACATCAACTAATCACAAACTGCATGCAACTAAAACAAAATGCGCTGCTATTCAAAATAAACCTCATATGATCTTTTCCATATACATTATAGTTTTGCACTGTTATGTAAGATATAATTTGATTAGAACATCCAGATGATGCTGTGTTTTGCTTACACAGGGTCCCATCTCAAAGACAGTGTGTTATCTGTGGAGATGAGGCTTCTGGTTGTCATTATGGAGTTCTGACCTGTGGAAGCTGCAAGGTGTTTTTCAAGAGAGCTGTTGAGGGTGAGCTGCAACGGAAAATGTTCATTTTAGAGGTTATTAAAGACCCACTGAACTCTGCAGATTACAAATTTGGCTCATTCCAAATGAAATGCGTTCACTTTGAATAAAAAAAAAAATCATGGCCACCATATTAAAGCGTTGTTCCAAATTGAAATGCTCAAAACTGGCTTCTTTGAAAGGCAGTTTGGAATGAAGAATTTTGAAAAATAGATCTGATAGACACTTTGGACTATAATTCTTTGAGCAGGAAAGTTGTTTGGTGTCACACTGTGTTCAATTTGGAAGGTGTCATACCTGTAATCCCTTCAGTGAGACCCTCAGAAGGGATTAGGGCAATGTTTCTCAACTACGTTCCTGGAGGACCACCAACACTGCATGTTTTGGATGTCTTCTTTGTCAGTCACACCCATTACAGGTCTTTCAGTCTCTGCTAATGAGCGAATGACCTGAATCAGGTGTGTTTGTTTAAGGAGACCAGGAAAATAAGCAGAGCTGGTGGTCCTCCAGGAACGTGGATGAGAAACATTGGATTAGGGCATAAGGGTGAGCCCTTCTGAACGGAACCTAATGATTATCTCCCATGCTGATAGATTTTAAGAACAGGAAACTACCAAAGCAGGAGGCTCGAAAAGGCTAGAAAAGAGGGTAGCTACACCACAGACATGAGCTCAAGTAGCTACTTGATTATGACAAGCTGTATTAACATTTAATCAATAAAAAAAAAATCACTATTTACACTATTTAAAGGGATAGTTTAATGCTGTCTCACGAGAAATCGTCACTTTTTGATTCAGTGGCTAATTCGTATGAATTCGTATGATCTCATTCGTACAATTAGTACGATTTGCTCGTCCCTAATGATGGTTGGGTTTAGGGGTGGAGTTTGGTGCCACACCTCCTTTTAAAAAATGTTTATGACTTGTCTCGTACCTTAAAATAAAATGTAAAATATTCTACTTTCTAAAAAAGTACTAGAAAAAAGTTGGCTGTTTACATTAGCAAGATGATGAAGATAAAAACCAGAATGGACATTTCAGCAAGACAATGATCCAAAACACAGCCAAGAAAACTCTCAAACGCTTTCAGAGAAAGAAAATCAAGCTGTGGAATGGCCCAGCCTATCACCTGACTTGAATCCAATAGAGCAGTGGTTCTCAAACTGTGGTATGTGTACCACTAGTGGTACGTGGGCTTCCTTCTAGTGGTACGCGGATGAATCAAATATGTCATATGTACATGCTACATATATTTAAATAAATTATCAAATATGGTTTATATATGAATATGATGACATAAATCCTATATTTATGAGGTCCAGGCAACATTTCCAGGTGCTGATAAACCTTTTTTCTTTTTTTTTTAATTTTTAAGAACAGTAACCTTTCATTTTTAACTTTTAAAAGCACATTTTAATTTAAATGTTCTTAATATTAGGAACTAAAATGCCCGTTTTTGAACTGTACAGAGCTTTAGCTGCTTTACTGGACCTAATACGCTACTGTATTTCAATATTGCTCATTATGGTGGTACTAGCAAAGACAACTTTTTTCTAAGGTGGTACTTGATGAAAAACGTTTGAGAACCACTGCAATAGAGAATACAAATTAAAGATCAGATTTGATAGACGAAAGCCACAGAACCATCAAGATTTTTACAATCTGTTGAAGTCTGAAAACCTCACACCCGAGTAATGCACATGACTTCGCTCTCCACATGAGAGGTGTCTTTAAGCCATCACCAAAAAGCCTGTTATATAAAGTATTAAATAAATGTTAGTAGTTCAGCACTTTCTCCTTGTGTCTTTTCATTGTTATTACACATCAGATTTTTTTGTTCTTATGTTTGTATTGCTTGGGTTTTTTATCAAAATCTGGTTCAGTTCCATGTTAACGGATCCTTTAGAAATATTATTCCCATGAAAAAAACGTGACATGTTCAATACTTATTTTCCCCTCTGCACATCTAACCAGCATTTAGATGATATTAT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Variant Notes
None
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
DNA/cDNA Change
13400 bp deleted (1)
Transcript Consequence
Exon Loss (1)
Protein Consequence
Amino Acid Deletion (1)
Sequences
Flanking Sequence
CGCATCTCGGACGATTGCGTGATTTTAAAAAAACAAAACTAACATTAGAATGGACACGGTGAACACTTCTCCCGCTGATTCCACTGGGACGGTGACGGGAATGAGTCATTTAATGGAGAAATACACGGACTTGGGTTTTGGGCACGGCAGGGTCTCGCTGCGTAATTTTGGAGACGCGGGGACTTTACGCGGCAGCGCGCCCGCATCGAGCAGCGATGCTTTGGATCACCTTTCTGCGCTGGACTTGCCTCTCGGTACCAAACCTTACACTGAACACATAGACGACTTTCTAAAAGCAGAAACCGGACAGTGGAACGCAAAGACAGATTGTCCGGAGAGTTCGTATATTAAAGATGATAAGGAGCTAAATCTCATCATGGAGCCACCGAACCCTGATTTCGACATCACCGTGTTGGAAAGCTGCTACGACTCCACCGAGAGGAAACAACAGTGTGAGTTTATTGAGGAGTCCTCAGCTTTAATCTCATCTCAAGCGATCC
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Additional Sequence
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Fish
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Genotyping protocol
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