Genomic Feature

mk22

ID
ZDB-ALT-190912-5
Name
mk22
Synonyms
None
Affected Genomic Region
Construct
None
Type
Allele with one delins (1)
Protocol
embryos treated with
Lab of Origin
Goll Lab
Current Source
Other Pages
Notes
No data available
Genome Browser
Variants
Variant Type
Delins
Variant Location
Chr 17: 6941915 - 6949872 (GRCz11) (1) Details
Nucleotide change
CTCTTCCCACACTCCTCACAGGTGAACAATTTATTCTCTACATAAAAACAATTTTTTAGACCACTCACTTTTTCAGATCACACTTTACAATAAGGTTTCATTAGTATATATATTTACTAACATGAACTAATTATGAACAATACTTGAATGCAGCATTTATTAGTAATAGTTTAACATTTATTATTGCATGATTAAAATCCAGATTCATGGTTGTTAACATTAGTTAATACATTGTTTCAGCAAATGGAATAATTTTTGGTGACAAGTCTTATTTTACACTCAACAATACACTCTCTGCAAATTGACAACCCTTTCGTTAGTGTTAGTGGTCGTTGCTCAATTGACTTCTTTTATAATGACGTTTTTTTTAAAGTGTAAAGCCATGACACCATATAGTGGTATAGATGTGGTGTATTTGTGTATTGGTGGAGCAGTCGGTCACCTGTGTGCAGGTTCATGTGCTCCAGCAGAGAGTGTTTGGTGGACAGGGCTTTAGAGCATACGGTGCAGATGTAGGGCTTTTCTCCAGTGTGCATCCGCTGATGAACCAGAAGAGTGTGTTTCTGCGTGAACTCCTTCCCACACACACTGCATCTGAACGGCTTCTCACCTGCATGCAAGAAAAATTTCTTTAGTTAGATTTCCATACTGACGTGTCATTGAATTCATCATAGCGTTATGTTGCATTTATTGCAAGACATCTGTTGTAAATATCTCACTGATTTGCAAGCAATCAGAATGATGTTAAGATGACTAAGATTTTATTAAAAATATCATTAAATTAAATGAAAAATGGACTAAAATTCAATAAAAAATGTACTAAAATTAAATTAAATTAAACCAAAATATTATTTAAAAAAACTTAAATTAAATAAAAAATAAATTAACATTAAAATAAAAATAACATAAAAAATTAAATTAAATTAAACCAAAATATTATTAACAATAAATAAAAATAAACTAAATTTAAATTAAATATAAAATTAAATTACAAGTAAACTCAAACAAAAATAACCTAACGTTTAATTAAAAATGAATTAAAATTGAATTAAAAATAAATTTAAATTAAATTAAATATCAAATTAAATACAAAATTAATTAATTAAATTTAACTAAAATATTATTTAAAAAAATAAATAAAAATGAACCAAAATTAAATTAAATATCAAATTAAATAAAAAATAATCAAATTAAATTAATCTAAAATATTATTAAAAATAAATAAAAATGTAATTAAAAATCAACTAAAAATAAATGAAACTAAATATAAAATCAAATTAAATAAAAAATAATCTAAAATCAAATTAAAAACATTAAATTAAATAAAAACAAAAAAAATTTAATAAACCAATTTTTATTAAAAACACACAAAAAGTCATTAAAAATAAAGCAAAATAAAATAAAATTGAATTAATTATAACTAAATATAAATTTAAATAAAAAATAAATACAGTTTTAAATTACATTAAATTAAACCAAAATATTATTAAAAATAAAGATTTTATTAAAAATAAAGCAAAAAATTATTAAATAAAATACATAGAAAATTAATTAAATTTAAAATTTTATTTAAAATAAACTAACTTTAAATTTAATTAAAAATTAACTAATTAAAAATAAACTAAACAAACTTGAATTAAAAATTAAATTAAATAAACATTAAAAAATTAAAAAATAAACATAAAATCAAATAAAAAATAAACATTAAATAAAAATAAACTCAAATTAAATAAAAAATAAACTCAAATAAATATAAAATTTTATTAAATAAAAATAAACTAAAATTAAATTAAACCAAAATACTATTAAAAATAAAGCAAAATAAACCAAAATTAAATTAAATCTAAAACTAAATAAAAAATAAACAAACAAAAAAAACTAAAACTAAACAATGTAATAAAATTTCAAATAAATGAAAATTCAAAATAAAATAAATTAAATATAAATCAAATGAAAAATTACATAAATTACAAATAAAATAAAAATTAAATAGCATAGGATTTAAATCAAGAAATAATACAAATAAAACACTGGAAAAACTCTTATCCAAACTTTAACATAAATATGAACATTTTACACAATTACATACTTGGCAAAGTAAATACATTTAGATTTTTTTTTTAGCATTATAATAATAGACCAGACTATATAATGTTAAATGAAAAATGACCTGGTTGCAGAATTAGATAAATTTATGCTTCATGCACCTTTAAATCTTTTTTTTATGTCTTAATTCTTTTACTCTATTTTCCCTTCCATGTCCCTGCTCGTCATCATCAGTGCTTTTAATAAGTTCTACAGAGGATCAGTTAAAGTGTGTTGAACCTGTATGTGTTCGCTGATGTATCTTCAAGAACAGGTGGCTTTTAAAGACTTTTCCACACTCCTCACATCTGGCCTCTGTGTCTGGATATTTCCTCCTGCGTCCTCTTTTCCCCGGCTCCTTCCCCTCCATTAGATCATCCATTCTGAAGCCCTTCAGTCTGATTGGCTGTTTGATTTTGCGTTTTCCCTCTCGTCTTCTCTCCTCTCTGGGGTTAAACTCTCCATCACTCCCATCTGTTGCAGGAGATGCAGGCTCCTCATTGACTTCCTGAATCTCCGAGCTGGATTGTGCCTGTAATTCACTTTCTGGATTTTCTTTTTGGCTTAAATCCTGGTTCTTTTTAGGACGCCCTCTTTTCCGCTTCACCTGAACATAGACATATGCTGATATTCAATAATTCAGTATTGGGGTATTTATCAAATAAATAATTACTCCTTTAAATGTGGTCAGTACCTTACCTGACAAAAGTCTTGTCGCCTATCTAAGTTTTAGGAACAACAAATATTAACTTGACTTCTAGTTGATCATTTGGTATCAGAAGTGACTTATATGAAAGGCAAAGGCCTCTGGATTATGCTTATTTTACCACAATAAAATATGATCATGACTTGATTTTTAAGTATTTAATTAGGACAGTAAGCTCTGACTTTGCTTAGACAAAAGTCTTGTCACTTAACAGAAATAATGTCCAGTATAGAATATAAAGTCATGCTGCAGTGGAAAAAAAATTAACATTGTGTATGACTCCATCATGAGCTTGAAGAACTGCATCCATACATCTCTGCAAACACTTATTAATAAAGTCATCTGGAATGGTTAAGAAAGCGTTCCTGCAGGACTCCCAGAGTTCATCAAGATTCTTTGGATTCATCTTCAATGCCTCCTCCTTCATCCTACCCCAGACATGCTCAATAATGTTAATGTCAGGTGACCGGGCTGGCCAATCCTGGAGCACCTTGACCTTCTTTGCTTTCAGGAGCTTTGATGTGGAGGCTGAAGTATGAGAAGGAGCGCTATCCTGCTGGAGAATTTGCCCTCTCCTGTGGTTTGTAATGTAATGGGCAGCACAAATGTTTTATTATCTCAGGCTGTTGATGTTGCCATCCACTCTGCAGATCTCTCCTTTACTGAATGTAACCCCAAACCATGATTTTTTCCTTCACCGAACTTGACTGATTTTTATGAGAATCTTGGGTCTAGGCAGCTTCCAGTAGGTCTTCTGCAGGATTAGTGATGATTGGGATGCAGTTCAACAGATGATTCATGGGAAAAATCTGCCTTCTGCCACTTTCCCAAATGATCAACTAGAAGTCAAGTTATTATTAGTTGCGCTTACAAATGGGAACGACGACAAGACTTTTGTCAGGTAGTGTATATATAAAATAATTACTATATTGTGATATACCAAGTGGGAGAAGTGGAGAGTCCTCTGTCTAGCTGCTCTGTCTCTGGAGGATATTGAAGATATCAATTATTATTCGGAACTTTGATAACAGGGTTTCTGCTGATGGGCTTATGCGGGGCCCTGGGATATCGGAAACTGATAAAAGCGGTCAGCGCAGCTCAAAACCCCACTAAGCTGGCCGGCTTGATTGAAACACTGATGGGTAGGGTCGCGAATCAGACTACGGTGCTTGACCGCAAACTGGAAACCATCGAGGTGAAGCTAGCGGCTCTGCAACAAATTTTGGCCAGATCGGGAGACGAGTGATGGACATTAAATATCTGTGAAATTGGCAGATATTGACCTAAAGTTGAAGTATCTTACTGTCTTTTTTTTTTTTCGGCTCTCCTCTTACTCCTGCCAGACGGCCTCGGCTGGAAGTAAACAACTCCCTGGGATAAGCAAGATAAGCGGACGCTCTGAAATTCCTGCCCCTGTCAAGGACACCTGCGGGACTCTGGACTATGCAGGCTCACACACACACAAACATATCTACAGATAAACATTCACCACCGATCCCCATCCAAACGCCTTCGTGTGCTTTTACCCACGTGGGGCGTGGGCGGGGCTGTGACTTGCGCCGGAAATGGCTGCTGGACCAGCTGGCTGCCCGCACTCAACGGACTGTTTTCCATTACCCCTGTTCCCATCCCCTCTGTCTATGTTGTGTCTTGCCGGTGTGCTTATGCTAAGATAGGGCTGTTTTTCTCCCTTTTCTCACTTTGTCCTAATCAAGGGCAAGCTGAGGGGGTGTTTTTTAGCCTAACTGTCCAAATGTATCTTTCTTCGTTTCTAAATGCTACCTCCTAAGATCTGTCTCCCCTGAAAAGTTGTTTGTGATGTTTTGTGTATGGTCTGGGGGGTCCAATTTCGCTATGCGAAAGTGTAGTGACAAATAAAGGCTTGATTGATTGATTGATTGATACCATTATCAGGATTTGAGATTACTTTAATCGTGATATGATATTTTTATATCGTGACATGATATCCTATCCCTAGCGTACATCAATATCATGATAATACAATGATAAGCTTTGGTACACTGCAAAAATGCTTTTTTTTGTCTTGTTTCTAGTCCAAATTTCTAATACTTCTTTAATCAAGAAGCATTTTCCTGGACAAGCAAAACATATTGTCTTTTTTCAAGGAATAATATGTCAGAAAGAAGTGAGTTTTATTTTAAACAAGCCAAATAATCTGCCATTGGGGTCAGGAAAATTATACAAGATT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Variant Notes
coding sequence between exon 2 and exon 5 was deleted.
