Transcript
pddc1-002
- ID
- ZDB-TSCRIPT-131113-4109
- Name
- pddc1-002 Nomenclature History
- Previous Names
- None
- Transcript Type
- ncRNA
- Annotation Status
- retained intron
- Annotation Method
- Ensembl
- Associated With Genes
- Strain
- TU
- Non Reference Strain
- Genome Resources
- RNA Central
- None
- Note
- None
Sequence
| ENSDART00000154900 (1) [ ] (double-click sequence to select) | [Download] |
>tpe|ENSDART00000154900.2|gene_biotype:protein_coding|ENSDARG00000053609.6 transcript_biotype:retained_intron gene_symbol:gatd1 cdna chromosome:GRCz11:25:3801234:3808477:-1 GTAAATTAATTGATAAATAGCGGCCATAATGACATCTAAA CCGACTTGTCTGATTGTAGCCAGTGCTGCATCTGCAGGAG TTTCAGCCCGATCGTTCCAGCAGTGTTTTAATTTGTGCAA TCCAGTGTTTAACTTGCAGACAGCGACACCTGGGGGTAAA TCGATTGACTTTACCGGTGTGGACGATAGCACTGGCCGAT GGGTGCAAGAGTTCAGCATCAAACCCTACGCAAACCCGGC CAAACTGGAGTCTATCGATGGTCTGAAATATCTCAGATTT AAAAAAAATGATCTCTGTTGGGGGTAATGCATTACAAATA ACAGGAGTTACTTAACAAGCCGGTAGCCAGGGGTGGTTTG GGTGGTCCGAAAGAAACCCCCCCCCCCCCCCCTACTGACA AAGTGCAGAATTGGGCCTCTTCATGTGCTCATTTGTCCCA TTTTTGACTACTATGCCAGTATAAATTGTGAAAATTACTG ATAGAAGAAGGCTTTAAGACAAATGTATTGTTTTATTATT CGAGTGGCCTAATTGAGACTGAGGAAAGTTGAACGAGATG TTTTTATTTGCCTATAGGCTACACCTTTAGTTTAAAACAA GTTTTCTTTTTTTTATGATTTTTTTTATAAATTTTCTTTT TTTTTTGTATAAATGACGGATGATAATAAATTTGTATTAA AATTAAGTATTTTTTTTATAATTCTGTATTTTTTTTTAAT TTAAAAAGCTAATCTCATAACATTATTTATAAAACTGTAA TTATTTACAGTTTAAATGCAAATTTGTAAATAAATATTTG TAATAAACTAGTATGGTAAGCACTTTGTAGGAAATATTTT TAGTACATCAAAAAGTGTGGTTATGATCGTCATCTGACAA GCTGATTCAGCAATGATTAGTGCTTAAAATGCCAATACAA TGAAGTATTTACACCTCATAATTGAATCGAAAATGAGGGG AATACCTGCAAAAAAGGTCAAAATTTTCAGAAAAAAGAAC TACCTATTCCAATAAGCTGGGTACGGGCCTGCATAATAAT ATTACTTTTCTAAGTAACGAGTAAAGTAATGCATAACTTT AAAAAAAAAAGTAAGTAATAATATTTGAGTTGCTTTTAAA GATTTTGAATGCAAGTTAATTTTTAGCTTAATAAATTAAT AAAAAAATAAATTACTGAATTAAAAGGAATATTTGACCCA ACCAATAATAAAAAGTACAAAAGAGGAAACACACTGCTTT AAACTTGCATTAATCTGTATATACAGCATGTGTAGCTCTG GAGTCATGAAGTTCTCAGAAAATAACATGATCCTAAATGA TTATTTGTGGTGTTTTTTTAAGTAAATGAAGGTGGAACAG TGCGTTGTTTATTGCAGAGCTCCTCTACTAAAAAAGAAGA AAAACTGAAAGAGATCAAGCCTTAGCCAGCTAAGAAAAAG TATTGCAAAAGTAACTCAAAAGAAACATAATCCATTACTT ACCACAAAATGTAACTAAGTAACGCTACTCGTTGCTTTTT