Genomic Feature

z55

ID
ZDB-ALT-260804-3
Name
z55
Synonyms
None
Affected Genomic Region
Construct
None
Type
Allele with one delins (1)
Protocol
embryos treated with
Lab of Origin
Jurynec Lab
Current Source
Other Pages
Notes
No data available
Genome Browser
Genome Browsers
Variants
Variant Type
Delins
Variant Location
Chr 10: 35989856 - 36009061 (GRCz12tu) (1) Details
Nucleotide Change
CTTGCCCTCCTCGGGTTGTGTCTGCAGCCATACTGTGAGAATAAAGTGTCTTTGAGATCAAACATCGCTGCTGAGCAAATGGATCTCACGCAGAGAGGGCAGCAGATGGACTGGGCAGGGGAACAAGCAGCATCTCTCCAAACAGACTTTCAATGAGCCACGGCGAAAAAAAAAAACGGGACGAGGCTGATGATGGTAAATGATAGAAGGGACGCTGGGCCTTTACTCCACTGAATAAAGTGCGAAGACTTTTTCAAAGTCAATGTTTGTGTATTCATTAAAACGTAACAACCTTTGTATGGAGTCATTCTAGAGCCATATATGTATACGTGCAAAACGAAAGAAAAATTTGCAAACAAAAGTTAAAGTTTAGTGAAAAAAATTAATAAATAAATACAATTCTACAAAAATCATGTTTTTGAGAAATAAACATTTATTTTGCTAACAAAAATAAAGAACTGCAAAGGGAAAATTAAGTTTTGAGAAATAAAAATGAAATTTGCAAACAAAAAAAAGAACTGCAAATAAAATAAACCATTTGCAATAAAAAAAAATTTAAAAAAACTATGCGTACACAAAACATTTTAATAGCATTGCCTTTACAAAACCCGTCAGTCAGTTGTAATTCTCATTTGGATTTGCCTTTTAGACACCGTGAGTTTGTGATGCTGTTTTCATTTTGCACTTCACGTTTCTGCGTGTTATTACTTTGTGGCCCTGATTTGACAAGAGGGCGGAGTCAAGCGAACTTGGGTGTTTACTCAGGCCCAGACCGGCTCCCATTTAAGAGACGTCATCACCTAGAGACACAGGCTGGGTCACGCATACTTGCATCACGCAAATCGCATACTTCCATACTATATAGAACGCTAAAATCAGAATGTGAGCTGAGTAATATGTCTGCATTCATAGAATTCGAAAATCAGTATGCAAGAAGTACTTGGATTTCTGGCGAGATTTTAAGGTGTGTATTCCATGCATGCTGTGCTATCCTATGATGCCCCCAAGAAAATTCTTTTATGGGAGTGAAGTGACGCAACTTACCATGCCAAATTCTTTATTTTGTTAGCTAAATTAATTTTTATTTCTCAAATTTTTATTTTTGCTTTGTAATTATTTGGAGATTTGCATTTATTAATTTATTTATTGCTCAATACTTTATTTTTATTTTTATTTTGCAAGTATATATGGTCCTAGATTGACTCCATACCTTTGCCGCCCGATGTTTATGAATAGAACAAAGTTCAGCATTTAGTGTACCGTTTTAAATGTTTGGAGCTCTTTCAAGGGATCAGTTCACCCAAAAATGAAAATGATGTTATTAATTACTCACATTGATGTCATTTCAATCCCACTCTGACTGTTGTTCATCCTCAGAACCCAAATTAAGAGAATTGTATCTGTCTTGTCCTCCATATACTGCACTGCAATGGCCAAGATGCATTTAAAGTCCAGAAAAAAAAACCCAACAAACTTGTTTGGACACACTTTCTGAAAATAAAACAATAAATCGAATATCTGAAACAATAAAGCAACATCTGACTCAGCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGTGTAATTTTCATGTAATTCTTCAAATATCATTTATATTTATTGTGTACTATTGAAATGAACACAGAAAACACAAATAAAAACTCATTTTATTTTAGCATTTACAAAACAGAACAAAAGATCAAGTAAAGAATCCAGTTTTTAAAGAAATTGGGAATCCACACATCAGATAATAAGAATGCAAAAGAATAAATAAAGAAAAGTCCTCATGTTTAAGTATGGTAGGATATATAGGAGGCTTTTTTTCAATTGTCAATACAGACTTTGGGTTTTTATCCCTGAGCTGATTTGTGTATTTTATCCATAGGGATTGTTTTAAATCCAGACTTTTTATTATGAGTCTGGACTATGAATAAGGAGTTCTAGTGACTGTCTTCATCTTTATTTCACCTCAGTGGTTTAGCTGTTCTCTAGAGTCTGACAGAGCTGCTTCAGTCCACTGGCTGCTGCTGCTTTAGGCATAACAGCATGTTGTGGTCTCCTTCAACTCATGGTACCCCTGCTGGTTTGGCTCTGTAAAGAGACAGAGAGTTGCTGTTAGGGGCATCAGTTTTTGGATGTTGACTTTTTTGTAACATAAAGTGCACATTTGTGGATGCTAAAACTTTTTTTTTTTCTTTAGGCCTCCTTTAGAACATATTAAATTAATTCTGTGTGTATAATTTTGGTAATACAGATCACATATATTAACGATATGGCTCATCCTAAAATGAAAACTGGTTCATCATTTACTTACCCTCACACTGGCCTAAAGGTTTTGGTCAAGATAAACTGCTAAAAATGTTCTAAAGACATTGAAATATGAATCAATATCAAGTAAAGCAAACCTGTCTATTTACAAGGATAAACAGTGTGACTCATGAATTTATTTTAAGATGGATTTTACAACTTTTTAAAGACTTTCTGAGATAATGGTAATTAAAATTTTAATGTAATATTGCAGCTTGTTTTAGACCTGCTATGGATGATTAAATATGACATTTAAAACCACAAGTAGGTGGGGCTATAATGAGTTATTCAACAAAAAGTTCACTCAAATGATCTATTTACAAATGCTGATTCATTTACTAATAAATACTTTTGACTAAAGATGGGACATGGGTAAAAATTAAGTCCATGTTAATCTCGTGTTTTGTGCTGACTGTAATATTTTATTAGGCCACCAATTTAAAATGTTCTCATTGAATGGTGGGAATGGATTGAATGGATGTTATCAGTGGTTATCAGCTGATAGATAAGGGGCAGTAGGGGCCTTCTGTTGGGTTGGGTTTAGAGTTGGGGTAGGGGTAGACGTTAATAAAATACAAGTAATGAGAAATTTTATAAATAATATAAATAATTCTGTGATCAATAAAATAGGTGATTAACCATGTGGATGGATGATAACAGCCTTCTGAGCCTACCAGTGGGTGCAGAAAGCCCCTACTGGCCCAAATCTATCAGCTGATACCATTGATAACGCCCATTCAATCGAGTGATAACATTCGAATCAGCTGACCCAGGGGTATGATTAACTGTCTAAATATATATATTACTTTATCGCTTTCATCACATGAATTACAGGGTCATTCTAGTATTCTACACTCTCAAAAATAAAGATACGAGAGCTGTCACTTGGGATTTTGTTCATGATTGAGGGAAGGATGGAATGTGAGATTGCCAGGTGGATTGGAGCAGAGGCAGCAGTAATGCGGACGATGTATCGGTACGTTGTGGTAAAGAAGGAGCTGAGCCTAAAGGCAAAGCACTCGATATACCGCTCAATCTACATTCCTACTCTCAACTATGGTCATGAGCTTTGAGTCATGACCAAAAGGATAAGGTCTTGGATACAAGCAGCCGAAATGAGTTTCCTTCGCAGGGTGGCAGGGCGCACCTTTATAGATATGGTGAGGAGCTATATTATCTGGGAGGAGCTCAGAGTAGAGCCGCTGTTCCTCCACATTGAGTGAAGTCAGCTGAGGTGGCTCTGGCATTTGTTTTGGATGCCTCCTGGATACATATCTAAGGAGGTGTTCCAGGCATGTTCCACTGGGAGGAGACCTCAGGGAGGACCCAGAACACGCTGGAGGAACTATCTCTCGGCTGGCCTGGGAATGCCTTGGGATCCCACCAGAGGAGCTGGAGGAAGTGTCTGGGGAAAGGGAAGTCTGGGGTTCTCTCCTAAGACTGCTGAAAAGTGGTTGAAAATGAATGAATGAGCTGTCACTGGGATGGTACCTTTTTAAAAGCTATACACTTGTACCTAAAGGGTCCTTATTAATACCTCAAGAGTACATATTAGTACCTAAAAGGTACAAAAATGTACCTTATAAAATGTTTAAGTACAAATATATGCTTTCGAGGCACCAAAAAATTAGGTACAAATGTGTTCTTTTTAAAAGGTACCAGACCGCTTTTGTAACTTTATTTCCAAGAGTGTAACAGGCTCATACTAATTATTTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTAATTATTTATTTTTTGCAAAGTGGTAATGATGTCAGCTTAATAATGTAAAACACATAAAGCAACAATTATAATGACTTACATTAAAACTATGACATTATCAATAAATTATACATCGGTTTGGAAAGATTTGAGTTAAAGCAACCGATGGCAGAATTTTCATTTTTGGGAGAACTATTAATTTGAAAATGATCATACAGACTTCTAATTTACTAAAATAGGTAATGGAAATATGTTAGAAACCCATTTAAATTATTTCAACTATTTCACAATAGGTCATAATATACAATATGGGTTTCCACATTATATGCAAACAAATAACAAAAAAAGATGTTCAGTCACAGTAGAAACACAAATGCTCATCTTCAAATGTTAAATATCTCTCCATCACTTGATGATTTTCTGAACGTCCCAAATGACAGCCACAAAAATGGCCACCAGCAAGATGCGTTTAAGTACATAGATGAGTGTGACTGTACCGAGCGTCATGTCAGGCTCCACAAGAGGGCGCTGCTCTGGACAGTTGACTGCATTTCCTCGAGCTGCTCCCAGGACAGTCATGATGTCCACCAGATTGAGTTTTCCCTCCTCTCTGGCCTCCCTCATCTCCTCCTCCAGCTCCTCTGCGGTCTCCAGCATCTCCTCTGCCTGTTCCTCCGTCAGGACGCCTTTAGCGCCCTTCAGTCGAGGAGGTGCAAGGGAGCAGATGGCCCTTAGACGGCTGTACGACTGCAGCTGTGCTACATTGGCGCGCAAAAACAGGAGCAAAACATTGAGGTCATTAAGTGGGCAGCCCAATTTCTGACCGCTGATCAGCCCCAGTCCAGGAAGCACTTCGTACAGGGAAAGAAAGGTGGTGTCCCAGCAAAACAATCGAAGCAGGCTGAAGAGGACAATAGGAGCCAGCAGCACATAGACGGCTCCGTTAGCCACACTAAT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Variant Notes
None
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
DNA/cDNA Change
3 bp inserted / 19206 bp deleted (1)
Transcript Consequence
None
Protein Consequence
None
Sequences
Flanking Sequence
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CAAGGGTTTTTATAACATCTGAAGCCACCCAAAAATATTCACATATGGGAAACCAGTCCAGATTGTAGTTTCCAGTAGCC  ...
Additional Sequence
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Fish
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Genotyping protocol
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