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
DNA/cDNA Change
1 bp inserted / 7958 bp deleted (1)
Transcript Consequence
None
Protein Consequence
None
Sequences
Flanking Sequence
TAGTAGGAAAACAAATACCATGCAAGTTAATGGTTACTGGAATTCAACATTCTTCAAAAGATCTTGCATTCAACAGAAGAAAAAAACTCAAAAATGTAAATAAAAAAAAAAAGGGTGAAGTATCCCTTTAAATGGACTTCATCCAGTGTTTCCTATTTAATTAGTTCACAGATAACATGACTGAACAGTAAAAGTGTGTCGTTTCTGACCTGTGTATCCTGATGTGTGTCTGTAATGTGCTCTTGGCGGTGAAACACTTTCCGCAGATCTCGCATGTAAACGGCTTCTCACCTGCAGGAATAACACAGATGTTGATCCAGTAGCATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATCTGTTTATTACCAGTATGAGTTCTCAGGTGCTTCTTCAGTTGAGCCGCATCCATAAATTTATGATGACACTCAGCACATTCAGGCAAGCCTTTTCCAGTGTGGACGCGGTTATGGCTCTTTAGCTGCCGCTGCTGACTGAAG
CTCTTCCCACACTCCTCACAGGTGAACAATTTATTCTCTACATAAAAACAATTTTTTAGACCACTCACTTTTTCAGATCACACTTTACAATAAGGTTTCATTAGTATATATATTTACTAACATGAACTAATTATGAACAATACTTGAATGCAGCATTTATTAGTAATAGTTTAACATTTATTATTGCATGATTAAAATCCAGATTCATGGTTGTTAACATTAGTTAATACATTGTTTCAGCAAATGGAATAATTTTTGGTGACAAGTCTTATTTTACACTCAACAATACACTCTCTGCAAATTGACAACCCTTTCGTTAGTGTTAGTGGTCGTTGCTCAATTGACTTCTTTTATAATGACGTTTTTTTTAAAGTGTAAAGCCATGACACCATATAGTGGTATAGATGTGGTGTATTTGTGTATTGGTGGAGCAGTCGGTCACCTGTGTGCAGGTTCATGTGCTCCAGCAGAGAGTGTTTGGTGGACAGGGCTTTAGAGCATACGGTGCAGATGTAGGGCTTTTCTCCAGTGTGCATCCGCTGATGAACCAGAAGAGTGTGTTTCTGCGTGAACTCCTTCCCACACACACTGCATCTGAACGGCTTCTCACCTGCATGCAAGAAAAATTTCTTTAGTTAGATTTCCATACTGACGTGTCATTGAATTCATCATAGCGTTATGTTGCATTTATTGCAAGACATCTGTTGTAAATATCTCACTGATTTGCAAGCAATCAGAATGATGTTAAGATGACTAAGATTTTATTAAAAATATCATTAAATTAAATGAAAAATGGACTAAAATTCAATAAAAAATGTACTAAAATTAAATTAAATTAAACCAAAATATTATTTAAAAAAACTTAAATTAAATAAAAAATAAATTAACATTAAAATAAAAATAACATAAAAAATTAAATTAAATTAAACCAAAATATTATTAACAATAAATAAAAATAAACTAAATTTAAATTAAATATAAAATTAAATTACAAGTAAACTCAAACAAAAATAACCTAACGTTTAATTAAAAATGAATTAAAATTGAATTAAAAATAAATTTAAATTAAATTAAATATCAAATTAAATACAAAATTAATTAATTAAATTTAACTAAAATATTATTTAAAAAAATAAATAAAAATGAACCAAAATTAAATTAAATATCAAATTAAATAAAAAATAATCAAATTAAATTAATCTAAAATATTATTAAAAATAAATAAAAATGTAATTAAAAATCAACTAAAAATAAATGAAACTAAATATAAAATCAAATTAAATAAAAAATAATCTAAAATCAAATTAAAAACATTAAATTAAATAAAAACAAAAAAAATTTAATAAACCAATTTTTATTAAAAACACACAAAAAGTCATTAAAAATAAAGCAAAATAAAATAAAATTGAATTAATTATAACTAAATATAAATTTAAATAAAAAATAAATACAGTTTTAAATTACATTAAATTAAACCAAAATATTATTAAAAATAAAGATTTTATTAAAAATAAAGCAAAAAATTATTAAATAAAATACATAGAAAATTAATTAAATTTAAAATTTTATTTAAAATAAACTAACTTTAAATTTAATTAAAAATTAACTAATTAAAAATAAACTAAACAAACTTGAATTAAAAATTAAATTAAATAAACATTAAAAAATTAAAAAATAAACATAAAATCAAATAAAAAATAAACATTAAATAAAAATAAACTCAAATTAAATAAAAAATAAACTCAAATAAATATAAAATTTTATTAAATAAAAATAAACTAAAATTAAATTAAACCAAAATACTATTAAAAATAAAGCAAAATAAACCAAAATTAAATTAAATCTAAAACTAAATAAAAAATAAACAAACAAAAAAAACTAAAACTAAACAATGTAATAAAATTTCAAATAAATGAAAATTCAAAATAAAATAAATTAAATATAAATCAAATGAAAAATTACATAAATTACAAATAAAATAAAAATTAAATAGCATAGGATTTAAATCAAGAAATAATACAAATAAAACACTGGAAAAACTCTTATCCAAACTTTAACATAAATATGAACATTTTACACAATTACATACTTGGCAAAGTAAATACATTTAGATTTTTTTTTTAGCATTATAATAATAGACCAGACTATATAATGTTAAATGAAAAATGACCTGGTTGCAGAATTAGATAAATTTATGCTTCATGCACCTTTAAATCTTTTTTTTATGTCTTAATTCTTTTACTCTATTTTCCCTTCCATGTCCCTGCTCGTCATCATCAGTGCTTTTAATAAGTTCTACAGAGGATCAGTTAAAGTGTGTTGAACCTGTATGTGTTCGCTGATGTATCTTCAAGAACAGGTGGCTTTTAAAGACTTTTCCACACTCCTCACATCTGGCCTCTGTGTCTGGATATTTCCTCCTGCGTCCTCTTTTCCCCGGCTCCTTCCCCTCCATTAGATCATCCATTCTGAAGCCCTTCAGTCTGATTGGCTGTTTGATTTTGCGTTTTCCCTCTCGTCTTCTCTCCTCTCTGGGGTTAAACTCTCCATCACTCCCATCTGTTGCAGGAGATGCAGGCTCCTCATTGACTTCCTGAATCTCCGAGCTGGATTGTGCCTGTAATTCACTTTCTGGATTTTCTTTTTGGCTTAAATCCTGGTTCTTTTTAGGACGCCCTCTTTTCCGCTTCACCTGAACATAGACATATGCTGATATTCAATAATTCAGTATTGGGGTATTTATCAAATAAATAATTACTCCTTTAAATGTGGTCAGTACCTTACCTGACAAAAGTCTTGTCGCCTATCTAAGTTTTAGGAACAACAAATATTAACTTGACTTCTAGTTGATCATTTGGTATCAGAAGTGACTTATATGAAAGGCAAAGGCCTCTGGATTATGCTTATTTTACCACAATAAAATATGATCATGACTTGATTTTTAAGTATTTAATTAGGACAGTAAGCTCTGACTTTGCTTAGACAAAAGTCTTGTCACTTAACAGAAATAATGTCCAGTATAGAATATAAAGTCATGCTGCAGTGGAAAAAAAATTAACATTGTGTATGACTCCATCATGAGCTTGAAGAACTGCATCCATACATCTCTGCAAACACTTATTAATAAAGTCATCTGGAATGGTTAAGAAAGCGTTCCTGCAGGACTCCCAGAGTTCATCAAGATTCTTTGGATTCATCTTCAATGCCTCCTCCTTCATCCTACCCCAGACATGCTCAATAATGTTAATGTCAGGTGACCGGGCTGGCCAATCCTGGAGCACCTTGACCTTCTTTGCTTTCAGGAGCTTTGATGTGGAGGCTGAAGTATGAGAAGGAGCGCTATCCTGCTGGAGAATTTGCCCTCTCCTGTGGTTTGTAATGTAATGGGCAGCACAAATGTTTTATTATCTCAGGCTGTTGATGTTGCCATCCACTCTGCAGATCTCTCCTTTACTGAATGTAACCCCAAACCATGATTTTTTCCTTCACCGAACTTGACTGATTTTTATGAGAATCTTGGGTCTAGGCAGCTTCCAGTAGGTCTTCTGCAGGATTAGTGATGATTGGGATGCAGTTCAACAGATGATTCATGGGAAAAATCTGCCTTCTGCCACTTTCCCAAATGATCAACTAGAAGTCAAGTTATTATTAGTTGCGCTTACAAATGGGAACGACGACAAGACTTTTGTCAGGTAGTGTATATATAAAATAATTACTATATTGTGATATACCAAGTGGGAGAAGTGGAGAGTCCTCTGTCTAGCTGCTCTGTCTCTGGAGGATATTGAAGATATCAATTATTATTCGGAACTTTGATAACAGGGTTTCTGCTGATGGGCTTATGCGGGGCCCTGGGATATCGGAAACTGATAAAAGCGGTCAGCGCAGCTCAAAACCCCACTAAGCTGGCCGGCTTGATTGAAACACTGATGGGTAGGGTCGCGAATCAGACTACGGTGCTTGACCGCAAACTGGAAACCATCGAGGTGAAGCTAGCGGCTCTGCAACAAATTTTGGCCAGATCGGGAGACGAGTGATGGACATTAAATATCTGTGAAATTGGCAGATATTGACCTAAAGTTGAAGTATCTTACTGTCTTTTTTTTTTTTCGGCTCTCCTCTTACTCCTGCCAGACGGCCTCGGCTGGAAGTAAACAACTCCCTGGGATAAGCAAGATAAGCGGACGCTCTGAAATTCCTGCCCCTGTCAAGGACACCTGCGGGACTCTGGACTATGCAGGCTCACACACACACAAACATATCTACAGATAAACATTCACCACCGATCCCCATCCAAACGCCTTCGTGTGCTTTTACCCACGTGGGGCGTGGGCGGGGCTGTGACTTGCGCCGGAAATGGCTGCTGGACCAGCTGGCTGCCCGCACTCAACGGACTGTTTTCCATTACCCCTGTTCCCATCCCCTCTGTCTATGTTGTGTCTTGCCGGTGTGCTTATGCTAAGATAGGGCTGTTTTTCTCCCTTTTCTCACTTTGTCCTAATCAAGGGCAAGCTGAGGGGGTGTTTTTTAGCCTAACTGTCCAAATGTATCTTTCTTCGTTTCTAAATGCTACCTCCTAAGATCTGTCTCCCCTGAAAAGTTGTTTGTGATGTTTTGTGTATGGTCTGGGGGGTCCAATTTCGCTATGCGAAAGTGTAGTGACAAATAAAGGCTTGATTGATTGATTGATTGATACCATTATCAGGATTTGAGATTACTTTAATCGTGATATGATATTTTTATATCGTGACATGATATCCTATCCCTAGCGTACATCAATATCATGATAATACAATGATAAGCTTTGGTACACTGCAAAAATGCTTTTTTTTGTCTTGTTTCTAGTCCAAATTTCTAATACTTCTTTAATCAAGAAGCATTTTCCTGGACAAGCAAAACATATTGTCTTTTTTCAAGGAATAATATGTCAGAAAGAAGTGAGTTTTATTTTAAACAAGCCAAATAATCTGCCATTGGGGTCAGGAAAATTATACAAGATT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GGAGAGCCTTGTGCGCCTTGAAGTGCACATCTTCCACGATCAGGGTAATGTCGCAGAGCAGTTCACTTCTCCTGAGCGTG  ...
Additional Sequence
None
Fish
Supplemental Information
Genotyping protocol
None
Citations
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