TGGGGAGTAACTCAATATTGTAAGGCAGGGGTTCTCAAAC TCGGTCCTGTAGGGCCGGTGTCCTGCAGATTTTAACTCCA ACTTGCCTCAACACACCTGCAAGGATGTTTCTAGAAAGCC TGGTGAAACCTTGATTAGCTAGCCCAGGTGTGTCTGATTG GGGCTGAAACTAAACTTTACAGGACACCGGCCCTCCAGGG CTGAGTGTGAATCCGTTGTAATGCATTACTTTCAAGAGTA ACACTGAAAATAAGTGCATTAGGAAAAATCAGGATGTGTA TTCTGTTTTAGGAGCCCGCTATCAGGCGCTGTTGATTCCC GACTGTCCCGGAGCCATGAATGATCTCGCCCACAGCGGGT CCCTCGCACGAATCCTCTCCCACTTCATTTCACAGCAAAA GCCGGTGTGTGCTGTTGGACAGGGCGTAGCGGCTCTCTGC TGTGCTACTGAGGAGCAAAAGTGGATATTCAGTAGATACA GCATGACTGGGCCTTCTGTGTTTGAGTTGGTTCGCTCTTC TGAATTTGCCAATTTGCCGCTGATTGTGGAGGATTTTATC AAAGACAATGGCGGCTCTTACACAGCCAGCATCGAGGACG CCGTTCACGTCGTCCTGGACCGCCATCTTATCACGGGGCA GAACATTCAGTCCACAACAGCAGCCGTCAATAACCTGATT CTGCTCTGTAACAACAGATAAACGCTTCAGTGGTTATGAA CAAGGGACCAAAGTTAACAAAGTTATCACGTTTTGAATTG AAAGCACACACACACTGACAAACATGAAATCATTCCATTA TCACTCCAAATATATTACATCCACATATATTTCTCCAGAG TTCAAAGAAGTGTTACACTTTCGAATAAGGTTGTATTAGT TCATGTTAGTTAGTGATTTACTAACAAGAACGATACATTT ATTATTCATTAACATTCATAAAGTTGTTCTTGTTAACTTT TAAACAACTCTAGTTGTTTAGCAAGCATGAATTTGGACTC TCCGAATGCATAAATCATGGAGATATCAATTTAAATTCGG ATGTTTTGTCTGTGTATAAAATATGAATGTGTGATCTGAA GTGAGATTCATAGATTTAGACGAGCTTTATAAATAAATAA CTGGATGCCACTGCAGTAAAAAAGCAGTGTTTTTACCTCA AAGTTGATAATAAAACAGAAATAATTAAAGTGGAATATTT CAA
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>tpe|OTTDART00000056289|OTTDARG00000039213|ZDB-GENE-051030-96 pddc1|no_translation pddc1-002 LG_ CU138509.14 Danio rerio protein_coding KNOWN, 2723 bp GTAAATTAATTGATAAATAGCGGCCATAATGACATCTAAA CCGACTTGTCTGATTGTAGCCAGTGCTGCATCTGCAGGAG TTTCAGCCCGATCGTTCCAGCAGTGTTTTAATTTGTGCAA TCCAGTGTTTAACTTGCAGACAGCGACACCTGGGGGTAAA TCGATTGACTTTACCGGTGTGGACGATAGCACTGGCCGAT GGGTGCAAGAGTTCAGCATCAAACCCTACGCAAACCCGGC CAAACTGGAGTCTATCGATGGTCTGAAATATCTCAGATTT AAAAAAAATGATCTCTGTTGGGGGTAATGCATTACAAATA ACAGGAGTTACTTAACAAGCCGGTAGCCAGGGGTGGTTTG GGTGGTCCGAAAGAAACCCCCCCCCCCCCCCCTACTGACA AAGTGCAGAATTGGGCCTCTTCATGTGCTCATTTGTCCCA TTTTTGACTACTATGCCAGTATAAATTGTGAAAATTACTG ATAGAAGAAGGCTTTAAGACAAATGTATTGTTTTATTATT CGAGTGGCCTAATTGAGACTGAGGAAAGTTGAACGAGATG TTTTTATTTGCCTATAGGCTACACCTTTAGTTTAAAACAA GTTTTCTTTTTTTTATGATTTTTTTTATAAATTTTCTTTT TTTTTTGTATAAATGACGGATGATAATAAATTTGTATTAA AATTAAGTATTTTTTTTATAATTCTGTATTTTTTTTTAAT TTAAAAAGCTAATCTCATAACATTATTTATAAAACTGTAA TTATTTACAGTTTAAATGCAAATTTGTAAATAAATATTTG TAATAAACTAGTATGGTAAGCACTTTGTAGGAAATATTTT TAGTACATCAAAAAGTGTGGTTATGATCGTCATCTGACAA GCTGATTCAGCAATGATTAGTGCTTAAAATGCCAATACAA TGAAGTATTTACACCTCATAATTGAATCGAAAATGAGGGG AATACCTGCAAAAAAGGTCAAAATTTTCAGAAAAAAGAAC TACCTATTCCAATAAGCTGGGTACGGGCCTGCATAATAAT ATTACTTTTCTAAGTAACGAGTAAAGTAATGCATAACTTT AAAAAAAAAAGTAAGTAATAATATTTGAGTTGCTTTTAAA GATTTTGAATGCAAGTTAATTTTTAGCTTAATAAATTAAT AAAAAAATAAATTACTGAATTAAAAGGAATATTTGACCCA ACCAATAATAAAAAGTACAAAAGAGGAAACACACTGCTTT AAACTTGCATTAATCTGTATATACAGCATGTGTAGCTCTG GAGTCATGAAGTTCTCAGAAAATAACATGATCCTAAATGA TTATTTGTGGTGTTTTTTTAAGTAAATGAAGGTGGAACAG TGCGTTGTTTATTGCAGAGCTCCTCTACTAAAAAAGAAGA AAAACTGAAAGAGATCAAGCCTTAGCCAGCTAAGAAAAAG TATTGCAAAAGTAACTCAAAAGAAACATAATCCATTACTT ACCACAAAATGTAACTAAGTAACGCTACTCGTTGCTTTTT TGGGGAGTAACTCAATATTGTAAGGCAGGGGTTCTCAAAC TCGGTCCTGTAGGGCCGGTGTCCTGCAGATTTTAACTCCA ACTTGCCTCAACACACCTGCAAGGATGTTTCTAGAAAGCC TGGTGAAACCTTGATTAGCTAGCCCAGGTGTGTCTGATTG GGGCTGAAACTAAACTTTACAGGACACCGGCCCTCCAGGG CTGAGTGTGAATCCGTTGTAATGCATTACTTTCAAGAGTA ACACTGAAAATAAGTGCATTAGGAAAAATCAGGATGTGTA TTCTGTTTTAGGAGCCCGCTATCAGGCGCTGTTGATTCCC GACTGTCCCGGAGCCATGAATGATCTCGCCCACAGCGGGT CCCTCGCACGAATCCTCTCCCACTTCATTTCACAGCAAAA GCCGGTGTGTGCTGTTGGACAGGGCGTAGCGGCTCTCTGC TGTGCTACTGAGGAGCAAAAGTGGATATTCAGTAGATACA GCATGACTGGGCCTTCTGTGTTTGAGTTGGTTCGCTCTTC TGAATTTGCCAATTTGCCGCTGATTGTGGAGGATTTTATC AAAGACAATGGCGGCTCTTACACAGCCAGCATCGAGGACG CCGTTCACGTCGTCCTGGACCGCCATCTTATCACGGGGCA GAACATTCAGTCCACAACAGCAGCCGTCAATAACCTGATT CTGCTCTGTAACAACAGATAAACGCTTCAGTGGTTATGAA CAAGGGACCAAAGTTAACAAAGTTATCACGTTTTGAATTG AAAGCACACACACACTGACAAACATGAAATCATTCCATTA TCACTCCAAATATATTACATCCACATATATTTCTCCAGAG TTCAAAGAAGTGTTACACTTTCGAATAAGGTTGTATTAGT TCATGTTAGTTAGTGATTTACTAACAAGAACGATACATTT ATTATTCATTAACATTCATAAAGTTGTTCTTGTTAACTTT TAAACAACTCTAGTTGTTTAGCAAGCATGAATTTGGACTC TCCGAATGCATAAATCATGGAGATATCAATTTAAATTCGG ATGTTTTGTCTGTGTATAAAATATGAATGTGTGATCTGAA GTGAGATTCATAGATTTAGACGAGCTTTATAAATAAATAA CTGGATGCCACTGCAGTAAAAAAGCAGTGTTTTTACCTCA AAGTTGATAATAAAACAGAAATAATTAAAGTGGAATATTT CAA
Segment Relationships
Protein Products
No data available
Supporting Sequences
Citations